| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,538,610 | C→G | 5.6% | A668P (GCG→CCG) | PP_1350 ← | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,538,610 | 0 | C | G | 5.6% | 232.6 / 3.9 | 72 | A668P (GCG→CCG) | PP_1350 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/34); new base G (2/2); total (36/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.23e-01 | |||||||||||
ACCTCGCCAATCGCTTCGATCCGCGGGTGGTCCTTGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGCCCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGT > NC_002947/1538464‑1538757 | aCCTCGCCAATCGCTTCGATCCGCGGGTGGTCCTTGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGc > 2:737535/1‑150 (MQ=255) tCGCCAATCGCTTCGATCCGCGGGTGGTCCTTGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCgg > 2:425500/1‑150 (MQ=255) ccAATCGCTTCGATCCGCGGGTGGTCCTTGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCAGCGGCGGTGCCgg > 2:954189/1‑147 (MQ=255) ccAATCGCTTCGATCCGCGGGTGGTCCTTGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCAGCGGCGGTGCCgg < 1:954189/147‑1 (MQ=255) gCTTCGATCCGCGGGTGGTCCTTGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAg > 1:1410550/1‑150 (MQ=255) cTTCGATCCGCGGGTGGTCCTTGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAgg < 1:29360/150‑1 (MQ=255) cTTCGATCCGCGGGTGGTCCTTGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAgg < 2:90183/150‑1 (MQ=255) ggtggtCCTTGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAgg < 1:994225/150‑1 (MQ=255) ggtggtCCTTGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAgg < 1:985537/150‑1 (MQ=255) gtCCTTGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTaa > 2:986680/1‑150 (MQ=255) ccTTGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCACATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAg > 2:1250021/1‑150 (MQ=255) ttGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCa < 1:737535/150‑1 (MQ=255) ggCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGt < 2:390099/150‑1 (MQ=255) ggCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGt < 1:700466/150‑1 (MQ=255) tCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCtt > 2:1169333/1‑150 (MQ=255) cGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTg < 2:1410550/150‑1 (MQ=255) ggCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCt > 1:713588/1‑150 (MQ=255) ccGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTgg > 1:1376066/1‑150 (MQ=255) cccAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGa < 1:986680/150‑1 (MQ=255) cccAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGACCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGa < 1:92683/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGAtt > 2:1147804/1‑150 (MQ=255) ggTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACtt > 2:772547/1‑150 (MQ=255) gTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTc < 1:539185/150‑1 (MQ=255) cGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATc < 1:1126375/150‑1 (MQ=255) gCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCt < 1:706422/150‑1 (MQ=255) gCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCt < 2:280497/150‑1 (MQ=255) ccTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTg > 1:230189/1‑150 (MQ=255) tttGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAgg > 2:1184382/1‑114 (MQ=255) tttGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAgg < 1:1184382/114‑1 (MQ=255) tttGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGcc > 2:1202937/1‑150 (MQ=255) ttGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGccc < 2:713588/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGACTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTtgt < 1:963241/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGCTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGgttg < 2:919945/150‑1 (MQ=255) cGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGgttgtt < 1:669063/150‑1 (MQ=255) cGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGgttgtt < 2:1376066/150‑1 (MQ=255) ggTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTgg < 2:1260802/150‑1 (MQ=255) gTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGt > 1:1296757/1‑150 (MQ=255) aGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGtgatg > 2:1004697/1‑150 (MQ=255) aGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGtgatg > 2:426528/1‑150 (MQ=255) gATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTggtc < 1:1214539/103‑3 (MQ=255) gATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTggtc > 2:1214539/1‑101 (MQ=255) gATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCGATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGtgatga > 2:586456/1‑150 (MQ=255) aTCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAgg < 1:681584/82‑1 (MQ=255) aTCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAgg > 2:681584/1‑82 (MQ=255) aTCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGgt < 2:1299022/137‑1 (MQ=255) aTCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGgt > 1:1299022/1‑137 (MQ=255) aTCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGtgatgat > 2:1116340/1‑150 (MQ=255) aTCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGACGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCa > 1:264150/1‑116 (MQ=255) aTCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGACGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCa < 2:264150/116‑1 (MQ=255) gAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGt > 1:499837/1‑87 (MQ=255) gAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGt < 2:499837/87‑1 (MQ=255) cccATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAg < 1:586456/150‑1 (MQ=255) cATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGc > 1:542033/1‑150 (MQ=255) aTTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGcc > 2:781482/1‑150 (MQ=255) aTTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGcc > 2:1151459/1‑150 (MQ=255) aTTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGcc < 1:772547/150‑1 (MQ=255) tCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGtgatga < 1:391290/118‑1 (MQ=255) tCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGtgatga > 2:391290/1‑118 (MQ=255) tCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGga > 2:520459/1‑128 (MQ=255) tCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGga < 1:520459/128‑1 (MQ=255) cGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCa > 1:699365/1‑83 (MQ=255) cGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCa < 2:699365/83‑1 (MQ=255) gTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGCCCGGTAccc > 1:1325723/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGCCCGGTACCCt < 1:1147804/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGCCCGGTACCCTGGc < 2:542033/150‑1 (MQ=255) cagCCGGCAGCGGCGGTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGc < 1:938599/66‑1 (MQ=37) cagCCGGCAGCGGCGGTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGc > 2:938599/3‑68 (MQ=37) cGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGCCCGGTa > 1:1146919/1‑139 (MQ=255) cGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGCCCGGTa < 2:1146919/139‑1 (MQ=255) cGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTCGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGCCCGGTACCCTGGCCGAt > 2:705326/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCGCCTTGTGGTTGGTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCGCAGCCCGGTACCCTGGCCGATTTcc > 2:741112/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGCCCGGTACCCTGGCCGATTTcc > 2:122551/1‑150 (MQ=255) ccgcTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGCCCGGTACCCTGGCCGATTTCCTtgg > 2:1183720/1‑150 (MQ=255) cgcTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGCCCGGTACCCTGGCCGATTTCCTtggt < 1:425500/150‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGCCCGGTACCCTGGCCGATTTCCTtggt < 1:781482/150‑1 (MQ=255) | ACCTCGCCAATCGCTTCGATCCGCGGGTGGTCCTTGGGCACTCGACGGCCGTCGCCCAGGCCGGTTTCGCCTTTGTCGCCGGTGCGGGTATAGATCTTCGAAAGGCGGTAGCCCATGTCATTGCTCCGTTCTGGCCGGCACCGCCGCTGCCGGCTGGGTGAGGGGCAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGCCCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGT > NC_002947/1538464‑1538757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |