Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,907,549 | T→C | 7.5% | T78A (ACC→GCC) | PP_1707 ← | D‑isomer specific 2‑hydroxyacid dehydrogenase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,907,549 | 0 | T | C | 7.5% | 192.1 / 4.8 | 69 | T78A (ACC→GCC) | PP_1707 | D‑isomer specific 2‑hydroxyacid dehydrogenase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/34); new base C (2/3); total (32/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.31e-01 |
GCGAACGAAGCGGTCACCGGTGCAGATCCCCCGGCACAAGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTAGGCCTCCTTGTCGGCCTGTTCGTAG > NC_002947/1907400‑1907694 | gcgAACGAAGCGGTCACCGGTGCAGATCCCCCGGCACAAGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGCTCTTGATGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGt < 1:320105/150‑1 (MQ=255) aacgaaGCGGTCACCGGTGCAGATCCCCCGGCACAAGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGcc > 1:822578/1‑150 (MQ=255) gCGGTCACCGGTGCAGATCCCCCGGCACAAGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGCACCGACGcg < 2:1274825/150‑2 (MQ=255) cGGTCACCGGTGCAGATCCCCCGGCACAAGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCCCCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCa < 1:959907/150‑1 (MQ=255) ggTCACCGGTGCAGATCCCCCGGCACAAGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCAt > 2:1168526/1‑150 (MQ=255) ggTGCAGATCCCCCGGCACAAGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGc < 1:169614/150‑1 (MQ=255) gTGCAGATCCCACGGCACAAGCCGATGAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATGACGGGCATAGGCCAGGTATACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACggag > 2:460446/1‑148 (MQ=255) aGATCCCCCGGCACAAGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCa > 2:459223/1‑150 (MQ=255) gATCGCCCGGCACAAGCCGACCAGCAGGCCGATGCCACGATCGCCTGCAGCCCCGAAGAGCGCAGCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCAGAGGGCCGGATCACCGCGTCGAAGCCGACGCCATTGACGGCGATCAc > 2:145556/1‑150 (MQ=255) ccccGGCACAAGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCg > 1:658136/1‑150 (MQ=255) cccGGCACAAGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCCCGATGTTGCCGTCCGTCACCCGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGa < 1:460446/150‑1 (MQ=255) ccGGCACAAGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAg < 2:229938/150‑1 (MQ=255) cGGCACAAGCCGATCAGCAGTCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAgg < 1:225112/150‑1 (MQ=255) cacaAGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTg < 1:660020/150‑1 (MQ=255) aaGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGc > 2:1024025/1‑150 (MQ=255) ccGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAgg > 1:928571/1‑150 (MQ=255) gcagGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCa > 1:731144/1‑150 (MQ=255) gcagGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCa > 2:654724/1‑150 (MQ=255) gCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTT‑GAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAgc > 1:686210/1‑150 (MQ=255) gCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTgg < 2:1412301/150‑1 (MQ=255) gATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCAAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGa > 1:1194497/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCACGTCGTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATACGCTGTGTCTAATGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGAt < 1:100828/150‑1 (MQ=255) gCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCg > 2:635526/1‑150 (MQ=255) cGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCTGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCgg < 2:595255/150‑1 (MQ=255) ctgccgcGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCCCCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCAATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGgtgt < 1:453227/144‑1 (MQ=255) gTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGACGAGATCCCGGGCATATGCCAGGTCTACCGCGTGGGTGCCGACGCCAGTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGtgtg < 1:674375/150‑1 (MQ=255) cTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGCACCGACGcgg > 2:624187/1‑83 (MQ=255) cTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGCACCGACGcgg < 1:624187/85‑3 (MQ=255) gAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGt < 1:1024025/150‑1 (MQ=255) aGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTg < 1:459223/150‑1 (MQ=255) gcgcACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCgg < 2:1193700/135‑1 (MQ=255) gcgcACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCgg > 1:1193700/1‑135 (MQ=255) aCCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCAc < 1:941931/150‑1 (MQ=255) ccGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATg > 2:1165955/1‑126 (MQ=255) ccGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATg < 1:1165955/126‑1 (MQ=255) gATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGc < 2:1382170/62‑1 (MQ=255) gATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGc > 1:1382170/1‑62 (MQ=255) tCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGaa > 1:1025032/1‑150 (MQ=255) aCCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCAc > 1:836482/1‑134 (MQ=255) aCCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCCAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCAc < 2:836482/134‑1 (MQ=255) ccTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAg < 1:654724/150‑1 (MQ=255) cTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGAt < 1:1310052/129‑1 (MQ=255) cTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGAt > 2:1310052/1‑129 (MQ=255) cTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGc > 1:1321307/1‑150 (MQ=255) gCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATgctg < 1:635526/150‑1 (MQ=255) ccGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAACATTGCCAGCATgctgg < 2:1321307/150‑1 (MQ=255) gcgATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATgctggct > 1:874181/1‑150 (MQ=255) ccgATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATgctggct < 1:606304/149‑1 (MQ=255) aCGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTa < 1:1193194/150‑1 (MQ=255) gggCATAGGCCAGGTCTACAGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTAgg > 1:45013/1‑150 (MQ=255) ggCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTactg < 1:1342895/150‑4 (MQ=255) ggCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTAgg < 2:1254724/149‑1 (MQ=255) ggCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTAgg > 1:1254724/1‑149 (MQ=255) ggCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTAGGc < 2:822578/150‑1 (MQ=255) cATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGGTCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTAGGcct < 2:1025032/150‑1 (MQ=255) ggTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGgtgt > 1:535662/1‑87 (MQ=255) ggTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGgtgt < 2:535662/87‑1 (MQ=255) gTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTAGGCCTCCTTGTCGGc > 2:800255/1‑150 (MQ=255) tCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCa > 2:1281907/1‑64 (MQ=255) tCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCa < 1:1281907/64‑1 (MQ=255) cTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTAGGCCTCCTTGTCGGCCt < 2:928571/150‑1 (MQ=255) tACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTa > 2:21215/1‑132 (MQ=255) tACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTa < 1:21215/132‑1 (MQ=255) tggcgTCGGCACCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCa > 2:404415/3‑116 (MQ=255) tggcgTCGGCACCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCa < 1:404415/114‑1 (MQ=255) ccGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATgctggcaata < 1:202388/127‑5 (MQ=255) ccGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATgctggcaata > 2:202388/1‑123 (MQ=255) ccGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTAGGCCTCCTTGTGGGCATGtt > 1:40133/1‑150 (MQ=255) gcgTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTAGGCCTCCTTGTCGGCCTGTTCg > 2:170268/1‑150 (MQ=255) tCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTAGGCCTCCTTGTCGGCCTGTTCgtag < 2:584242/150‑1 (MQ=255) | GCGAACGAAGCGGTCACCGGTGCAGATCCCCCGGCACAAGCCGATCAGCAGGCCGATGGCAAGATCGGCGACGTCCTCGGTGAGCGCACCGATGGTCGCCGTCACCTGGATGCCGCGATCACGGGCATAGGCCAGGTCTACCGCGTCGGTGCCGACGCCATTGACGGCGATCACTTCGAGGTTGGGCAGGCGCGCCATCAGCGCCTGGCTGATGCCGGTGTGGCCGCCGGTGATCACGCCGCGAATATTGCCAGCATGCTGGCTGACGTAGGCCTCCTTGTCGGCCTGTTCGTAG > NC_002947/1907400‑1907694 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |