| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,445,792 | T→C | 8.2% | V470A (GTC→GCC) | PP_1263 → | fusaric acid resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,445,792 | 0 | T | C | 8.2% | 242.2 / 9.3 | 85 | V470A (GTC→GCC) | PP_1263 | fusaric acid resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/38); new base C (3/4); total (43/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.67e-01 | |||||||||||
AGAAAACCTACGACATCGCCATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGATAACGCCGAATGAGCACTTCCAGTTTGCCCGTGCGCTG > NC_002947/1445645‑1445938 | aGAAAACCTACGACATCGCCATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCa > 1:1212616/1‑150 (MQ=255) gAAAACCTACGACATCGCCATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCAc < 1:698795/150‑1 (MQ=255) aaaaCCTACGACATCGCCATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCAcc > 1:236716/1‑150 (MQ=255) gACATCGCCATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTTCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGggt < 2:262129/150‑1 (MQ=255) gACATCGCCATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGggt > 1:923737/1‑150 (MQ=255) aCATCGCCATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGCCACCACCCAgggcg > 1:202053/1‑148 (MQ=255) cGCCATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGCCACCACCCAGGgcggtga < 2:202053/150‑2 (MQ=255) gCCATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTCCCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTGGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATTCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGc < 1:1213304/150‑1 (MQ=255) gCCATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGc < 1:755204/150‑1 (MQ=255) gCCATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGACTGCCCATGCCGAGCTGGCCACCACCCAGGgcggtgac < 1:1137373/150‑3 (MQ=255) ccATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGCCACCACCCAGGgcggtgac < 1:596768/149‑3 (MQ=255) ccATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGCCACCACCCAGGgcggtgac > 2:596768/1‑147 (MQ=255) cATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCt > 2:539789/1‑150 (MQ=255) gTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGACTGCAg < 2:1175851/150‑1 (MQ=255) cgTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGTAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCg < 2:668800/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTc < 1:250576/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCTTACCTGCTAGCCGAGCGTGCTCACCGCGCAGACCTGTCTCTGCGGCCAGCAGCAGGTGCAGCGGCATTTGCAGCCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGAt < 2:236716/150‑1 (MQ=255) gCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGc < 1:144070/150‑1 (MQ=255) ttACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGCCACCACCCAGGgcggtgac > 2:992588/1‑123 (MQ=255) ttACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGCCACCACCCAGGgcggtgac < 1:992588/125‑3 (MQ=255) cGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAg < 2:277641/127‑1 (MQ=255) cGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAg > 1:277641/1‑127 (MQ=255) cTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAgg > 2:1211843/1‑130 (MQ=255) cTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAgg < 1:1211843/130‑1 (MQ=255) tACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGc < 2:566175/107‑1 (MQ=255) tACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGc > 1:566175/1‑107 (MQ=255) cTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGAtgt > 1:112020/1‑125 (MQ=255) cTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGAtgt < 2:112020/125‑1 (MQ=255) aaCGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGAtgtg < 1:104912/123‑1 (MQ=255) aaCGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGAtgtg > 2:104912/1‑123 (MQ=255) aaCGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCg > 1:1320280/1‑150 (MQ=255) aCGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGa > 2:1171666/1‑150 (MQ=255) cgcgCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGaa < 2:868357/150‑1 (MQ=255) gcAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGAc > 1:644353/1‑150 (MQ=255) gcAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGAc > 2:715699/1‑150 (MQ=255) aGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGAccc < 1:875703/150‑1 (MQ=255) gACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGAcccc < 2:461231/150‑1 (MQ=255) cTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGaa > 1:681955/1‑141 (MQ=255) cTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGaa < 2:681955/141‑1 (MQ=255) ttGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGcc > 1:416529/1‑150 (MQ=255) tGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGggtgg < 1:724697/82‑1 (MQ=255) tGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGggtgg > 2:724697/1‑82 (MQ=255) tGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCAGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCAccc > 1:24426/1‑150 (MQ=255) tCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAgg > 1:908284/1‑123 (MQ=255) tCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAgg < 2:908284/123‑1 (MQ=255) cggaacagcagcaggtgcagcagcaggtgCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTgg < 2:799258/145‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAagag < 1:1415858/110‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAagag > 2:1415858/1‑110 (MQ=255) gCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAaga > 1:351376/1‑109 (MQ=255) gCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAaga < 2:351376/109‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGa > 2:849107/1‑129 (MQ=255) gCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGa < 1:849107/129‑1 (MQ=255) ccAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGAAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTTATCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCAt > 1:218928/1‑150 (MQ=255) agcaggtgcagcagcaggtgcagGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCg > 2:1039004/1‑150 (MQ=255) gcaggtgcagcagcaggtgcagGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTcaa < 2:644353/150‑3 (MQ=255) caggtgcagcagcaggtgcagGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGAc < 1:539789/150‑1 (MQ=255) ggtgcagcagcaggtgcagGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACaa < 2:923737/150‑1 (MQ=255) gtgcagcagcaggtgcagGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACaag > 1:848849/1‑150 (MQ=255) agcagcaggtgcagGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGc < 2:416529/150‑1 (MQ=255) gcaggtgcagGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAAc > 1:477989/1‑95 (MQ=255) gcaggtgcagGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAAc < 2:477989/95‑1 (MQ=255) gcaggtgcagGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGCCCATTTTCGACAAGAAGCCgca > 2:27634/1‑148 (MQ=255) cagGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGATAACGcc > 2:453829/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCgg < 1:445479/140‑1 (MQ=255) ggCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCgg > 2:445479/1‑140 (MQ=255) cgcccgccTGATAGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGATAACGCCGAATg > 2:813193/1‑150 (MQ=255) cccgccTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGATAACGCCGAATGAg < 2:1320280/150‑1 (MQ=255) ccgccTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCg > 1:634839/1‑133 (MQ=255) ccgccTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCg < 2:634839/133‑1 (MQ=255) gccTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGATAACGCCGAATGAGCAc > 1:276030/1‑150 (MQ=255) cTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGGCATGCTGGGGGATCGGGAGGCCGTTCAGGATGTGCCGAAGGGGGAACGCCAGGAACCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGATAACGGAGAGTGAGCACtt > 1:811594/1‑150 (MQ=255) gATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGaa > 2:417044/1‑90 (MQ=255) gATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGaa < 1:417044/90‑1 (MQ=255) ccATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTAGACAAGAAGCCGGATAACGCCGAATGAGCACTTCCAGTTTg > 2:1403885/1‑150 (MQ=255) ccATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCACTTTCGACAAGAAGc < 1:1418024/119‑1 (MQ=255) ccATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCACTTTCGACAAGAAGc > 2:1418024/1‑119 (MQ=255) ccGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGATAACGCCGAATGAGCACTTCCAGTTTGCCCGt < 1:1171666/150‑1 (MQ=255) tGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGa < 2:487/112‑1 (MQ=255) tGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGa > 1:487/1‑112 (MQ=255) tGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGATAACGCCGAATGAGCACTTCCAGTTTGGCCCTgcgccg > 2:81699/1‑148 (MQ=255) tGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGATAACGCCGAATGAGCACTTCCAGTTTGCCCGTGCgctg > 1:1340110/1‑150 (MQ=255) ggTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGATAACGc < 2:317489/117‑1 (MQ=255) ggTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGATAACGc > 1:317489/1‑117 (MQ=255) gTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCa < 2:955884/35‑1 (MQ=255) gTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCa > 1:955884/1‑35 (MQ=255) | AGAAAACCTACGACATCGCCATGGTCGCGTTCCAGCGCGGCCTTACCGACTACCTGAACGTACTCAACGCGCAGACCTTGCTGTTCCGCCAGCAGCAGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCGCCCGCCTGATTGCCCATGCCGAGCTGGTCACCGCCCTGGGTGGTGGCCTGCAGGCCGGTCAGGATGTGCCGAAAGAGGAACGCCAGGCAGCACCGAAGACCCCGGCCACCCTGGCCATTTTCGACAAGAAGCCGGATAACGCCGAATGAGCACTTCCAGTTTGCCCGTGCGCTG > NC_002947/1445645‑1445938 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |