| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,471,405 | A→C | 8.8% | S477A (TCG→GCG) | alg8 ← | glycosyltransferase Alg8 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,471,405 | 0 | A | C | 8.8% | 214.5 / 11.7 | 80 | S477A (TCG→GCG) | alg8 | glycosyltransferase Alg8 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/35); new base C (3/4); total (41/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.48e-01 | |||||||||||
GCTGGGCTTCGGACTCATGCACGACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCGATGATCTGGTTGTAATAGAGAAT > NC_002947/1471257‑1471546 | gcTGGGCTTCGGACTCATGCACGACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAg > 1:103810/1‑150 (MQ=255) ggCTTCGGACTCATGCACGACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGAcc < 2:956865/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGACTCATGCACGACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCa < 1:640218/150‑1 (MQ=255) tCGGACTCATGCACGACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCTCGCGGACCatga < 1:104500/150‑4 (MQ=255) tCGGACTCATGCACGACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGgt < 2:103810/150‑1 (MQ=255) cGGACTCATGCACGACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCTCGCGGACCatgac < 1:1273544/150‑5 (MQ=255) tGCACGACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCa > 1:856860/1‑150 (MQ=255) cACGACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATGCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCAtt > 2:1415537/1‑150 (MQ=255) cACGACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCTCGCGGACCatgacc > 2:302709/1‑136 (MQ=255) cACGACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCTCGCGGACCatgacc < 1:302709/141‑6 (MQ=255) gACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCAtt < 1:1004777/147‑1 (MQ=255) gACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCAtt > 2:1004777/1‑147 (MQ=255) aTTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGtt > 2:1141185/1‑136 (MQ=255) aTTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGtt < 1:1141185/136‑1 (MQ=255) cGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTg < 1:1058359/150‑1 (MQ=255) aCGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAg > 2:948174/1‑150 (MQ=255) gTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCAGTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCAcc > 2:1242389/1‑149 (MQ=255) aTTCATGGTGGTTTGTTCATGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGTGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTAACGCt > 1:336783/1‑150 (MQ=255) ttCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGc < 2:468222/138‑1 (MQ=255) ttCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGc > 1:468222/1‑138 (MQ=255) tggtggTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGgtgt < 2:910346/112‑1 (MQ=255) tggtggTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGgtgt > 1:910346/1‑112 (MQ=255) ggtggtCTGTCCCAGTTCGACCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAggg < 2:443256/150‑1 (MQ=255) gtggtTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGc > 2:686666/1‑150 (MQ=255) gtggtTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGc < 2:565179/150‑1 (MQ=255) gTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCAtt < 2:1212208/112‑1 (MQ=255) gTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCAtt > 1:1212208/1‑112 (MQ=255) ttCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCatga < 2:950838/100‑4 (MQ=255) ttCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCatga > 1:950838/1‑97 (MQ=255) ttCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAgg < 1:497884/99‑1 (MQ=255) ttCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAgg > 2:497884/1‑99 (MQ=255) ttCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCt < 2:856860/150‑1 (MQ=255) tGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCCGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGGGTTGAACCATTGTTGAACGCTGGCGAGGCTACGCTGGCGGGCGGTGGTCTGAcg > 2:661950/1‑150 (MQ=255) gTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGATGGCAGTGGTCTGAcgc < 2:1002345/150‑1 (MQ=255) atccgatccgGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAggg > 2:857970/1‑131 (MQ=255) atccgatccgGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAggg < 1:857970/131‑1 (MQ=255) atccgatccgGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCa < 2:142986/150‑1 (MQ=255) tccgatccgGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGtt > 1:653820/1‑92 (MQ=255) tccgatccgGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGtt < 2:653820/92‑1 (MQ=255) gCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGa < 2:752345/100‑1 (MQ=255) gCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGa > 1:752345/1‑100 (MQ=255) gCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAgg > 1:238997/1‑150 (MQ=255) cTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGc < 1:676137/150‑1 (MQ=255) tCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGt > 2:144682/1‑117 (MQ=255) tCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGt < 1:144682/117‑1 (MQ=255) tCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCg > 1:330713/1‑150 (MQ=255) cacaCGACCATGAACAGCCCAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGGAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCgg < 1:661950/150‑1 (MQ=255) acacGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCAtt < 1:9127/81‑1 (MQ=255) acacGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCAtt > 2:9127/1‑81 (MQ=255) acacGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAgg < 2:966067/110‑1 (MQ=255) acacGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAgg > 1:966067/1‑110 (MQ=255) acGACCATGAACAGCACAGCAACGCAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGgaag > 1:1272969/1‑150 (MQ=255) acGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGgaag > 2:1381426/1‑150 (MQ=255) acGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGgaag > 2:845648/1‑150 (MQ=255) gACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGgaagaa < 1:845648/150‑1 (MQ=255) ccATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGAGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAaca > 2:634340/1‑150 (MQ=255) cATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAg < 1:1019945/102‑1 (MQ=255) cATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAg > 2:1019945/1‑102 (MQ=255) aTGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACg > 2:1295348/1‑150 (MQ=255) gAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGAc > 2:79851/1‑113 (MQ=255) gAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGAc < 1:79851/113‑1 (MQ=255) aaCAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGc < 2:1116773/83‑1 (MQ=255) aaCAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGc > 1:1116773/1‑83 (MQ=255) acagcaACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTtc < 1:948174/150‑1 (MQ=255) gAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTTCATCAgcgc > 2:175068/1‑150 (MQ=255) tGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCga < 1:686666/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCgatga > 2:1032051/1‑150 (MQ=255) tGGCAGCCGACAAGGTAATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTGGAACGATTGTTGAAAGATGGCGAGGTCAAGTTTGAGGGCAGTAAGGTGACGCGTGCACGACTGCTTGTAGAGGCGGAAGAATACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCgatga > 2:90473/1‑150 (MQ=255) gCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCGATGATc < 2:1272969/150‑1 (MQ=255) ccGAGAAGGTCATGGTACGCGAGGACCAGGTGTTGAACCAGTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCCTGTCGAGGCGGAAGTACACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCGATGATCTGGt > 2:87730/1‑150 (MQ=255) gagaAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCGATGATCTGGTTg > 2:1172238/1‑150 (MQ=255) aGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCGATGATCTGGTTGTAAt < 2:238997/150‑1 (MQ=255) acacctGGTCCTCGCGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCGATGATCTGGTTGTAATa < 1:537953/145‑1 (MQ=255) cacctGGTCCTCGCGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCGATGATCTGGTTGTAATag > 2:1163819/5‑150 (MQ=255) acctGGTCCTCGCGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCGATGATCTGGTTGTAATaga > 2:371468/4‑150 (MQ=255) cATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGAt > 2:1144164/1‑114 (MQ=255) cATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGAt < 1:1144164/114‑1 (MQ=255) tGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCGATGATCTGGTTGTAATAGAGaa < 1:1415537/150‑1 (MQ=255) ggTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCGATGATCTGGTTGTAATAGAGAAt < 1:1295348/150‑1 (MQ=255) gAGTACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGt > 2:42497/1‑40 (MQ=255) | GCTGGGCTTCGGACTCATGCACGACATTGACGTTCACGGCGGTATTCATGGTGGTTTGTTCCTGTTAGATCCGATCCGGGTTGGGCTCACACGACCATGAACAGCACAGCAACGAAGATGCTGGCAGCCGAGAAGGTCATGGTCCGCGAGGACCAGGTGTTGAACCATTGTTGAAAGCTGGCGAGGTCACGCTTGAGGGCAGTGGGCTGACGCGTCCACGACTGCTTGTCGAGGCGGAAGAACACGTAGATCTTCATCAGCGCGCCGATGATCTGGTTGTAATAGAGAAT > NC_002947/1471257‑1471546 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |