| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,871,462 | C→T | 5.5% | Q232* (CAG→TAG) ‡ | cobC → | adenosylcobinamide‑phosphate synthase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,871,462 | 0 | C | T | 5.5% | 210.2 / 2.5 | 73 | Q232* (CAG→TAG) ‡ | cobC | adenosylcobinamide‑phosphate synthase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/34); new base T (2/2); total (37/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.54e-01 | |||||||||||
CGGGGCTGATCGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTACGTGCGTAGCGAGCATGC > NC_002947/1871313‑1871610 | cGGGGCTGATCGTGCTGCGTTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGccc > 2:967555/1‑150 (MQ=255) gATCGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAg > 2:1217347/1‑150 (MQ=255) aTCGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGc > 1:587841/1‑150 (MQ=255) cgcTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCtgat < 1:188056/150‑1 (MQ=255) cgcTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCtgat < 2:15945/150‑1 (MQ=255) gcTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCtgatg < 1:182342/150‑1 (MQ=255) ttCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCtgatga < 1:967555/149‑1 (MQ=255) cTCGTTTGGCAAGTTCTTCAGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCtgatga < 2:935782/150‑1 (MQ=255) cGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATgaga < 2:508807/150‑1 (MQ=255) ccaaggCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACAGTCAAAGACCCGACCCGGGAACAGACCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGAc > 1:410155/5‑150 (MQ=255) tttGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACt < 2:216948/150‑1 (MQ=255) gCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGccc > 2:805079/1‑150 (MQ=255) aaGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCTGGGCCAGcac < 2:1121047/131‑3 (MQ=255) aaGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCTGGGCCAGcac > 1:1121047/1‑129 (MQ=255) ttcttcGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAgcgc > 1:274876/1‑150 (MQ=255) ggCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAg < 2:734831/150‑1 (MQ=255) cTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCATGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGc < 2:820026/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGc > 1:328781/1‑150 (MQ=255) gCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCt < 2:753270/150‑1 (MQ=255) gCGTCCGCCTGGGATTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCt < 1:430715/150‑1 (MQ=255) gTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGCCCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCtgg > 2:759963/1‑149 (MQ=255) gcCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGtgctg < 1:1323825/150‑1 (MQ=255) ttggCTGCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGTCTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGtgctgctg < 1:1025313/148‑1 (MQ=255) gCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAg > 2:1182829/1‑128 (MQ=255) gCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAg < 1:1182829/128‑1 (MQ=255) ttCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAgc < 2:144413/118‑1 (MQ=255) ttCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAgc > 1:144413/1‑118 (MQ=255) ttCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTgccagc > 2:412464/1‑150 (MQ=255) ttCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTgccagc > 2:1133798/1‑150 (MQ=255) ttCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTgccagc > 1:481452/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGccagccag > 1:659171/1‑150 (MQ=255) cTTGCTGCTGCGCCTGGCCGATCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGACACTGCGCAGCGCGCGCAGGCGCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGtt < 1:1133798/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTg < 1:412464/150‑1 (MQ=255) gctgcGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGc > 1:744694/1‑70 (MQ=255) gctgcGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGc < 2:744694/70‑1 (MQ=255) gcCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCg > 1:308912/1‑150 (MQ=255) aggggCCGAACAGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCCGGCCAGCCTGTCTGATGAAACTGCGCAGCGCGGGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCgg > 2:738438/4‑150 (MQ=255) cGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAg > 2:366060/1‑88 (MQ=255) cGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAg < 1:366060/88‑1 (MQ=255) cGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGgc < 1:720881/150‑1 (MQ=255) aGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGgcgc < 2:587841/150‑1 (MQ=255) gctCAGCCCACGGACCGCCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTTATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTTCGGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAg < 2:274876/150‑1 (MQ=255) ctCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAgt > 2:109691/1‑150 (MQ=255) ggCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAgtggt < 1:109691/150‑1 (MQ=255) agCCCATGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTCCCAAGCGCGCGCAGGCCCAAAGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGATTGCGCACGTGATGCGCCGTGCCGGCCTGGCGACTAgtggt > 2:247302/2‑150 (MQ=255) ccTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCt > 1:210194/1‑150 (MQ=255) cGTCAACGGCCCGACCCGGGTGATGCCGAAGGCAAGCCTGTCTGATGAGACGGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCt > 2:1232449/1‑150 (MQ=255) gTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGtt < 2:1254106/110‑1 (MQ=255) gTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGtt > 1:1254106/1‑110 (MQ=255) gTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTg > 2:882920/1‑150 (MQ=255) tCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGt > 1:184421/1‑150 (MQ=255) tCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGt > 2:443379/1‑150 (MQ=255) aaCGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGAGTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTc < 1:576752/150‑1 (MQ=255) aaCGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAg > 1:761977/1‑131 (MQ=255) aaCGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAg < 2:761977/131‑1 (MQ=255) aaCGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTc < 2:26162/150‑1 (MQ=255) aCGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTg < 1:1124638/139‑1 (MQ=255) aCGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTg > 2:1124638/1‑139 (MQ=255) aCGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTcc > 2:508190/1‑150 (MQ=255) aCGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCGGGTGGTGGCTGCGACCTGTTcc > 2:1319019/1‑150 (MQ=255) cGGCCCGCCCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCGGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCa < 1:16437/150‑1 (MQ=255) cGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCa < 1:149202/150‑1 (MQ=255) ggCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAg > 1:1298298/1‑150 (MQ=255) gCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGTCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGt > 2:1155029/1‑150 (MQ=255) cccGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTa > 2:62008/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGCTGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTTCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGtggtgg < 1:1361811/126‑1 (MQ=255) ccGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGtggtgg > 2:1361811/1‑126 (MQ=255) gggTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGa < 2:1249064/130‑1 (MQ=255) gggTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGa > 1:1249064/1‑130 (MQ=255) aggCTGGCCTGGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTc < 1:47745/133‑1 (MQ=255) aggCTGGCCTGGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTc > 2:47745/3‑135 (MQ=255) gCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTACGTGCGTAGCGa < 2:328781/150‑1 (MQ=255) tGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGtt > 1:908860/1‑88 (MQ=255) tGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGtt < 2:908860/88‑1 (MQ=255) ccAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGtggtgg > 2:176919/1‑114 (MQ=255) ccAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGtggtgg < 1:176919/114‑1 (MQ=255) ccAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTACGTGCGTAGCGAGCAtgc > 2:768825/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTACGTGCGTAGCGAGCAtgc > 2:71962/1‑150 (MQ=255) | CGGGGCTGATCGTGCTGCGCTCGTTTGGCAAGTTCTTCGGCTTGGCCGGCGTGCGCCTGGGCTTCGTTGCCGCCGAACACAGCTTGCTGCTGCGCCTGGCCGAGCTGCTCGGCCCCTGGACCGTCAACGGCCCGACCCGGGTGCTGGCCCAGGCCAGCCTGTCTGATGAGACTGCCCAGCGCGCGCAGGCCCAACGCTGTGCTGCTGCCAGCCAGCGGCTTGCGCACGTGTTGCGCAGTGCCGGCCTGGCGCCTAGTGGTGGCTGCGACCTGTTCCAGTACGTGCGTAGCGAGCATGC > NC_002947/1871313‑1871610 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |