| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,625,249 | G→T | 5.9% | intergenic (+30/+27) | PP_1425 → / ← nadB | hypothetical protein/L‑aspartate oxidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,625,249 | 0 | G | T | 5.9% | 243.1 / 2.2 | 78 | intergenic (+30/+27) | PP_1425/nadB | hypothetical protein/L‑aspartate oxidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/42); new base T (3/2); total (34/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
GTTGGCTGGGGGAAAGCCAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAGCTC > NC_002947/1625101‑1625389 | gTTGGCTGGGGGAAAGCCAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGa < 1:187908/150‑1 (MQ=255) gggggAAAGCCAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCcgcg > 1:146747/1‑150 (MQ=255) ccgatctccAGTGTATCCACCAGGATGAGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCTCGCCCGCGaa < 2:1366101/143‑1 (MQ=255) ggAAAGCCAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAg < 2:656412/150‑1 (MQ=255) ggAAAGCCAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAg < 2:1330750/150‑1 (MQ=255) aaaGCCAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGc > 1:443129/1‑150 (MQ=255) aGCCAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCa < 1:1006058/150‑1 (MQ=255) cAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGTTTAGCTTCTTCGCGGGCTCGCCCGCGAAgagatcgg > 1:1366101/1‑143 (MQ=255) cAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGccc > 1:917827/1‑137 (MQ=255) cAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGccc < 2:917827/137‑1 (MQ=255) gtATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGcc > 2:1282073/1‑150 (MQ=255) gtATACCTCAGGATGCGCCCGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATATATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGcc < 2:684853/150‑1 (MQ=255) tataCCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCg > 2:1400617/1‑150 (MQ=255) tataCCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCACTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCg > 1:753502/1‑150 (MQ=255) ccTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGatat < 1:841719/150‑1 (MQ=255) ccTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGatat < 2:726212/150‑1 (MQ=255) cTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATc > 2:1423426/1‑150 (MQ=255) cTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATc > 1:707097/1‑150 (MQ=255) cTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGCAGGCCACCGACTTAGCT‑GTGGCCGGGTGGGCTGCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATc > 1:878714/1‑150 (MQ=255) cTCAGGATGCGCTAGGGGCTGAAGCACAGGGGCGATTGCGGGTGCGGTGGAAATTCAGCTGTCGGCGCTGGTCTGCGGTGACC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGATCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATc > 2:163551/1‑150 (MQ=255) gcgcTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTGGCTGCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCggg < 1:397313/150‑1 (MQ=255) gcgcTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCggg < 1:800546/150‑1 (MQ=255) gggggCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCCGCCTGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAg < 1:307302/149‑1 (MQ=255) aGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAg < 2:443129/150‑1 (MQ=255) agccgacgacCATCGGCGCTTTCGGGTGCGGGCGACGCGCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGGTCGAGACCGGGTTGGCTTCTTCGAGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGACATAAGACCGGGCTCAGGAt > 2:383468/5‑150 (MQ=255) tGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGc < 2:1406126/124‑1 (MQ=255) tGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGc > 1:1406126/1‑124 (MQ=255) gAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTcc > 1:416959/1‑150 (MQ=255) gCATCGGCGCTTGGGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATg < 2:455679/142‑1 (MQ=255) gCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCtt < 1:780271/150‑1 (MQ=255) gCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGGTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATg > 1:455679/1‑142 (MQ=255) cATCGGCACTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTg < 2:753502/150‑1 (MQ=255) tCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGc < 1:610269/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCGTc < 1:1423426/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCa < 2:1307417/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCa < 1:1400617/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCa < 1:817751/150‑1 (MQ=255) gggggggGCGGTTTAAGTTCACCCGGCGGCGCTGGGATGCGGTGAGC‑CGGGCAGAGATGGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGGGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCATTGGCCTCGTCCa < 1:547741/147‑1 (MQ=255) gggTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCa > 1:3050/1‑150 (MQ=255) ggTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCAt > 2:1152355/1‑150 (MQ=255) ggTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTg > 1:1297169/1‑150 (MQ=255) gTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATGAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTgg > 1:86778/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGTGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGa < 1:1216239/150‑1 (MQ=255) ttGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGa < 2:878714/150‑1 (MQ=255) aaGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATaa > 1:323003/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGCTCGAGACCCGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGCGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATc < 1:1166063/150‑1 (MQ=255) ttCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATcc > 1:815573/1‑150 (MQ=255) cAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAg < 2:707097/150‑1 (MQ=255) cAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAg < 1:1282073/150‑1 (MQ=255) aGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCa < 1:21924/95‑1 (MQ=255) aGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCa > 2:21924/1‑95 (MQ=255) cggcggCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAgtgtg > 1:369749/1‑150 (MQ=255) ggcgCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCATTGTGTAAt < 2:1010751/150‑1 (MQ=255) gCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCgg < 2:808203/150‑1 (MQ=255) ggTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCt > 2:1202709/1‑150 (MQ=255) gAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTc < 1:1202709/150‑1 (MQ=255) aGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGAGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGTCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTcc < 1:884166/150‑1 (MQ=255) ggCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGTCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTgcg > 1:1398306/1‑150 (MQ=255) tAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGc < 2:323003/150‑1 (MQ=255) aGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCa > 1:1237503/1‑150 (MQ=255) tCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTc > 2:823475/1‑91 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cGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAg > 1:395036/1‑150 (MQ=255) ttAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGatc < 2:815573/150‑1 (MQ=255) gCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGatcatc < 2:416959/150‑1 (MQ=255) ttcttcGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAg < 2:1217767/96‑1 (MQ=255) ttcttcGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAg > 1:1217767/1‑96 (MQ=255) gccttcGCGGGCTCGCCCGCGAAGACCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAg > 2:998901/3‑150 (MQ=255) cttcGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAGCt < 2:1297169/150‑1 (MQ=255) ttcGCGGGCTCGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGATTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAGCTc > 1:736389/1‑150 (MQ=255) ttcGCGGGCTCGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGATTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAGCTc < 2:736389/150‑1 (MQ=255) ggCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAGCTc > 2:171731/1‑144 (MQ=255) ggCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAGCTc < 1:171731/144‑1 (MQ=255) gAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTc < 2:629118/63‑1 (MQ=255) gAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTc > 1:629118/1‑63 (MQ=255) | GTTGGCTGGGGGAAAGCCAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGC‑CGGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAGCTC > NC_002947/1625101‑1625389 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |