Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,211,277 | A→G | 9.0% | V399A (GTG→GCG) ‡ | PP_1060 ← | glutamate synthase large subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,211,277 | 0 | A | G | 9.0% | 176.9 / 5.9 | 66 | V399A (GTG→GCG) ‡ | PP_1060 | glutamate synthase large subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/27); new base G (3/3); total (36/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.97e-01 |
CACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGATATGGTCGGTGAACTCCACGGGC > NC_002947/1211132‑1211423 | caccacCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTCGGGCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCt < 1:1108314/150‑1 (MQ=255) accaccAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTg < 2:852934/150‑1 (MQ=255) accaccAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTg > 2:1399666/1‑150 (MQ=255) caccaGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGTCCAGCGTGCTGGc > 1:293561/1‑150 (MQ=255) caccaGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGc > 2:800265/1‑150 (MQ=255) caGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCGTGCTGGCCAt < 2:293561/150‑1 (MQ=255) cgcgcgcTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTc > 2:63084/1‑150 (MQ=255) gcgcgcTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCGTGCTGGccattggc < 1:81662/150‑8 (MQ=255) gcgcTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGaa < 1:158313/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAg < 1:657450/150‑1 (MQ=255) tGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGgcg > 1:1191983/1‑150 (MQ=255) gcAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTgg > 1:1010713/1‑149 (MQ=255) gcAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGa < 2:75577/150‑1 (MQ=255) ttGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGcc < 2:1191983/150‑1 (MQ=255) gCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGAt < 2:663898/124‑1 (MQ=255) gCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGAt > 1:663898/1‑124 (MQ=255) gCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGc > 1:605109/1‑150 (MQ=255) cGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCt < 2:9664/150‑1 (MQ=255) gTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCGTGCTGGccattg > 2:206531/1‑119 (MQ=255) gTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCGTGCTGGCCAttg < 1:206531/124‑3 (MQ=255) tGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTgg < 2:391956/150‑1 (MQ=255) gCCACGCCGGGCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGgcg < 1:429843/150‑1 (MQ=255) gTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTg > 1:236179/1‑150 (MQ=255) tgttgGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTcgc < 2:605109/150‑1 (MQ=255) gttgGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGGCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTcgcg > 2:923849/1‑150 (MQ=255) ttgGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGgcg > 1:784255/1‑129 (MQ=255) ttgGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGgcg < 2:784255/129‑1 (MQ=255) tgGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCa < 1:688282/150‑1 (MQ=255) ggTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCAATGGCAAACATTAAGCGGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGTCGCCAATGGTACCGACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAg > 1:1169625/1‑150 (MQ=255) gtgGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGtt > 2:443784/1‑150 (MQ=255) gCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAg > 1:829410/1‑150 (MQ=255) gCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGAGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGAAAATTCGCCATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCTGGTTCAg > 1:1391083/1‑150 (MQ=255) tttGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGACGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGa > 1:241097/1‑150 (MQ=255) ttGCGACTGGATTCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGAc < 2:459633/150‑1 (MQ=255) gACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAgg > 2:8167/1‑150 (MQ=255) gACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAgg < 1:91556/150‑1 (MQ=255) gACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAgg > 1:1394587/1‑150 (MQ=255) aTGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGtgttg < 1:800265/150‑1 (MQ=255) tGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGtgttgt < 1:923849/150‑1 (MQ=255) cAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGc < 1:63084/150‑1 (MQ=255) aGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCa < 1:443784/150‑1 (MQ=255) tGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCtt > 2:1093688/1‑150 (MQ=255) tGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCtt > 1:345377/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCtt < 2:1366682/99‑1 (MQ=255) gAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCtt > 1:1366682/1‑99 (MQ=255) gAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTc > 2:843191/1‑150 (MQ=255) aaGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGtgttgt < 2:619506/130‑1 (MQ=255) aaGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGtgttgt > 1:619506/1‑130 (MQ=255) aaGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCa > 2:757501/1‑150 (MQ=255) cGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCAc < 2:345377/150‑1 (MQ=255) cGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCAc > 1:1203862/1‑150 (MQ=255) gCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGata > 1:221875/1‑150 (MQ=255) gCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGata > 1:972718/1‑150 (MQ=255) gCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGata > 1:1166147/1‑150 (MQ=255) cccAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGgt > 1:1305183/1‑106 (MQ=255) cccAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGgt < 2:1305183/106‑1 (MQ=255) cccAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGatat > 1:940120/1‑150 (MQ=255) gTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGACGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGATATGGTc < 2:241097/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGATATGGTCgg < 1:1399666/150‑1 (MQ=255) ggCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGATATGGTCGGt < 2:1166147/150‑1 (MQ=255) gcCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGATATGGTCGGTGaa < 2:940120/150‑1 (MQ=255) ccAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGATATGGTCGGTGAAc > 1:787053/1‑150 (MQ=255) atcgCCAGCGTGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGATATGGTCGGTGAACTcc > 2:693239/4‑150 (MQ=255) cAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGATATGGTCGGTGAACTCCACggg > 2:1181693/1‑150 (MQ=255) cAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGCCACGCCGCTATGGTCGGTGAACTCCACggg > 2:237413/1‑150 (MQ=255) aGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGATATGGTCGGTGAACTCCACGGgc > 2:999620/1‑150 (MQ=255) | CACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTGCCGAGTTGGCCCAGTCGGCGCCAATGGCCAGCACGCTGGCGATGTCGAAGGCGCTGACAATCTTGCCGCTGGCGCCCAGCTTGATCTTGTCGCGCAGGTTCAGGCCGACCAGGGTGTTGTGCACGAACAGCAGGCCTTCACGCAGTGGCACGCCGATATGGTCGGTGAACTCCACGGGC > NC_002947/1211132‑1211423 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |