| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,183,462 | A→T | 8.0% | I310N (ATT→AAT) | mltF ← | membrane‑bound lytic murein transglycosylase F |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,183,462 | 0 | A | T | 8.0% | 225.8 / 9.5 | 75 | I310N (ATT→AAT) | mltF | membrane‑bound lytic murein transglycosylase F |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/30); new base T (2/4); total (41/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.74e-01 | |||||||||||
GTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGTAGTAGCGGTC > NC_002947/1183314‑1183610 | gTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAAt > 1:1395296/1‑150 (MQ=255) tACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATg < 2:1240271/150‑1 (MQ=255) tGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTCGCCAACGCCTg < 2:19231/150‑1 (MQ=255) cgccgcCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGTCAATGGCATGGGGGCGGCGCTGACGCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGCAGCCATTGGCTACca < 1:525972/150‑1 (MQ=255) cgccgcCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGCAGCCATTGGCTACca < 1:1132774/150‑1 (MQ=255) tctGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGCAGCCATTGGCTACca < 2:632493/135‑1 (MQ=255) tctGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGCAGCCATTGGCTACca > 1:632493/1‑135 (MQ=255) tctGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCAACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGa > 1:1373266/1‑150 (MQ=255) ctGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTCCCGCATTTTACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGAc < 1:1327532/150‑1 (MQ=255) ccTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATg > 1:1186398/1‑124 (MQ=255) ccTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATg < 2:1186398/124‑1 (MQ=255) ccTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTg > 2:1157098/1‑150 (MQ=255) tCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCGGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCt > 1:96816/1‑150 (MQ=255) tCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGGGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCt > 1:114688/1‑150 (MQ=255) aGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg < 2:199213/150‑1 (MQ=255) aGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGGGCGCTGGGTCAGCATTATCAGGCGGCGGACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg < 2:685820/150‑1 (MQ=255) gTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTgg > 1:1322081/1‑150 (MQ=255) gTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTgg < 1:919626/150‑1 (MQ=255) tCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGc < 2:1404823/150‑1 (MQ=255) cGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGct > 2:1340206/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTtct < 1:1018316/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTtctc > 2:1054724/1‑150 (MQ=255) ggCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTa > 1:1017761/1‑150 (MQ=255) gTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGc > 2:696756/1‑89 (MQ=255) gTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGc < 1:696756/89‑1 (MQ=255) tGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg > 1:586022/1‑119 (MQ=255) tGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg < 2:586022/119‑1 (MQ=255) gTCAGCATCATAAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGgcgc > 2:54428/1‑150 (MQ=255) tCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGCAGCCATTGGCTACcaggaat > 1:1206850/1‑82 (MQ=38) tCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGCAGCCATTGGCTACcaggaat < 2:1206850/86‑5 (MQ=38) tcatcaGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCCATGTGTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCa < 1:1157098/150‑1 (MQ=255) tcaGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTTCTGCGTCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGt < 2:114688/150‑1 (MQ=255) aGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTTCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGc > 1:1154145/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGc < 1:54428/150‑1 (MQ=255) ggCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCt > 2:845030/1‑150 (MQ=255) ggCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCt > 2:1125107/1‑150 (MQ=255) gCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCt > 1:265422/1‑64 (MQ=255) gCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCt < 2:265422/64‑1 (MQ=255) gCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTg > 1:659825/1‑150 (MQ=255) cgcgCCCGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGCCCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTggg < 2:6890/150‑1 (MQ=255) cACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGaa < 2:1017761/150‑1 (MQ=255) aCGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAg < 1:845030/150‑1 (MQ=255) gCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg < 1:1196737/88‑1 (MQ=255) gCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg > 2:1196737/1‑88 (MQ=255) cGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGgtgt > 2:1073411/1‑150 (MQ=255) ggTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGgcgc > 2:684215/1‑64 (MQ=255) ggTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGgcgc < 1:684215/64‑1 (MQ=255) ggTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTa < 2:408133/150‑1 (MQ=255) gTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAg < 1:1340206/150‑1 (MQ=255) ttGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGgcg > 2:1340416/1‑150 (MQ=255) ttGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGgcg > 2:845282/1‑150 (MQ=255) aGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGa > 1:1346693/1‑150 (MQ=255) gTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGCCCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGACGCCGACa > 2:1002493/1‑150 (MQ=255) aCTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAg < 2:1322081/150‑1 (MQ=255) ttCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACAt > 2:59676/1‑146 (MQ=255) ttCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACAt < 1:59676/146‑1 (MQ=255) ttCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGcc > 2:505076/1‑150 (MQ=255) cGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAg > 1:145419/1‑150 (MQ=255) ccACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGCCCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCTTCTGTGTTGTCGCCGACATAGCCTAGTACGtt > 1:653711/1‑149 (MQ=255) ccACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTc > 2:654582/1‑150 (MQ=255) acaTCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGa > 1:226384/1‑150 (MQ=255) aTCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTa > 2:1088197/1‑122 (MQ=255) aTCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTa < 1:1088197/122‑1 (MQ=255) tCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACAt > 1:763861/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg > 2:1159617/1‑52 (MQ=255) ttCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg < 1:1159617/52‑1 (MQ=255) cTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCgta < 1:1340416/150‑1 (MQ=255) tGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCgtag > 1:1221754/1‑150 (MQ=255) gTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCgtagta > 1:1001925/1‑150 (MQ=255) ccAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCgca > 2:54129/1‑99 (MQ=255) ccAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGaa < 1:54129/101‑1 (MQ=255) ccAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATCGCAGTAGTAGAgg > 2:80292/1‑150 (MQ=255) ccAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACATTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAgg < 2:661898/78‑1 (MQ=255) ccAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACATTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAgg > 1:661898/1‑78 (MQ=255) cAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGTAGTAGCGGt < 1:845282/150‑1 (MQ=255) aaTGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGa < 1:703306/98‑1 (MQ=255) aaTGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGTCGTAGCGGTc > 1:18592/1‑150 (MQ=255) aaTGGCTGCCAGAAGGAGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGa > 2:703306/1‑98 (MQ=255) | GTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGCTTCTCGTACTTGGGCAGGCGCTGTTGCAGGTGCTGGGCGAAGGTGTAGGCGCCGACATAGCCAAGTACGTCGACATGGCCGTAGTAGCGGTC > NC_002947/1183314‑1183610 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |