| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,538,777 | G→C | 6.3% | T612S (ACC→AGC) | PP_1350 ← | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,538,777 | 0 | G | C | 6.3% | 219.5 / 4.7 | 73 | T612S (ACC→AGC) | PP_1350 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/35); new base C (2/3); total (35/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.34e-01 | |||||||||||
CAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCGGGCGTTGGTGGATGGCCTGGGCTGCGTTCTT > NC_002947/1538629‑1538922 | cAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGt < 1:1250021/150‑1 (MQ=255) aGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTg > 2:718277/1‑150 (MQ=255) cGTAGCGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCGGCCCCATGTGGTTGGTCGTGTTTATAACCAAGGCGACCGACAGGCACAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTgcgc < 1:1169333/150‑1 (MQ=255) tAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCtt > 1:105475/1‑150 (MQ=255) gggTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTCCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGAGGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTgc > 2:1033510/1‑150 (MQ=255) ggTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTgcg > 2:1040856/1‑150 (MQ=255) ggTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGCTGCGCTTgcg > 1:981207/1‑150 (MQ=255) ggTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGCTGCGCTTgcg > 1:981848/1‑150 (MQ=255) aaaGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCAc < 1:305993/150‑1 (MQ=255) aaGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACt < 1:426528/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGCTGCGCTTGCGCACTGc < 2:981848/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGCTGCGCTTGCGCACTGc < 2:981207/150‑1 (MQ=255) cAGTTGTCTTGGCCTGGCGTGGATTGTACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGCCCGCGATGTTGAAGTAAAAGACCTCCGGTCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACTGCTCGAAGGTGCGCAAGCGCAccttc < 2:193926/150‑5 (MQ=255) gTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCg < 1:122551/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCg > 2:146681/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCa > 1:1253631/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCa > 1:146343/1‑150 (MQ=255) ttGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTGGGGGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCAt > 2:894366/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGc < 2:1253631/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGt > 2:1120516/1‑120 (MQ=255) tGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGt < 1:1120516/120‑1 (MQ=255) gCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGc < 1:146681/150‑1 (MQ=255) ttGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTc < 2:105475/150‑1 (MQ=255) cACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTc < 2:230189/150‑1 (MQ=255) ttCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGAc > 2:1148632/1‑150 (MQ=255) ttCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACACTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGAc > 2:129654/1‑150 (MQ=255) cATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGCCAGGAGCAGAAACATTGGAATCGCTAAAAT‑GTTGGCGGTGAAGAGCGCCTCGAAGGTGCGATTGCGCACTTCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTg < 1:1033510/150‑1 (MQ=255) aTCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTgg < 1:1148632/150‑1 (MQ=255) gttgttGGAGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCATGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCAGTCTGCTTCGACCTGGACTACCgggcgtgg > 1:298606/1‑143 (MQ=255) gttgGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCgg < 1:1202937/150‑1 (MQ=255) tgaggttgaAGTAGGAGTGCGACAGGCCCAGC‑CCGGTGCCCTGGCCGCTTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGTATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCCGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTa < 1:894366/144‑1 (MQ=255) gtgatgaAGTAGGCGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCAGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGc < 2:298606/149‑1 (MQ=255) gatgaAGTAGGAGACCGACAGGCCCACC‑CGGGAACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCAACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCg > 1:749868/1‑150 (MQ=255) aGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTgc > 2:1358683/1‑150 (MQ=255) gTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAg > 1:517567/1‑141 (MQ=255) gTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAg < 2:517567/141‑1 (MQ=255) gTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGCGGTGAAGAACGGCTCGAATGTGTGCTTGCGCACTGCCTCGGGTATGCCGACGCCGTTGTGTGCGAGCTGAGCTTCCGCGAATGGCGGGTTTAGCCGGGTgcg > 1:656335/1‑150 (MQ=255) ggAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGGTTAGCCGGGTGCGCAg > 1:1280080/1‑150 (MQ=255) ccGACAGGCTCCGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGa < 1:1358683/150‑1 (MQ=255) ccGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAGGTCAACAAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGa < 2:749868/150‑1 (MQ=255) aGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGGACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGCGTGATGCGt > 2:297937/1‑150 (MQ=255) gCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGTGGGTTTAGCCGGGTGCGCAgt > 1:906289/1‑139 (MQ=255) gCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGTGGGTTTAGCCGGGTGCGCAgt < 2:906289/139‑1 (MQ=255) ccAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCgg > 1:322914/1‑150 (MQ=255) tACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTgg < 2:146343/150‑1 (MQ=255) cccTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGc > 1:828642/1‑98 (MQ=255) cccTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGc < 2:828642/98‑1 (MQ=255) ccatGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGt > 1:281000/4‑150 (MQ=255) tGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGc > 1:194713/1‑150 (MQ=255) gCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCgg < 2:322914/150‑1 (MQ=255) gCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCgg < 1:129654/150‑1 (MQ=255) gCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGCTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCAGATGGCGAGTGTAGCAGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTTGGTTGCgg < 1:741112/150‑1 (MQ=255) ttCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGGGTGATGCGTCCGGCCTCCCTGGGTTGCGGGCGtag > 2:187703/1‑148 (MQ=255) ccTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCGGGCGTtggt < 1:1004697/150‑1 (MQ=255) ccTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCGGGCGTtggt < 1:1040856/150‑1 (MQ=255) cTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGa < 1:667811/71‑1 (MQ=255) cTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGa > 2:667811/1‑71 (MQ=255) cTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAgtg < 2:829833/113‑1 (MQ=255) cTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAgtg > 1:829833/1‑113 (MQ=255) cTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCGGGCGTtggtg > 1:127161/1‑150 (MQ=255) gtggtgAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCACAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCGGGCGTTGGTGGATg < 2:656335/150‑1 (MQ=255) tggtgAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGAt < 1:52375/112‑1 (MQ=255) tggtgAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGAt > 2:52375/1‑112 (MQ=255) gaagaaCGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCGGGCGTTGGTGGATGGCCTg < 1:1183720/150‑1 (MQ=255) gaaCGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGAt < 1:786436/105‑1 (MQ=255) gaaCGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGAt > 2:786436/1‑105 (MQ=255) tCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGt > 1:11564/1‑117 (MQ=255) tCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGt < 2:11564/117‑1 (MQ=255) gAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCgg > 2:62820/1‑120 (MQ=255) gAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCgg < 1:62820/120‑1 (MQ=255) gAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCGGGCGTTGGTGGATGGCCTGGGCTGCGtt > 2:56669/1‑147 (MQ=255) gAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCGGGCGTTGGTGGATGGCCTGGGCTGCGtt < 1:56669/147‑1 (MQ=255) gAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGACGTTGTATTAGAGCTGGACTTCCGCCGATGGCGTTTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCGGGCGTTGGTGGATGGCCTGGGCTGCGttctt > 1:739650/1‑150 (MQ=255) | CAGGCGTAGGGTAAAGCAGGTGCCTTGGCCTGGCGTGGATTGCACTTCCATCTGCCCCTTGTGGTTGTTGGTGATGATGAAGTAGGAGACCGACAGGCCCAGC‑CCGGTACCCTGGCCGATTTCCTTGGTGGTGAAGAACGGCTCGAAGGTGCGCTTGCGCACTGCCTCGGGCATGCCGACGCCGTTGTCTTCGACCTGGACTTCCGCCCATGGCGGGTTTAGCCGGGTGCGCAGTGTGATGCGTCCGGGCTCGCTGGGTTGCGGGCGTTGGTGGATGGCCTGGGCTGCGTTCTT > NC_002947/1538629‑1538922 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |