| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,062,881 | G→C | 6.8% | A585P (GCT→CCT) | PP_1838 → | membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,062,881 | 0 | G | C | 6.8% | 215.5 / 4.8 | 72 | A585P (GCT→CCT) | PP_1838 | membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/39); new base C (2/3); total (29/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
AGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACATGAGCCC > NC_002947/2062732‑2063026 | agcagGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAgg < 2:1157754/150‑1 (MQ=255) ggACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTg < 1:491450/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTg > 2:1425445/1‑144 (MQ=255) ccTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTg < 1:1425445/144‑1 (MQ=255) ccGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGCTTGCCCCGGGCATTCAGGAGAATGTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGa < 2:867505/150‑1 (MQ=255) cGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGAc < 2:964826/150‑1 (MQ=255) ttCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTg > 1:1030757/1‑150 (MQ=255) ttCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTg > 1:1238972/1‑150 (MQ=255) cAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGCAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCt > 1:1358458/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAAc < 2:173245/150‑1 (MQ=255) tGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACAGCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAAcc > 1:455585/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCACCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTg > 2:116445/1‑150 (MQ=255) cGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGc < 1:256407/112‑1 (MQ=255) cGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGc > 2:256407/1‑112 (MQ=255) cGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGc < 1:862571/150‑1 (MQ=255) gctgctgctGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGAc < 2:930312/136‑1 (MQ=255) gctgctgctGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGAc > 1:930312/1‑136 (MQ=255) gctgctgctGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGcc < 2:1358458/150‑1 (MQ=255) tgctgATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAgg < 1:1200955/150‑1 (MQ=255) gctgATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTACTCAACCTGCACGAggg > 2:364465/1‑150 (MQ=255) gCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGACCCCCATGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTCGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAg < 1:1155559/150‑1 (MQ=255) cccGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAggg > 1:684911/1‑150 (MQ=255) ccGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGc > 1:415001/1‑150 (MQ=255) ggCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGTCTCGCCACCAGTGCTggg < 2:837771/109‑1 (MQ=255) ggCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTggg > 1:837771/1‑109 (MQ=255) gCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTCAACCTGTTGGCATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAg < 2:37010/150‑1 (MQ=255) aGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGa < 2:455585/150‑1 (MQ=255) ggAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTa < 1:458801/142‑1 (MQ=255) ggAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTa > 2:458801/1‑142 (MQ=255) gaAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGt < 1:642841/127‑1 (MQ=255) gaAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGt > 2:642841/1‑127 (MQ=255) gaAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCaa < 2:739286/150‑1 (MQ=255) aGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGc < 2:301275/150‑1 (MQ=255) tgcggtgAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCCCCAGCTGCGGC‑GGCCGCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCggg < 1:738402/150‑1 (MQ=255) tCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGTGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCa > 1:155045/1‑150 (MQ=255) cacaCCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAg < 1:729971/150‑1 (MQ=255) cacCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGAc > 2:283414/1‑109 (MQ=255) cacCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGAc < 1:283414/109‑1 (MQ=255) acCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGAtt > 1:1047114/1‑150 (MQ=255) tACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCt < 2:1047114/150‑1 (MQ=255) tACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCt > 2:52657/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGt > 1:1388636/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGt > 2:140268/1‑150 (MQ=255) tCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAgg < 2:1238972/150‑1 (MQ=255) aTCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCGCCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGAc < 2:1030757/150‑1 (MQ=255) tCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGAcc < 2:1293700/150‑1 (MQ=255) tCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGAcc < 2:1388636/150‑1 (MQ=255) tCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGAcc < 1:52657/150‑1 (MQ=255) tCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATCCTCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCCGATTGTCTGGCTGGTGCAGGGTCAcc < 2:415001/150‑1 (MQ=255) gACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAg > 2:1061857/1‑100 (MQ=255) gACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAg < 1:1061857/100‑1 (MQ=255) aCCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCGCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGAcc < 2:474929/142‑1 (MQ=255) aCCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGAcc > 1:474929/1‑142 (MQ=255) catcatGGGGCGGCTG‑TTTGGCTAGGCGGGCCACGAGTGCGGGGGGCGCGACCTGCTCCACGTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATGCTGAt < 2:582222/150‑1 (MQ=255) catGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGa < 2:684911/150‑1 (MQ=255) atGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGc < 1:578493/102‑1 (MQ=255) atGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGc > 2:578493/1‑102 (MQ=255) ccgccTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGGCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCaa < 1:116445/150‑1 (MQ=255) cgccTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCCCCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGGGTCCAAg < 1:638347/150‑1 (MQ=255) cgccTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAg < 1:369844/150‑1 (MQ=255) cactggTGGCGAGCCTTGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCaa < 1:1311294/143‑1 (MQ=255) cactggTGGCGAGCCTTGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCaa > 2:1311294/5‑147 (MQ=255) tggTGGCGAGCCTTGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGt > 1:946526/2‑105 (MQ=255) tggTGGCGAGCCTTGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGt < 2:946526/104‑1 (MQ=255) gTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACATGa > 1:5988/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACATGAGc < 1:910706/150‑1 (MQ=255) gCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCNAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGAt > 1:165720/1‑130 (MQ=255) gCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTa < 2:105455/65‑1 (MQ=255) gCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTa > 1:105455/1‑65 (MQ=255) gCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGTCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGAt < 2:165720/130‑1 (MQ=255) cAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACATGAGccc < 1:1363616/150‑1 (MQ=255) aaGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAggg > 1:831752/1‑113 (MQ=255) aaGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAggg < 2:831752/113‑1 (MQ=255) | AGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTG‑GGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACATGAGCCC > NC_002947/2062732‑2063026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |