Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,095,713 | G→A | 6.2% | L270L (CTG→TTG) | alaA ← | glutamate‑pyruvate aminotransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,095,713 | 0 | G | A | 6.2% | 175.7 / 2.1 | 64 | L270L (CTG→TTG) | alaA | glutamate‑pyruvate aminotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/30); new base A (2/2); total (32/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.12e-01 |
GATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTG > NC_002947/2095564‑2095861 | gATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAg > 1:1355057/1‑150 (MQ=255) aTGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGc > 2:5954/1‑150 (MQ=255) tCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATg > 1:969057/1‑150 (MQ=255) cGTTGAGCAGTTCGCAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGt < 2:275000/150‑1 (MQ=255) gAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGAt < 1:5954/150‑1 (MQ=255) gTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGAt > 1:1305735/1‑150 (MQ=255) gTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAg > 2:862200/1‑150 (MQ=255) ggTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCAGGCAGTAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCtgt < 1:714476/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCt < 2:1095185/147‑1 (MQ=255) gTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCt > 1:1095185/1‑147 (MQ=255) ttGCGCTGCTCCAGCAGGCCGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTGGAGGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCtgtgt < 1:702107/150‑1 (MQ=255) gctgctCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCAGGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCgt > 2:1302620/1‑150 (MQ=255) ctgctCCAGCAGTCGTCCCGTCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCgtg < 2:790648/150‑1 (MQ=255) ctgctCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCgtg < 1:1298974/150‑1 (MQ=255) ggcCCGGCTGCAGCACCAGTTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCgg > 2:1090970/1‑150 (MQ=255) cggcggCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAAt < 1:621179/150‑1 (MQ=255) gcggcAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGGCGGGCCATGACGTTGGCGCCAAAGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGa < 1:101524/150‑1 (MQ=255) ggcAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTCCTCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATc < 1:602514/150‑1 (MQ=255) gcagcaCCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATca > 2:413031/1‑150 (MQ=255) aCCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGAATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATcagccag > 2:120369/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATcagccagc < 1:1177626/150‑1 (MQ=255) gTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAgccagcca < 2:1319012/145‑1 (MQ=255) gTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAgccagcca > 1:1319012/1‑145 (MQ=255) gATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGaa < 1:1090970/150‑1 (MQ=255) aTGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTACGCCATTCACATGGGGGTGTTTCGTTTGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAg > 1:674160/1‑150 (MQ=255) tGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAACATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGaaa > 1:1375455/1‑126 (MQ=255) tGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAACATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGaaa < 2:1375455/126‑1 (MQ=255) tctGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCCTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCg > 2:710306/1‑150 (MQ=255) tAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCAcc < 1:896521/150‑1 (MQ=255) cgccCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGGACAGGCGGATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGt < 2:156830/150‑1 (MQ=255) cgccCAGCGCGGTCTGGAGGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGt > 2:492353/1‑150 (MQ=255) gccCAGCGCGGTCTGGATGGAATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTa < 1:120369/150‑1 (MQ=255) cAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGa < 2:41999/150‑1 (MQ=255) ggTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGCTACGACTTGGa > 1:694855/1‑150 (MQ=255) tCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTAGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCgg < 1:1370437/122‑1 (MQ=255) tCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTAGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCgg > 2:1370437/1‑122 (MQ=255) gATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGcc > 2:1024312/1‑150 (MQ=255) gATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGcc > 2:1116965/1‑150 (MQ=255) tGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAGAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGt > 2:236794/1‑150 (MQ=255) tGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGt > 2:381309/1‑150 (MQ=255) gCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTg < 1:1116965/150‑1 (MQ=255) cATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCtgt > 1:1042013/1‑69 (MQ=255) cATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCtgt < 2:1042013/69‑1 (MQ=255) tGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAg > 1:460141/1‑150 (MQ=255) tGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAg < 1:381309/150‑1 (MQ=255) tGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAg < 1:413031/150‑1 (MQ=255) gggCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCa < 2:1355057/150‑1 (MQ=255) gggCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCa > 2:652649/1‑150 (MQ=255) gCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAgg < 1:1302620/150‑1 (MQ=255) gCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCACGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGcaca > 1:1240520/1‑150 (MQ=255) gTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCAcagcag > 1:307153/1‑150 (MQ=255) gTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCAcagcag > 2:738705/1‑150 (MQ=255) cacaGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGa < 2:1368885/150‑1 (MQ=255) cacaGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGa < 2:969057/150‑1 (MQ=255) ggCGCATGTTGGCCAACATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGa > 1:818856/1‑112 (MQ=255) ggCGCATGTTGGCCAACATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGa < 2:818856/112‑1 (MQ=255) gcgcATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGCAGTCCGCCACCCGGTAGGACGTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGCGCCAg > 1:460343/1‑150 (MQ=255) gcgcATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAg > 2:562932/1‑150 (MQ=255) ttGGCCGGCCAGTAGCTGCATTAGATGTAGCTTTGTGCGGGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCg < 2:307153/150‑1 (MQ=255) gCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCAcagcag > 2:1330687/1‑128 (MQ=255) gCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCAcagcag < 1:1330687/128‑1 (MQ=255) cAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGc > 2:1162346/1‑81 (MQ=255) cAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGc < 1:1162346/81‑1 (MQ=255) cAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCt < 1:209064/150‑1 (MQ=255) aGCCTGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTg > 2:877700/1‑150 (MQ=255) | GATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACAGGCGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTG > NC_002947/2095564‑2095861 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |