Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,725,151 | A→C | 8.9% | S20R (AGT→AGG) | PP_1518 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,725,151 | 0 | A | C | 8.9% | 173.1 / 7.6 | 67 | S20R (AGT→AGG) | PP_1518 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/30); new base C (2/4); total (33/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.46e-01 |
GGCAGCTCGATGCGCACGTCCGGGTTGTTGCTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGATGCGTACCGATTGCGGGTCACTGCCATCGA > NC_002947/1725002‑1725296 | ggCAGCTCGATGCGCACGTCCGGGTTGTTGCTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCa < 1:850445/150‑1 (MQ=255) aGCTCGATGCGCACGTCCGGGTTGTTGCTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTg > 1:422890/1‑150 (MQ=255) gCTCGATGCGCACGTCCGGGTTGTTGCTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTgg > 1:463173/1‑150 (MQ=255) cTCGATGCGCACGTCCGGGTTGTTGCTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGc < 2:625107/150‑1 (MQ=255) gATCCGCATTTCCGGGTTGTTGCTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGa > 2:1349173/1‑150 (MQ=255) tGCGCACGTCCGGGTTGTTGCTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGTGTCCTGGccctgt < 1:16384/150‑5 (MQ=255) tGCGCACGTCCGGGTTGTTGCTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGTGCCCTGGccctgt < 2:770813/150‑5 (MQ=255) tGCGCACGTCCGGGTTGTTGCTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGTGCCCTGGccctgt < 1:213657/150‑5 (MQ=255) gTCCGGGTTGTTGCTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGAcagcagcag > 1:284553/1‑150 (MQ=255) cGGGTTGTTGCTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGcc < 2:284553/150‑1 (MQ=255) ggTTGTTGCTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCgg > 2:385635/1‑150 (MQ=255) cTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAgg < 1:191065/150‑1 (MQ=255) gccgccTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGTGCCCTGGccct < 2:1275110/123‑3 (MQ=255) gccgccTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGTGCCCTGGccct > 1:1275110/1‑121 (MQ=255) gccgccTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGggtggt > 2:392236/1‑150 (MQ=255) gccTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTCGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAAGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGCCAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGGGaa > 2:509634/1‑150 (MQ=255) cTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCACCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAgc < 2:460925/150‑1 (MQ=255) gggTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCa < 1:1044173/150‑1 (MQ=255) ggTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAg < 2:463173/150‑1 (MQ=255) cTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGNATCTTTNAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGaa > 1:1093273/1‑150 (MQ=255) tCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAg > 1:1356860/1‑150 (MQ=255) cAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGt < 2:1356860/150‑1 (MQ=255) cTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGAt < 1:925226/150‑1 (MQ=255) tGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCa > 2:910732/1‑150 (MQ=255) ggACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACANCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCa < 1:509634/149‑1 (MQ=255) gCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAg > 1:721197/1‑150 (MQ=255) gcgcACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCt > 2:1351444/1‑150 (MQ=255) cgcACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCtt < 1:1349173/150‑1 (MQ=255) ccTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTaa < 2:422890/150‑1 (MQ=255) ccTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTaa > 1:935429/1‑150 (MQ=255) cTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGaa < 1:687427/112‑1 (MQ=255) cTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGaa > 2:687427/1‑112 (MQ=255) cTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGaa < 1:458807/122‑1 (MQ=255) cTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGaa > 2:458807/1‑122 (MQ=255) gTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGAt > 1:468854/1‑150 (MQ=255) 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aGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAg < 1:910732/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGc < 1:385635/150‑1 (MQ=255) ggTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCCTGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACATg < 1:392236/150‑1 (MQ=255) ggTGGCATCATTCGGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTg < 2:1105500/150‑1 (MQ=255) gCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGggtggt < 1:516410/77‑1 (MQ=255) gCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGggtggt > 2:516410/1‑77 (MQ=255) tttCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCtt > 2:560632/1‑150 (MQ=255) tCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGAGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGa > 1:406116/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGACGGCCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGAt < 1:93628/150‑1 (MQ=255) tGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGATg > 2:512664/1‑150 (MQ=255) gCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAAc > 2:597062/1‑108 (MQ=255) gCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAAc < 1:597062/108‑1 (MQ=255) tGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGAt > 2:1024644/1‑85 (MQ=255) tGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGAt < 1:1024644/85‑1 (MQ=255) ggTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGATGCgagatc > 1:155211/1‑145 (MQ=255) gCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGATGCGTACCGATTg > 2:365722/1‑150 (MQ=255) ccAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGATGCGTACCGATTGCg > 1:589592/1‑150 (MQ=255) aCAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCAGAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGATGCGTACCGATTGCGGGTCAc > 1:1362328/1‑150 (MQ=255) cagggccagggcACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGATGCGTACCGATTGCGGGTCACt < 2:589592/150‑1 (MQ=255) gggccagggcACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTc < 1:223999/118‑1 (MQ=255) gggccagggcACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTc > 2:223999/1‑118 (MQ=255) aaccagtgcCCTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGATGCGTACCGATTGCGGGTCACTGcc > 1:1119194/3‑150 (MQ=255) cagggcACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATc < 1:1003740/64‑1 (MQ=255) cagggcACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATc > 2:1003740/1‑64 (MQ=255) cagggcACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGATGCGTACCGATTGCGGGTCACTGCCATc < 2:58494/150‑1 (MQ=255) cagggcACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTCAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGATGCGTACCGATTGCGGGTCACTGCCATc < 1:512664/150‑1 (MQ=255) agggcACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGATGCGTACCGATTGCGGGTCACTGCCATCg > 1:1060703/1‑150 (MQ=255) gggcACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGATGCGTACCGATTGCGGGTCACTGCCATCGa < 1:365722/150‑1 (MQ=255) | GGCAGCTCGATGCGCACGTCCGGGTTGTTGCTGAAGCCGCCTGGGGTGCTCAGTTGCTTGACGGCCAGTTGCGCACCTTGGGTCAGGGCATCTTTCAGGCCGCCGGTGGCATCTTTCTGGCTGAGGTCGCCCAGCGACAGGGCCAGGGCACTGGCCGACAGCAGCAGGCCGGCGCACAGGGTGGTGAAGCGCAGGGAAGTGCGGATCATGAAGCTTTCCTTGTAAACGGATGAGTACGGGTATCAGCGAACCTGGTCTACCTTGATGCGTACCGATTGCGGGTCACTGCCATCGA > NC_002947/1725002‑1725296 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |