| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,731,927 | A→T | 6.8% | L662Q (CTG→CAG) | PP_1526 ← | beta‑(1‑3)‑glucosyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,731,927 | 0 | A | T | 6.8% | 223.7 / 7.2 | 73 | L662Q (CTG→CAG) | PP_1526 | beta‑(1‑3)‑glucosyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/37); new base T (2/3); total (33/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.21e-01 | |||||||||||
CGACCCGATGCGGCACGATGATCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTGGGCGTAGGCGGCGGACAGGCCTTTCTC > NC_002947/1731778‑1732069 | cGACCCGATGCGGCACGATGATCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCgca > 2:328202/1‑150 (MQ=255) aCCCGATGCGGCACGATGATCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCgcagc > 1:828364/1‑150 (MQ=255) cccGATGCGGCACGATGATCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCgcagca > 1:207321/1‑150 (MQ=255) cGATGCGGCACGATGATCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCagcagc < 1:494825/150‑1 (MQ=255) gATGCGGCACGATGATCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAgcg > 2:1044396/1‑150 (MQ=255) gCACGATGATCATCGCCGCCGACCACAACCGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCgc > 2:384409/1‑149 (MQ=255) gCACGATGATCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCgg > 2:449204/1‑150 (MQ=255) gCACGATGATCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCgg > 1:504127/1‑150 (MQ=255) gCACGATGATCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCgg > 1:1276370/1‑150 (MQ=255) cACGATGATCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCTGCTgcgcggcaaa < 2:287838/150‑6 (MQ=255) aCGATGATCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCg < 2:828364/150‑1 (MQ=255) cGATGATCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCgt < 2:1011090/150‑1 (MQ=255) gatgatCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCAAGGGTCGGCGTGCGGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCgtg > 2:473949/1‑150 (MQ=255) tgatCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCgtggt < 2:414766/150‑1 (MQ=255) tcatcGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCt < 2:1276370/150‑1 (MQ=255) tcGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCgcagca > 1:952173/1‑129 (MQ=255) tcGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCgcagca < 2:952173/129‑1 (MQ=255) tcGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTtga < 2:207321/150‑1 (MQ=255) cgccgcCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTtgat < 1:230351/150‑1 (MQ=255) gACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGAGGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTgg > 2:876797/1‑150 (MQ=255) ccACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGAt < 1:1044396/150‑1 (MQ=255) acaacaGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATgg > 2:207163/1‑150 (MQ=255) gcgcCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAg > 2:1053696/1‑150 (MQ=255) gATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCa < 1:328202/150‑1 (MQ=255) tGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGATGGCCACGGCTGAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGc < 1:1242133/150‑1 (MQ=255) gTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCgg > 2:1403119/1‑150 (MQ=255) tGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCGCCGGGTCACCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGCGGTGCTTGATGATCTGGATCACGCCATAGGCCCAGCggc > 2:121512/1‑149 (MQ=255) agaagaTGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGc < 2:494280/150‑1 (MQ=255) gaagaTGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCg > 2:192708/1‑150 (MQ=255) aagaTGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGt > 1:1068375/1‑150 (MQ=255) aagaTGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGt > 1:148878/1‑150 (MQ=255) agaTGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGtt < 1:769907/150‑1 (MQ=255) agaTGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGtt < 2:1068375/150‑1 (MQ=255) ttCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGcttc > 1:1338072/1‑150 (MQ=255) cATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGcttctt < 2:498336/150‑1 (MQ=255) gCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGCAGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGaa < 1:473949/150‑1 (MQ=255) cATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGt > 1:139251/1‑150 (MQ=255) aTCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCAGTGCAGCAGCGCGCCGCCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTc > 1:806661/1‑150 (MQ=255) tCGGCGATCTACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATg < 2:951385/111‑1 (MQ=255) tCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATg > 1:951385/1‑111 (MQ=255) cGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGa < 1:1062784/150‑1 (MQ=255) gCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATg > 2:418575/1‑150 (MQ=255) gATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCACTGGCCACGGGTCAGTTGTCATCGTTTGTCTCGCATCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGACGTAGGCCCAGAGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGaa < 2:1379126/150‑1 (MQ=255) atctaaggTCGCCCGCCTGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTCGAAGCCCTTGCCCCGCATCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGCTCTAGATGGCACCGTTTGCCTAGTGTAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAg < 1:678599/144‑1 (MQ=255) aTCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAg < 2:421297/150‑1 (MQ=255) aTCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAg < 2:139251/150‑1 (MQ=255) cACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTtg < 1:133296/90‑1 (MQ=255) cACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTtg > 2:133296/1‑90 (MQ=255) aCGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGgtgt > 2:291791/1‑150 (MQ=255) cGGTAGCCAGCCGGCCAGGGAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCGGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTTCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGTAGTCGATGACGGCGTc > 2:678599/1‑150 (MQ=255) cGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGGGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGAGGAAGGTGTc < 2:763871/150‑1 (MQ=255) gTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCgg < 2:18031/150‑1 (MQ=255) cagccGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATc > 2:608873/1‑150 (MQ=255) aGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTg > 1:1025781/1‑150 (MQ=255) gAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGa < 2:1051654/122‑1 (MQ=255) gAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGa > 1:1051654/1‑122 (MQ=255) gAAGTGGTAGCGCTGGCAACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGTGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGcc < 1:127128/150‑1 (MQ=255) gTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCt < 1:876797/150‑1 (MQ=255) tAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTc > 2:735978/1‑125 (MQ=255) tAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTc < 1:735978/125‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCtgtt < 1:211100/150‑1 (MQ=255) gcgcGGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCtgtt < 2:535103/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCtgttg < 1:121512/150‑1 (MQ=255) tGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTgg < 1:608873/150‑1 (MQ=255) gCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTGGGc < 1:192708/150‑1 (MQ=255) ccACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGCTCATCTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTGGGCg < 1:449204/150‑1 (MQ=255) gggTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTGGGCGTAgg > 2:818283/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTGGGCGTAGgcggcg < 1:207163/150‑1 (MQ=255) tggctgCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTGGGCGTAGGCGGCGGAc > 2:834848/1‑150 (MQ=255) ggctgCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTGGGCGTAGGCGGCGGACa < 1:989340/150‑1 (MQ=255) gctgCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTGGGCGTAGGCGGCGGACAg > 1:1086627/1‑150 (MQ=255) tgCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTGGGCGTAGGCGGCGGACAGGc > 1:1008750/1‑150 (MQ=255) cTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTTAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTGGGCGTAGGCGGCGGACAGGCCtt > 1:208978/1‑150 (MQ=255) gccggcgcgCTGCTGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCtgtt < 2:413843/118‑1 (MQ=255) gccggcgcgCTGCTGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCtgtt > 1:413843/6‑123 (MQ=255) tGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTGGGCGTAGGCGGCGGACAGGCCTTtct < 2:504127/150‑1 (MQ=255) cggcgcgCTGCTGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCtgttgt < 2:1251505/120‑1 (MQ=255) cggcgcgCTGCTGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCtgttgt > 1:1251505/4‑123 (MQ=255) gCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTGGGCGTAGGCGGCGGACAGGCCTTtctc < 1:291791/150‑1 (MQ=255) | CGACCCGATGCGGCACGATGATCATCGCCGCCGACCACAACAGCGCGCCGATGGTGAAGAAGATGTTCATGCCATCGGCGATCCACGGTAGCCAGCCGGCCAGGAAGTGGTAGCGCTGGCCACGGGTCAGCTGGCTGCCTTTGCCGCGCAGCAGCGCGCCGGCGTGGTGCTTGATGATCTGGATGGCGCCGTAGGCCCAGCGGAAGCGTTGCTTCTTGAAGTCGATGAAGGTGTCGGGCATCAGGCCCTTGCCGTAGCTGTTGTGGGCGTAGGCGGCGGACAGGCCTTTCTC > NC_002947/1731778‑1732069 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |