| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,383,970 | T→C | 7.7% | A405A (GCA→GCG) | nasA ← | nitrate transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,383,970 | 0 | T | C | 7.7% | 180.6 / 4.7 | 65 | A405A (GCA→GCG) | nasA | nitrate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/32); new base C (2/3); total (30/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.33e-01 | |||||||||||
AACAGGTAGCCTTTGCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGCCAAGCCCGGCCGCCAGCAGGAA > NC_002947/2383821‑2384119 | aaCAGGTAGCCTTTGCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACt > 2:575813/1‑150 (MQ=255) ggTAGCCTTTGCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAg < 1:18006/150‑1 (MQ=255) gTAGCCTTTGCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGc > 1:109869/1‑150 (MQ=255) gTAGCCTTTGCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGc > 2:328770/1‑150 (MQ=255) tAGCCTTTGCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCAGTCACCGCAGca > 2:767458/1‑149 (MQ=255) gCCTTTGCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGa > 1:52365/1‑150 (MQ=255) gCCTTTGCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGa < 2:688834/150‑1 (MQ=255) ccTTTGCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCAGTCACCGCAGcacgg < 1:1347314/150‑5 (MQ=255) ccTTTGCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCAGTCACCGCAGcacgg > 2:1347314/1‑146 (MQ=255) ccTTTGCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGACAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCAGTCACCGCAGcacgg < 2:1146524/150‑5 (MQ=255) tttGCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCAGTCACCGCAGcactggt < 1:767458/150‑7 (MQ=255) gCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCa < 1:941011/150‑1 (MQ=255) ttCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCa > 2:490544/1‑150 (MQ=255) tGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAgcg > 1:492757/1‑150 (MQ=255) gTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCt > 2:10102/1‑150 (MQ=255) ccGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGAGCGGCCCGCATCCGCCCTCTTGCGCAAAGCTCAGTTGCAGGATCATCGGCGTGCCTCAGCCCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGtt < 1:1386564/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTg > 1:1349518/1‑150 (MQ=255) gCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAAc < 1:575813/150‑1 (MQ=255) gTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCa < 2:729435/150‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAgg < 1:598921/150‑1 (MQ=255) cTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGc > 1:888105/1‑150 (MQ=255) cTGGTTATCCACGCGCGGCACGACAGACCTGGATTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTAAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAACCGAGCACCCGGAGGTGCGCCAACGCTGTTTCACCCCGTGCAGGACGAAAAAGGc > 2:1361776/1‑150 (MQ=255) ggCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCANGGCNGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTg < 1:1344550/150‑1 (MQ=255) gCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTgg < 1:990227/150‑1 (MQ=255) gTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAac > 2:706800/1‑150 (MQ=255) gTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAac < 2:900155/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAacagcc < 1:10102/150‑1 (MQ=255) gcTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAacagcca > 2:806456/1‑150 (MQ=255) gCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAacagccacagc > 1:1337111/1‑150 (MQ=255) gggCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCa > 1:1234487/1‑150 (MQ=255) aaaGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGt > 2:806843/1‑85 (MQ=255) aaaGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGt < 1:806843/85‑1 (MQ=255) aaaGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTg < 1:328770/150‑1 (MQ=255) aaaGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTg < 1:46248/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATc < 2:109869/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGcc > 1:1420255/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGcc > 1:867798/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGCTAATCGGCGTGCCTCAGACCAATGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGGGCTGTTTCACGCACTGCAGCCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACCGCCCCAGTTTGTAATCGcc > 1:678861/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCa < 1:638315/150‑1 (MQ=255) cAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAgt < 1:806456/150‑1 (MQ=255) gCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGtgtg < 1:871685/150‑1 (MQ=255) aTCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCTGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTg > 1:808345/1‑131 (MQ=255) aTCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTg < 2:808345/131‑1 (MQ=255) tCGGCGTGCCTCAGCCCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGGCAGCGAGGGTGCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTgctgct < 1:1236895/150‑1 (MQ=255) cGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTgg < 1:1384413/104‑1 (MQ=255) cGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTgg > 2:1384413/1‑104 (MQ=255) gTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATg < 2:1337111/150‑1 (MQ=255) gCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGt < 1:50237/150‑1 (MQ=255) ccTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTg < 1:490544/150‑1 (MQ=255) cTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCt < 2:899259/54‑1 (MQ=255) cTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCt > 1:899259/1‑54 (MQ=255) cTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGc > 2:833420/1‑150 (MQ=255) cTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGc > 1:626185/1‑150 (MQ=255) tCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGt < 2:1274382/122‑1 (MQ=255) tCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGt > 1:1274382/1‑122 (MQ=255) tCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCCGTGTGCTGCTTGATGGTGcc > 2:112172/1‑150 (MQ=255) gACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGCCAAg > 1:1392627/1‑150 (MQ=255) aCCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGCCAAGc < 2:1392627/150‑1 (MQ=255) ccGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAgg > 1:335242/1‑64 (MQ=255) ccGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAgg < 2:335242/64‑1 (MQ=255) ccGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGCCAAGccc > 1:905241/1‑150 (MQ=255) cGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGCCAAGCCCg < 1:1107508/150‑1 (MQ=255) tgcGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGCCAAGCCCGgccgc < 2:1064447/150‑1 (MQ=255) cGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGCCAAGCCCGGCCGCca < 2:1234487/150‑1 (MQ=255) ggTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCACCAGTGTGCTGCTTGATGGTGCCAAGCCCGGCCGCcag > 2:197810/1‑150 (MQ=255) gACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGCCAAGCCCGGCCGCcagcag < 1:706800/150‑1 (MQ=255) tGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGCCAAGCCCGgcc < 2:711495/139‑1 (MQ=255) tGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGCCAAGCCCGgcc > 1:711495/1‑139 (MQ=255) tGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGCCAAGCCCGGCCGCCCGCAGGaa > 1:17781/1‑150 (MQ=255) | AACAGGTAGCCTTTGCTGGCGGCCAGTTCTGGTGCCGGCGTGACCAGGCGCAGGGCGTCCTGGTTTTCCGCGCGCGGCCCGGTGGCGCTGGCTTGGGCAAAGCTCAGTTGCAGGCTCATCGGCGTGCCTCAGACCCGTGCTGCGGTGACTGCAGCCGAGCCCCAGGTGGTGCGCCAGCGCTGTTTCACCCCGTGCAGGCCGAACCAGGCCAGCAGGCCCAGGCTGGCGAACAGCCACAGCCCCAGTTGGTAATCGCCAGTGTGCTGCTTGATGGTGCCAAGCCCGGCCGCCAGCAGGAA > NC_002947/2383821‑2384119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |