Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,435,829 | A→T | 8.3% | C48S (TGC→AGC) | PP_1256 ← | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,435,829 | 0 | A | T | 8.3% | 259.7 / 12.6 | 85 | C48S (TGC→AGC) | PP_1256 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/35); new base T (4/3); total (47/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.14e-01 |
GCCTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTC > NC_002947/1435681‑1435978 | gcCTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAg > 1:1221277/1‑150 (MQ=255) gcCTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAg < 1:854957/150‑1 (MQ=255) cTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGc > 1:2396/1‑150 (MQ=255) ttGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGcc < 2:843072/150‑1 (MQ=255) ttGGGCAGGCCGGTCTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGcc > 2:59927/1‑150 (MQ=255) ttGGGCAGGCCGGCTTCGATCACAGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGGGGCAATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGcc > 2:448677/1‑150 (MQ=255) tttCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGtt < 1:1280870/150‑1 (MQ=255) cGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGc < 2:364370/150‑1 (MQ=255) gATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGcc > 1:206545/1‑150 (MQ=255) aTCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCt > 1:1258504/1‑150 (MQ=255) tCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCtg > 1:628317/1‑150 (MQ=255) tCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCtg > 2:496568/1‑150 (MQ=255) gATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCTGCGCGCTGGCCTgg < 2:1398575/121‑1 (MQ=255) gATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCTGCGCGCTGGCCTgg > 1:1398575/1‑121 (MQ=255) aTCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAg > 2:1337144/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAgg < 1:123375/150‑1 (MQ=255) ggCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTAGAGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCgg > 2:48632/1‑150 (MQ=255) aTCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGc < 1:579156/144‑1 (MQ=255) aTCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGc > 2:579156/1‑144 (MQ=255) ccGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCCCGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAAc < 1:824250/150‑1 (MQ=255) gAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGt < 2:1221277/150‑1 (MQ=255) aGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTc < 1:59927/150‑1 (MQ=255) ggCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTg > 2:1252956/1‑150 (MQ=255) ccTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGAc > 1:274509/1‑150 (MQ=255) cTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGAcc > 1:592138/1‑150 (MQ=255) cTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGAcc > 2:1088817/1‑150 (MQ=255) tCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCAc < 1:402732/104‑1 (MQ=255) tCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCAc > 2:402732/1‑104 (MQ=255) gATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCggt > 1:754789/1‑150 (MQ=255) tgtgtgGCGCTGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTACTCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCCGGGCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGCGGtt > 1:39981/1‑150 (MQ=255) aTGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATg > 1:994038/1‑150 (MQ=255) ggCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTGCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATgga > 1:287093/1‑149 (MQ=255) ttCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCt > 2:1282716/1‑94 (MQ=255) ttCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCt < 1:1282716/94‑1 (MQ=255) ttCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATg > 2:717388/1‑145 (MQ=255) ttCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATg < 1:717388/145‑1 (MQ=255) ttCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATg < 1:717591/145‑1 (MQ=255) ttCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATg > 2:717591/1‑145 (MQ=255) ttCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACg > 1:604161/1‑150 (MQ=255) ttCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACg > 1:615223/1‑150 (MQ=255) ttCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACg > 2:345075/1‑150 (MQ=255) cAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGa > 2:574072/1‑150 (MQ=255) cAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGa < 2:2396/150‑1 (MQ=255) aaGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGcc > 2:1029659/1‑109 (MQ=255) aaGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGcc < 1:1029659/109‑1 (MQ=255) ctctGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTc < 1:574072/150‑1 (MQ=255) ctGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTcgc < 2:994038/150‑1 (MQ=255) ctGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCAGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTcgc < 2:39981/150‑1 (MQ=255) tGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTcgcg > 2:479089/1‑150 (MQ=255) cGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCgg > 1:137297/1‑98 (MQ=255) cGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCgg < 2:137297/98‑1 (MQ=255) gttgttCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGc > 1:1075943/1‑150 (MQ=255) tgttCGAGCGATGTTCCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCTGCTGCCg < 2:163846/150‑1 (MQ=255) gttCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCgg < 2:1075943/150‑1 (MQ=255) gAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTAc > 2:927569/1‑150 (MQ=255) aGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTAcc < 2:679175/150‑1 (MQ=255) aTGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGcc > 1:402870/1‑150 (MQ=255) tCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTgc < 2:280441/150‑2 (MQ=255) 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cAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGc > 1:900047/1‑104 (MQ=255) cAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGc < 2:900047/104‑1 (MQ=255) aGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATg > 2:782858/1‑150 (MQ=255) gcgcgcAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGt < 1:1423027/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGc > 1:455451/1‑100 (MQ=255) gcgcTGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGc < 2:455451/100‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCgg > 2:220614/1‑96 (MQ=255) gcgcAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCgg < 1:220614/96‑1 (MQ=255) cgcAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGc < 1:1337144/150‑1 (MQ=255) aGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGcctc < 1:137145/150‑1 (MQ=255) | GCCTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGATGGCTTCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTC > NC_002947/1435681‑1435978 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |