| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,380,790 | T→C | 10.0% | A137A (GCT→GCC) | oprF → | porin F |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,380,790 | 0 | T | C | 10.0% | 191.4 / 10.0 | 70 | A137A (GCT→GCC) | oprF | porin F |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/32); new base C (2/5); total (33/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.34e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.90e-01 | |||||||||||
TCGAACACTGCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGCCCGAAGCAAGCTGAAGCTGCTC > NC_002947/2380644‑2380938 | tCGAACACTGCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTATGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTtggcgctggc > 2:1093341/1‑150 (MQ=255)tCGAACACTGCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTtggcgctggc > 2:324638/1‑150 (MQ=255) acTGCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCCACCCCCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCCAGCGCCaac < 2:784599/150‑2 (MQ=255) acTGCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAg > 2:895319/1‑150 (MQ=255) acTGCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCCAGCGCCaac < 2:1410697/150‑2 (MQ=255) acTGCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCCAGCGCCaac < 1:1302758/150‑2 (MQ=255) tGCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTg > 1:84407/1‑150 (MQ=255) tGCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTg > 1:547063/1‑150 (MQ=255) tGCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTg < 1:485415/150‑1 (MQ=255) tGCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTg > 2:1049917/1‑150 (MQ=255) tGCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTg > 2:485415/1‑150 (MQ=255) gCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTATGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTgg < 1:1093341/150‑1 (MQ=255) cccTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGt < 2:84407/150‑1 (MQ=255) cccTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGt < 2:1400734/150‑1 (MQ=255) cccTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGt < 2:344104/150‑1 (MQ=255) ccTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTa > 2:809385/1‑150 (MQ=255) gCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATCCGTTTGCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCAcc > 1:329580/1‑150 (MQ=255) gCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGTCAAGTGGTACATCAcc < 2:1094752/150‑1 (MQ=255) gCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGTCAAGTGGTACATCAcc > 1:1094752/1‑150 (MQ=255) aCCACTTCGACGACCAGTACGACGCTATCCGTGCATACGTTTCCGCTGGGTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGGCCGGCCGTGGTGTTCGTAACGACTCTACCTTCGCCAACGTATTCGCTTGCGCCAAGTAGTACTCCACCGACAAGt > 2:146873/1‑150 (MQ=255) cACTTCAACACCCCGTACGTCGCTAACCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTc < 2:309123/150‑1 (MQ=255) aCTTCAACATCCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCCACGGTAGCTACCCGGGACCTGCCCTGGCGGTCGTGACCACTCCCCATTAGCCCACGTTGACGCTTGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCt < 1:324638/150‑1 (MQ=255) cTTCAACAACCCTTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTa < 1:84015/150‑1 (MQ=255) cTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTa > 1:759467/1‑150 (MQ=255) ttCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTtggcgctggc > 1:211482/1‑120 (MQ=255) ttCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTtggcgctggc < 2:211482/120‑1 (MQ=255) ttCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTAt < 2:759467/150‑1 (MQ=255) aacaacCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGcc > 1:1145458/1‑150 (MQ=255) gCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGaa < 2:1145458/150‑1 (MQ=255) tCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTc > 2:428851/1‑150 (MQ=255) ccGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCa < 1:809385/150‑1 (MQ=255) aTACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACGACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTacaa < 1:1049917/150‑1 (MQ=255) tACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTacaac < 2:547063/150‑1 (MQ=255) gCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAg > 1:1200001/1‑150 (MQ=255) tGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAggg < 1:428851/150‑1 (MQ=255) tcGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGccc < 1:1172427/106‑1 (MQ=255) tcGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGccc > 2:1172427/1‑106 (MQ=255) tcGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACAcc > 1:1309036/1‑150 (MQ=255) tcGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACAcc > 2:121852/1‑150 (MQ=255) aCCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGt > 1:42977/1‑150 (MQ=255) aCCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGt > 2:1110343/1‑150 (MQ=255) cAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTc > 1:807297/1‑93 (MQ=255) cAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTc < 2:807297/93‑1 (MQ=255) cAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTgg < 2:465839/150‑1 (MQ=255) cAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTgg < 2:961938/150‑1 (MQ=255) ccAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGt > 1:1225909/1‑150 (MQ=255) cAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGGCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGtt < 2:1210047/150‑1 (MQ=255) cAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGtt < 1:1110343/150‑1 (MQ=255) aGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTg < 2:1200001/150‑1 (MQ=255) aCCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGgt < 1:121852/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTg < 2:1309036/150‑1 (MQ=255) ccGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTgg < 1:1372758/150‑1 (MQ=255) gTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCt < 2:365851/145‑1 (MQ=255) gTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCt > 1:365851/1‑145 (MQ=255) cGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTc > 2:1135678/1‑63 (MQ=255) cGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTc < 1:1135678/63‑1 (MQ=255) aCCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTcggcg > 1:666191/1‑150 (MQ=255) cACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTa > 1:1148140/1‑86 (MQ=255) cACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTa < 2:1148140/86‑1 (MQ=255) aCTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTa > 1:752850/1‑150 (MQ=255) cACCTTCGCCAACGTTGGTGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGccc > 1:930925/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGCCCGaa > 1:495039/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTAAATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCACGGCGACACCGAGCGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGCCCGaa < 1:146873/150‑1 (MQ=255) ttCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGCCCGaag > 2:1187448/1‑150 (MQ=255) agcGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGCCCGaag > 1:816707/3‑150 (MQ=255) gCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGCCCGaagcaa < 2:1225909/150‑1 (MQ=255) cAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGCCCGaagcaagc > 2:1018283/1‑150 (MQ=255) cAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGCCCGaa > 1:1309800/1‑144 (MQ=255) cAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGCCCGaa < 2:1309800/144‑1 (MQ=255) aaCGTTGGCGCTGGAGCAAAGTGGTAAACAGCTGAAATCTGCTTTGGGCGGGCCGGCGGATAATCTCAGTAGAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGCCCGAAGCaagct < 2:666191/150‑1 (MQ=255) cacttGGCGCCAGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTgg < 1:1144137/95‑1 (MQ=255) cacttGGCGCCAGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTgg > 2:1144137/4‑98 (MQ=255) cacttGGCGCCAGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTg > 2:980438/4‑111 (MQ=255) cacttGGCGCCAGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTg < 1:980438/108‑1 (MQ=255) ctggcgcCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGCCCGAAGCAAGCTGAAGctgctc < 1:1187448/150‑1 (MQ=255) ctggcgcCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGCCCGAAGCAAGCTGAAGctgctc > 1:1050958/1‑150 (MQ=255) | TCGAACACTGCCCTGGACGCCGTTTACCACTTCAACAACCCGTACGACGCTATCCGTCCATACGTTTCCGCTGGTTTCTCGCACCAGTCGCTGGGCCAGACCGGCCGTGGCGGTCGTGACCACTCCACCTTCGCCAACGTTGGCGCTGGCGCCAAGTGGTACATCACCGACATGTTCTATGCCCGTGCCGGCGTAGAAGCTCAGTACAACATCGACCAGGGCGACACCGAGTGGGCCCCGAGCGTTGGTGTTGGCCTGAACTTCGGCGGTAGCCCGAAGCAAGCTGAAGCTGCTC > NC_002947/2380644‑2380938 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |