| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,683,561 | T→A | 5.3% | L33Q (CTG→CAG) | PP_1478 → | xenobiotic reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,683,561 | 0 | T | A | 5.3% | 234.0 / 2.9 | 76 | L33Q (CTG→CAG) | PP_1478 | xenobiotic reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/35); new base A (2/2); total (39/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
GCACTTGAGTGTCCGGGCCGGATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTGGAACGACGACCAGATCGTCCCGTTGC > NC_002947/1683412‑1683710 | gCACTTGAGTGTCCGGGCCGGATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGACATCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAt‑‑ggcct < 1:1021615/150‑1 (MQ=255) ttGAGTGTCCGGGCCGGATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAt‑‑ggcctggcc > 1:941311/1‑150 (MQ=255) tCCGGGCCGGATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGAtt < 2:1338623/150‑1 (MQ=255) tCCGGGCCGGATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGAtt < 1:1023685/150‑1 (MQ=255) tCCGGGCCGGATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGAtt > 2:1165437/1‑150 (MQ=255) ccGGGCCGGATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGGGCCTGATGCTCGAGCCTTACGCCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCACCCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGTT‑‑GGCCAGGCCATCGAtgg < 2:19012/150‑3 (MQ=255) ccGGGCCGGATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGTT‑‑GGCCAGGCCATCGAtgg < 2:432772/150‑3 (MQ=255) gggCCGGATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGc < 1:41328/150‑1 (MQ=255) gggCCGGATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGc > 1:732461/1‑150 (MQ=255) ggCCGGATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGAtt < 1:1366522/146‑1 (MQ=255) ggCCGGATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGAtt > 2:1366522/1‑146 (MQ=255) gATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGAtt < 2:1137434/141‑1 (MQ=255) gATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGAtt > 1:1137434/1‑141 (MQ=255) tGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTgg < 1:663007/150‑1 (MQ=255) gAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGc > 2:1089/1‑150 (MQ=255) cTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCcg > 1:201886/1‑150 (MQ=255) ttgagcggTGCCGTCATGAACCTCCTGCTCGACCCTTACCACCTACGTCAGATGACGCTGCACAACCGCATCGCGGTCTCGCCAATGTGCCAGTATTGCGCCATCGTT‑‑GGCCTGGCTAACGATTGGCATCTCGTTGACTTGGGCTGCcga > 2:417773/7‑149 (MQ=255) ttGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCaa < 1:716375/119‑1 (MQ=255) ttGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCaa > 2:716375/1‑119 (MQ=255) ttGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAACCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCcgc > 2:1243047/1‑150 (MQ=255) gTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCGAGTTTCCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCgtgg < 1:1071926/150‑1 (MQ=255) gTGCCCTCATGAGCCTGCTGCGCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCgtgg > 2:1222638/1‑150 (MQ=255) cccTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCgtgggtg > 1:733678/1‑150 (MQ=255) ccTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCgtgggtgg > 1:1001226/1‑150 (MQ=255) ccTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCgtgggtgg > 1:69090/1‑150 (MQ=255) tCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGCACCCGGCCATCGAT‑‑GGCCTGTCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGgcg > 1:246557/1‑150 (MQ=255) gAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTgg > 1:596556/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCt < 1:1089/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCt > 2:490118/1‑150 (MQ=255) ctgctgCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTgg > 1:854744/1‑121 (MQ=255) ctgctgCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTgg < 2:854744/121‑1 (MQ=255) ctgctgCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGAACCCCGCACTCGATGCGGCCTTG‑‑AGCGATTTGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTg < 1:1243047/150‑1 (MQ=255) ctCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGtcacc < 2:732461/150‑3 (MQ=255) tCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGtcatca > 1:886016/1‑150 (MQ=255) cGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGgcgc < 1:1368098/135‑1 (MQ=255) cGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGgcgc > 2:1368098/1‑135 (MQ=255) cGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAg < 1:33855/150‑1 (MQ=255) cTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAg > 1:245639/1‑150 (MQ=255) ttACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTg > 1:377212/1‑136 (MQ=255) ttACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTg < 2:377212/136‑1 (MQ=255) gCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGt < 2:596556/150‑1 (MQ=255) tGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGc < 1:1345413/139‑1 (MQ=255) tGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGc > 2:1345413/1‑139 (MQ=255) cGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTACATGTTTTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATg < 1:291/150‑1 (MQ=255) gCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATgg > 2:807146/1‑150 (MQ=255) tGCCCACCCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCAATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTCGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGCCGCTGGCCTGGTCATAACCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTc < 2:246557/150‑1 (MQ=255) tGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTc < 2:941311/150‑1 (MQ=255) ccAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGcc > 1:195439/1‑87 (MQ=255) ccAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGcc < 2:195439/87‑1 (MQ=255) ccAACCGCATCGCAGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGcc > 1:642028/1‑149 (MQ=255) cAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCAt > 2:334321/1‑150 (MQ=255) aaCCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGc > 1:628231/1‑128 (MQ=255) aaCCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATc < 2:69090/150‑1 (MQ=255) aaCCGCATCGCCGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGc < 2:628231/128‑1 (MQ=255) tCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCAccgccg > 1:993763/1‑150 (MQ=255) gTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGAc > 1:370146/1‑150 (MQ=255) tcGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATg < 2:577276/127‑1 (MQ=255) tcGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATg > 1:577276/1‑127 (MQ=255) gATGGGCCAGTATTCCGCCAGCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGAGTGGCATCGCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGCGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGCCTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCtt < 2:243833/150‑1 (MQ=255) tgtgCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGtt < 2:672331/50‑1 (MQ=255) tgtgCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGtt > 1:672331/1‑50 (MQ=255) tgtgCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTtgt < 1:490118/150‑1 (MQ=255) tgCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTgg > 1:744630/1‑150 (MQ=255) ccAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTGGaa > 1:746782/1‑150 (MQ=255) ccAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTGGaa > 2:670150/1‑150 (MQ=255) cAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCCCCGCCGAAGCCCTAGGCTTGTGGAac < 1:33079/150‑1 (MQ=255) cAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTGGAac < 2:993763/150‑1 (MQ=255) tCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTGGAACgacgac < 2:733678/150‑1 (MQ=255) gCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCt < 1:1388798/66‑1 (MQ=255) gCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCt > 2:1388798/1‑66 (MQ=255) ccaaTCGTT‑‑GGCCAGGCCATCGA‑TGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTAGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTGGAACGACGACCAGa > 2:1008997/4‑150 (MQ=255) ccATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTGGAACGACGACCAGa < 2:744630/150‑1 (MQ=255) ccATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTGGAACGACGACCAGa < 2:1143749/150‑1 (MQ=255) aaTCGTT‑‑GGCCAGGCCATCGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTGGAACGACGACCAGAt > 2:641232/2‑150 (MQ=255) aTCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCTGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAACACCTAGGCTGGTGGCACGACGACCAGATc > 2:1040477/1‑150 (MQ=255) aTCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTGGAACGACGACCAGATc < 1:1222638/150‑1 (MQ=255) tCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGa < 1:837438/121‑1 (MQ=255) tCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGa > 2:837438/1‑121 (MQ=255) cctggccAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTGGAACGACGACCAGATCGTCCCGtt < 1:1165437/150‑1 (MQ=255) tggccAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTGGAACGACGACCAGATCGTCCCGTTGc > 1:251720/1‑150 (MQ=255) | GCACTTGAGTGTCCGGGCCGGATCACCATTGGAGTCCTTGGGAGGTGCCCTCATGAGCCTGCTGCTCGAGCCTTACACCCTGCGTCAGCTGACGCTGCCCAACCGCATCGCGGTCTCGCCGATGTGCCAGTATTCCGCCATCGAT‑‑GGCCTGGCCAACGATTGGCATCTCGTTCACTTGGGCTGCCGCGCCGTGGGTGGCGCTGGCCTGGTCATCAGCGAAGCCGTTGCGGTGACTGCCGATGGTCGCATCACCGCCGAAGACCTAGGCTTGTGGAACGACGACCAGATCGTCCCGTTGC > NC_002947/1683412‑1683710 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |