Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 95,664 | G→A | 6.9% | intergenic (+56/+16) | PP_0087 → / ← PP_0088 | hypothetical protein/alkanal monooxygenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 95,664 | 0 | G | A | 6.9% | 200.5 / 4.1 | 73 | intergenic (+56/+16) | PP_0087/PP_0088 | hypothetical protein/alkanal monooxygenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/35); new base A (2/3); total (34/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.58e-01 |
AAGCTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCTTTACC > NC_002947/95516‑95812 | aaGCTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGCGTCCCCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGa > 1:360982‑M2/1‑149 (MQ=255) tGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGCTTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGagccc < 1:1019224‑M2/150‑6 (MQ=255) tCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAgg > 1:1349986/1‑150 (MQ=255) cAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAggg > 1:509197/1‑150 (MQ=255) aaGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGGTTACCCTGTCCCACGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACCAGGGt > 1:87941/1‑150 (MQ=255) aaGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGt > 2:1370142/1‑150 (MQ=255) gAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCa > 1:206286/1‑150 (MQ=255) cGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGt < 2:817316/150‑1 (MQ=255) ggcggGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAg < 1:1203762/150‑1 (MQ=255) ggCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGcc < 2:615130/150‑1 (MQ=255) aaGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAgg > 1:1199495/1‑127 (MQ=255) aaGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAgg < 2:1199495/127‑1 (MQ=255) gATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCAt < 1:545458/150‑1 (MQ=255) ttGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCa < 2:509197/150‑1 (MQ=255) gTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAg < 2:615409/148‑1 (MQ=255) gTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAg > 1:615409/1‑148 (MQ=255) tGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCatat > 2:62346/1‑150 (MQ=255) aGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGAcc < 1:1231737/150‑1 (MQ=255) aGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGAcc < 1:518415/150‑1 (MQ=255) ggCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATc > 2:491226/1‑136 (MQ=255) ggCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATc < 1:491226/136‑1 (MQ=255) cGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAAt < 2:206286/150‑1 (MQ=255) aaGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTcc > 1:1200990/1‑150 (MQ=255) aGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAggg > 2:1165483/1‑97 (MQ=255) aGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAggg < 1:1165483/97‑1 (MQ=255) aGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCg > 2:33498/1‑150 (MQ=255) ttACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATa < 2:1349986/150‑1 (MQ=255) ggCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAg < 1:1370142/150‑1 (MQ=255) tAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTa > 1:496813/1‑150 (MQ=255) ttGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAg < 2:1200990/150‑1 (MQ=255) ttGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAg < 2:496813/150‑1 (MQ=255) tCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATTTTAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCGTCAGCGTATATGAGCGAATTCGGTGCGGATGCTCATGCAGGTCACCGGTAGAGATcgacaca > 2:298658/1‑144 (MQ=255) tCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctcctt > 2:1014970‑M2/1‑47 (MQ=255) tCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctcctt < 1:1014970‑M2/96‑50 (MQ=255) tCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCgg > 1:356205/1‑70 (MQ=255) tCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCgg < 2:356205/70‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGGCTCAGCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGCACACAGGTAAAGATCAGCTCATc > 1:1156797/1‑150 (MQ=255) aTTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCa < 2:951161/94‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCa > 1:951161/1‑94 (MQ=255) cTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctccttggtaccggcctcgcagctaccaatcaccttgcccgccggctcgcctttcttgac < 2:439348‑M2/139‑104 (MQ=255) cTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctccttggtaccggcctcgcagctaccaatcaccttgcccgccggctcgcctttcttgac > 1:439348‑M2/1‑36 (MQ=255) cTTCCTCGCTCCCAACACAACCTAGGGGAGGGGGCGAGCCCGCGCCGATCGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGt < 1:307222/150‑1 (MQ=255) gctcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctcctt > 1:1075714‑M2/1‑33 (MQ=255) gctcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctcctt < 2:1075714‑M2/82‑50 (MQ=255) cgcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGt > 2:494277/3‑150 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGGCagccggcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctccttggtaccggcctcgcagctaccaatcaccttgcccgccggctcgccttttttgccgctctccagcttgtag < 1:310098‑M2/150‑120 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctccttggtaccggcctcgcagctaccaatcacctt < 1:855207‑M2/110‑80 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctccttggtaccggcctcgcagctaccaatcacctt > 2:855207‑M2/1‑31 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctccttggtaccggcctcgcagctaccaa > 2:1214548‑M2/1‑31 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctccttggtaccggcctcgcagctaccaa < 1:1214548‑M2/103‑73 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAg < 1:224139/119‑1 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAg > 2:224139/1‑119 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGtt > 1:953509/1‑150 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCAagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctccttggtaccggcctcgcagctaccaatcaccttgcccgccggctcgcctttcttgacgatctccagcttgtag < 1:335376‑M2/150‑120 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCAagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctcctt < 2:331427‑M2/80‑50 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCAagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctcctt > 1:331427‑M2/1‑31 (MQ=255) tcgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGAGCAagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctccttggtaccggcctcgcagctaccaatcaccttgcccgccggctcgcctttcttgacgatctccagcttgtag < 2:897779‑M2/150‑120 (MQ=255) cgctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctccttggtaccggcctcgcagctaccaatcaccttgcccgccggctcgcctttcttgacgatctccagcttgtagc > 2:310098‑M2/1‑30 (MQ=255) gctcCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTcc < 1:62346/150‑1 (MQ=255) ctcCCATGTCAACTTATGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCCGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGCCCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCca < 1:187369/150‑1 (MQ=255) ccAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGagcccgcaaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctccttggtaccggcctcgcagctaccaatcaccttgcccaccggcgcgcctttcttgacgatctccagcttgtagcccgtg < 2:944149‑M2/150‑126 (MQ=255) cAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCcagcag > 2:378010/1‑150 (MQ=255) aaGTCAACCTATGGGAGCGGGCAagcccgcgaatgagcaaacacattagccgcggcggtaaacaatctccttggtaccggcctcgcagctaccaatcaccttgcccgccggctcgcctttcttgacgatctccagcttgtagccagtgac > 2:335376‑M2/1‑23 (MQ=255) gTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCcagcag < 1:1173798/147‑1 (MQ=255) gTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCcagcag > 2:1173798/1‑147 (MQ=255) gTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCAc < 2:1019224/150‑1 (MQ=255) aaCCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTc > 2:639988/1‑150 (MQ=255) cTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTAc > 1:166201/1‑150 (MQ=255) cTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGCTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCa < 2:814257/113‑1 (MQ=255) cTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGCTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCa > 1:814257/1‑113 (MQ=255) gAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGc < 2:166201/150‑1 (MQ=255) gtgCGAGCCCCAGACAAGGGTCACTCGGTCTTGAGGCCCTGCTCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCttt < 1:551394/148‑1 (MQ=255) cGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCTTTAcc < 1:494277/150‑1 (MQ=255) | AAGCTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCTTTACC > NC_002947/95516‑95812 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |