| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,980 | A→G | 6.7% | intergenic (‑599/+32) | trmF ← / ← trmE | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein/GTPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,980 | 0 | A | G | 6.7% | 219.9 / 4.6 | 77 | intergenic (‑599/+32) | trmF/trmE | tRNA uridine 5‑carboxymethylaminomethyl modification protein/GTPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/38); new base G (3/2); total (37/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.44e-01 | |||||||||||
GCGAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAG > NC_002947/4840‑5122 | gcgAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAgcggcg > 1:1137890/1‑150 (MQ=255) cgAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCTTAGGGAgcggctt < 1:1055601/150‑3 (MQ=255) aaGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTg < 2:1063305/150‑1 (MQ=255) ggATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGc > 1:133091/1‑150 (MQ=255) ggTACATACACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGc < 2:460624/150‑1 (MQ=255) gTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCtt < 2:322753/147‑1 (MQ=255) gTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCtt > 1:322753/1‑147 (MQ=255) gTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCg > 2:604510/1‑150 (MQ=255) tACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGt < 2:133091/150‑1 (MQ=255) acaGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCtgtg > 2:622335/1‑150 (MQ=255) acaGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCtgtg < 2:118566/150‑1 (MQ=255) aTCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGC‑AAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACt < 2:859549/150‑1 (MQ=255) tGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCtgt < 2:1152360/140‑1 (MQ=255) tGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCtgt > 1:1152360/1‑140 (MQ=255) ttGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATg < 1:627118/150‑1 (MQ=255) ttGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATg > 2:627118/1‑150 (MQ=255) gagCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAg > 1:821925/1‑150 (MQ=255) agCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAg < 1:746875/100‑1 (MQ=255) agCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAg > 2:746875/1‑100 (MQ=255) cTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTg < 2:821925/150‑1 (MQ=255) tcatcaCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGACGCTCCCTTTGGAGCGACGCTTGGCCGTTCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGga > 1:389676/1‑150 (MQ=255) atcaCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGgaga < 1:487267/150‑1 (MQ=255) tcaCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAg > 1:765337/1‑93 (MQ=255) tcaCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAg < 2:765337/93‑1 (MQ=255) aCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTgg < 2:146754/144‑1 (MQ=255) aCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTgg > 1:146754/1‑144 (MQ=255) aCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGaaaa < 1:622335/150‑1 (MQ=255) aCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGaaaa > 2:533995/1‑150 (MQ=255) aCGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGaaaa > 2:1165673/1‑150 (MQ=255) gggTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATc > 2:742921/1‑150 (MQ=255) gggTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATc > 1:151155/1‑150 (MQ=255) gTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGc < 2:23953/125‑1 (MQ=255) gTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGc > 1:23953/1‑125 (MQ=255) gTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCg > 1:358851/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCa > 1:402501/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCaa > 1:301742/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAg > 1:218751/1‑150 (MQ=255) cccACAGGTGCTTTGGTCAGCAGCCTCCATTCACCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGt < 1:583996/150‑1 (MQ=255) caacaGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTc < 2:472348/148‑1 (MQ=255) aGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATcc < 1:604510/150‑1 (MQ=255) gTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGa < 1:184021/150‑1 (MQ=255) attGGTTAAGCGGCCTCCATTCACCTCCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCTCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCt < 2:521847/149‑1 (MQ=255) ttGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTg > 1:306172/1‑150 (MQ=255) ttGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTg > 2:371157/1‑150 (MQ=255) tcgggTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTg > 2:1244778/3‑150 (MQ=255) cAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTAAAGGAAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCt < 2:953799/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCtg < 2:151155/150‑1 (MQ=255) gCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCtgt < 2:218751/150‑1 (MQ=255) cTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGa > 2:1245365/1‑150 (MQ=255) cTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGa < 1:371157/150‑1 (MQ=255) tGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGc < 2:786944/89‑1 (MQ=255) tGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGc > 1:786944/1‑89 (MQ=255) cATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGAtct > 1:515206/1‑150 (MQ=255) cATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTcccc < 2:515206/150‑1 (MQ=255) tcttctGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAGTGCTCCTGTGATCTCCCCCa < 1:533995/150‑1 (MQ=255) tcttctGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTATGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCa > 2:627808/1‑150 (MQ=255) ttctGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAgc > 2:91426/1‑150 (MQ=255) gAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCtgt > 1:931848/1‑150 (MQ=255) aTTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGc < 1:742921/150‑1 (MQ=255) ttCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCtgtg > 2:80520/1‑56 (MQ=255) ttCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCtgtg < 1:80520/56‑1 (MQ=255) tCAGGGAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGTAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTg < 1:802803/150‑1 (MQ=255) aGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGc < 2:358851/150‑1 (MQ=255) aGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGc < 2:931848/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTaa < 1:553530/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTaa > 2:553530/1‑150 (MQ=255) aaGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTc < 2:389676/150‑1 (MQ=255) aGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCt < 2:206603/130‑1 (MQ=255) aGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCt > 1:206603/1‑130 (MQ=255) aGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCa < 2:301742/150‑1 (MQ=255) gCCGCTCCTTAGGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTg > 1:1122220/1‑136 (MQ=255) gCCGCTCCTTAGGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTg < 2:1122220/136‑1 (MQ=255) ccGCTCCTTAGGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGc > 2:782901/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTTAGGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGc > 2:378191/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGc > 1:372967/1‑150 (MQ=255) gCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCa < 1:300949/150‑1 (MQ=255) cTCCCTAAGGCGCGGCGCTCGGCCTTGCGTCGCTCTGCATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAg < 2:372967/150‑1 (MQ=255) aaGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTc < 1:963424/95‑1 (MQ=255) aaGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTc > 2:963424/1‑95 (MQ=255) | GCGAAAGGATGGGTACATCCACAGAGATCTGGTGCTTGTAAGAGCTTCATCACGGGTCCACCCGCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAG > NC_002947/4840‑5122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |