Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,308,833 | T→A | 9.5% | L116Q (CTG→CAG) | PP_1143 → | 3‑hydroxyisobutyrate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,308,833 | 0 | T | A | 9.5% | 222.8 / 12.6 | 74 | L116Q (CTG→CAG) | PP_1143 | 3‑hydroxyisobutyrate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/35); new base A (4/3); total (36/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.07e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.23e-01 |
TGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGCTGCAGGTGCTTGGTCAGCGCGTGACGC > NC_002947/1308686‑1308979 | tgtgCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACtgt > 1:233944/1‑150 (MQ=255) tgtgCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACtgt > 2:968424/1‑150 (MQ=255) tgtgCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACtgt > 1:942893/1‑150 (MQ=255) tgtgCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCAGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACtgt > 1:331652/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCgg > 2:391238/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGc > 1:220263/1‑150 (MQ=255) tGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCa > 2:1170973/1‑150 (MQ=255) ggCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCAt > 2:1246469/1‑150 (MQ=255) ggcggTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCctggct < 1:1219909/150‑1 (MQ=255) ggcggTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCctggct < 1:659717/150‑1 (MQ=255) ggtggtGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGa < 2:580718/150‑1 (MQ=255) ggtggtGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCACCGGCCAGTTGCTGAGCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGGGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGa < 1:452211/150‑1 (MQ=255) tGAAGTGGTGTTCGACGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCGGTGGCTGGTCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCggg > 2:1123054/1‑149 (MQ=255) gAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTa > 1:1051358/1‑150 (MQ=255) aaGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTAt < 1:149068/150‑1 (MQ=255) gtTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCgg > 2:149573/1‑150 (MQ=255) cAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGt > 1:424241/1‑150 (MQ=255) cAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGt < 1:149573/150‑1 (MQ=255) ggCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGcc > 1:55269/1‑150 (MQ=255) gCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCg > 2:1052149/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCggg < 2:723206/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCggg > 1:1245794/1‑150 (MQ=255) gagcgcAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCGCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTg < 1:998077/148‑1 (MQ=255) cAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCga > 2:579747/1‑136 (MQ=255) cAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCga < 1:579747/137‑2 (MQ=255) gCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCa < 1:92345/150‑1 (MQ=255) cGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCAt < 1:968424/150‑1 (MQ=255) gCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCGGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCgg < 1:1170973/150‑1 (MQ=255) tGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCggcg > 2:25341/1‑148 (MQ=255) tCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACtgtg < 1:269558/64‑1 (MQ=255) tCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACtgtg > 2:269558/1‑64 (MQ=255) gATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACAGTGCGGcca < 2:107706/68‑3 (MQ=255) gATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACAGTGCGGcca > 1:107706/1‑66 (MQ=255) aTTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCgg > 2:315553/1‑150 (MQ=255) tttCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGc < 2:1079375/150‑1 (MQ=255) tttCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGc < 2:1079258/150‑1 (MQ=255) tcCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGAt < 1:186454/150‑1 (MQ=255) tcCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGAt > 2:739280/1‑150 (MQ=255) tcCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGACGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGAt > 2:867878/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATc < 1:1052149/150‑1 (MQ=255) cAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCt > 1:1004431/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGATGCGCGGTGAACCGGCCGATCt > 2:328938/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACAGTGCGGcca < 2:1230668/60‑3 (MQ=39) cAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACAGTGCGGcca > 1:1230668/1‑58 (MQ=39) gAACCCACCGCCACCCGTGAAACGCGTTTCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGt < 2:331652/150‑1 (MQ=255) cccACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCa < 2:570849/150‑1 (MQ=255) ccACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATTGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCAc < 1:1246469/150‑1 (MQ=255) ccACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCg < 2:250096/78‑1 (MQ=255) ccACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCg > 1:250096/1‑78 (MQ=255) ccACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCAc > 2:784068/1‑150 (MQ=255) cACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACg > 2:985379/1‑150 (MQ=255) aCCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGc > 2:1051156/1‑150 (MQ=255) cGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGcc > 2:1326932/1‑149 (MQ=255) cGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGcc < 1:1326932/149‑1 (MQ=255) ccACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGGGCACGCCCgg > 1:590578/1‑150 (MQ=255) cGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGtgctg < 2:1051358/150‑1 (MQ=255) gTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGtgctgc > 1:224251/1‑150 (MQ=255) tGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGTCGAta < 2:1179566/100‑2 (MQ=255) tGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGTCGAta > 1:1179566/1‑99 (MQ=255) tGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGCTGCa > 1:1062819/1‑150 (MQ=255) gtttGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGCTGCAGGTGCt < 2:233944/147‑1 (MQ=255) ggCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGCTGCAGGTGCt < 2:942893/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCTGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTTAAGCGTCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGCTGCAGGTGCtt < 1:1098667/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGCTGCAGGTGCtt < 2:1062819/150‑1 (MQ=255) tGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGaa > 1:813791/1‑106 (MQ=255) tGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGaa < 2:813791/106‑1 (MQ=255) gCCGAAGTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGTACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGTGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTTCTGCAGGTGCTTGGt < 2:540656/150‑1 (MQ=255) gCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGACGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGCTGCAGGTGCTTGGt < 1:867878/150‑1 (MQ=255) ccatgCCGCACAGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGCTGCAGGTGCTTGGTCAgcg > 2:983757/5‑150 (MQ=255) catgCCGCACAGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCa > 1:876114/4‑113 (MQ=255) catgCCGCACAGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCa < 2:876114/110‑1 (MQ=255) tGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGCTGCAGGTGCTTGGTCAGcgcg > 1:880053/1‑150 (MQ=255) ggCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGCTGCAGGTGCTTGGTCAGCGCGt < 2:424241/150‑1 (MQ=255) ggCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGCTGCAGCGGCTTGGTCATCGCGt < 2:590578/150‑1 (MQ=255) gCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGc > 1:1240136/1‑77 (MQ=255) gCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGc < 2:1240136/77‑1 (MQ=255) gCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCgg < 1:333558/92‑1 (MQ=255) gCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCgg > 2:333558/1‑92 (MQ=255) cGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGATGCAGGTGCTTGGTCAGCGCGTGAc > 1:294296/1‑150 (MQ=255) cACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCACGGTGCCGAGTCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGCTGCAGGTGCTTGGTCAGCGCGTGACGc < 1:674255/150‑1 (MQ=255) | TGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCTGGATGCACCGGTATCTGGCGGTACCCCCGGTGCCGAGGCGGGCACGCTGGCGATCATGGTGGGCGGTGAAGCGGCCGATCTGCAGCGTGCACGCCCGGTGCTGCAGGTGCTTGGTCAGCGCGTGACGC > NC_002947/1308686‑1308979 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |