| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,273,705 | C→G | 6.3% | T235T (ACG→ACC) | PP_2004 ← | AraC family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,273,705 | 0 | C | G | 6.3% | 249.7 / 6.5 | 80 | T235T (ACG→ACC) | PP_2004 | AraC family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/40); new base G (3/2); total (38/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.74e-01 | |||||||||||
GCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCGTGCTGCAAAG > NC_002947/2273558‑2273851 | gcgcGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGt < 1:546053/150‑1 (MQ=255) tGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACGCGGGTgcgca < 1:1218588/150‑2 (MQ=255) ccTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTgc > 2:247865/1‑150 (MQ=255) cTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTgca > 1:1256867/1‑150 (MQ=255) tcctccGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACAGCGCACCCGCGTGCGCTgcagc > 1:1142007/1‑150 (MQ=255) ctccGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGcagcag > 2:672551/1‑150 (MQ=255) ctccGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACGGCGCACCCGCGTGCGCTGcagcag < 1:186967/150‑1 (MQ=255) cgcgAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCTGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTTCCCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGctc < 1:1403926/150‑1 (MQ=255) gcgAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGctct < 1:268037/150‑1 (MQ=255) gAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGGAGTGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGc < 1:1084536/150‑1 (MQ=255) gAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGc > 1:1101625/1‑150 (MQ=255) ttGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCg < 1:58654/150‑1 (MQ=255) gcgcAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACaa < 2:695674/150‑1 (MQ=255) agcAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAAc > 2:974497/2‑150 (MQ=255) aaGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGc > 1:1038613/1‑150 (MQ=255) gTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAAc > 2:1398972/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAg < 1:905566/150‑1 (MQ=255) gCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACGCGGGTgcgcagt < 2:838052/118‑4 (MQ=255) gCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACGCGGGTgcgcagt > 1:838052/1‑115 (MQ=255) gCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTAC‑CGACCTGCCGTTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACACAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGtg > 1:1327450/1‑150 (MQ=255) cTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGtgc < 1:1363921/150‑1 (MQ=255) aGCTCCAAGTGCATCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCATCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCTCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCGCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAg < 1:515238/150‑1 (MQ=255) cTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGAGCTCACCCAGACTGCGCACGCGCGTGAGCTGCAGCAGCTCTGATTCGGACAACTGCAACAGGTGGTGCTAGGt > 2:681017/1‑150 (MQ=255) tGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTa > 1:147418/1‑150 (MQ=255) aaGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTc < 2:1038613/150‑1 (MQ=255) gcgcCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAAt < 1:1075954/150‑1 (MQ=255) cgcCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATg < 1:15833/150‑1 (MQ=255) aCTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑TCCATTCAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCCACCGCGTGCGCTGCAGCCCTTCTGCACGTCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCg < 1:1316087/150‑1 (MQ=255) cttcttCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCgg > 2:1266906/1‑150 (MQ=255) ttcttcGAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATGGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCggg < 2:786190/150‑1 (MQ=255) cttcCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAAc < 2:1195360/110‑1 (MQ=255) cttcCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAAc > 1:1195360/1‑110 (MQ=255) aGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGcc > 1:754351/1‑150 (MQ=255) ccGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGtt < 1:764409/150‑1 (MQ=255) cACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCCGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAgg > 1:397089/1‑150 (MQ=255) cGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTa < 2:1101625/150‑1 (MQ=255) cGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCGCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCCGGAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTa < 1:672551/150‑1 (MQ=255) gcc‑gccATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGCAACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAgc > 1:1084017/1‑150 (MQ=255) cc‑gccATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCa > 1:1128880/1‑107 (MQ=255) cc‑gccATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCa < 2:1128880/107‑1 (MQ=255) c‑gccATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAgcgc < 2:496947/150‑1 (MQ=255) gccATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGt > 2:713315/1‑98 (MQ=255) gccATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGt < 1:713315/98‑1 (MQ=255) cATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGc > 2:1306974/1‑150 (MQ=255) ttGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTc > 2:220579/1‑150 (MQ=255) tGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGtgctgc > 2:445136/1‑98 (MQ=255) tGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGtgctgc < 1:445136/98‑1 (MQ=255) gAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAg > 1:578023/1‑150 (MQ=255) gcagcGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGAc > 1:12252/1‑150 (MQ=255) gcagcGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGAc < 2:1256867/150‑1 (MQ=255) gggCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGc < 2:147418/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTg > 1:809629/1‑150 (MQ=255) ggtgATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTcggc > 1:453544/1‑150 (MQ=255) gATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCggcggc < 2:453544/150‑1 (MQ=255) aTGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAAt > 2:568569/1‑88 (MQ=255) aTGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAAt < 1:568569/88‑1 (MQ=255) tGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGa > 2:1342013/1‑150 (MQ=255) gcTCACCCAGACTGCGCCCCCGCGTGCGATGAATTAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACt < 2:1084017/150‑1 (MQ=255) gcTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTCCGACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACt < 1:728248/150‑1 (MQ=255) cTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTg < 1:1268523/150‑1 (MQ=255) atcccccAGCCTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTg < 1:952367/146‑1 (MQ=255) cACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGca < 2:578023/150‑1 (MQ=255) cACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGca < 1:974497/150‑1 (MQ=255) aCCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGATGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGcac > 1:518233/1‑150 (MQ=255) ccAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGcc > 2:1213102/1‑63 (MQ=255) ccAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGcc < 1:1213102/63‑1 (MQ=255) ccAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAg > 2:834471/1‑150 (MQ=255) ccAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAg > 2:158680/1‑150 (MQ=255) aGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGc > 1:717737/1‑150 (MQ=255) aGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGc < 2:1052837/150‑1 (MQ=255) tgcagcgcACGCGGGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCg > 2:144736/5‑150 (MQ=255) tgcagcgcACGCGGGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCg > 1:1318953/5‑150 (MQ=255) aCTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCGt < 2:886582/150‑1 (MQ=255) tGCGCACCGGCGTGCACTGCAGCACCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGCGTTGGCCAGTTGTAAGGTAGCGAGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCGtgc < 2:244743/150‑1 (MQ=255) gcgcACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCGtgct < 2:809629/150‑1 (MQ=255) gcACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTa < 2:610046/95‑1 (MQ=255) gcACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTa > 1:610046/1‑95 (MQ=255) cACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCg > 1:916991/1‑143 (MQ=255) cACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCg < 2:916991/143‑1 (MQ=255) ccGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCGTGCTGCAAAg > 1:380393/1‑150 (MQ=255) gcgTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCa < 2:556059/78‑1 (MQ=255) gcgTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCa > 1:556059/1‑78 (MQ=255) | GCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTTCTTCCAGGTCCGGTTCACGGCC‑GCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGCTCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCGTGCTGCAAAG > NC_002947/2273558‑2273851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |