| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,407,008 | G→C | 6.6% | intergenic (+220/+34) | PP_2110 → / ← PP_2111 | ribosomal large subunit pseudouridine synthase/aerotaxis receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,407,008 | 0 | G | C | 6.6% | 236.2 / 6.2 | 76 | intergenic (+220/+34) | PP_2110/PP_2111 | ribosomal large subunit pseudouridine synthase/aerotaxis receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/40); new base C (2/3); total (33/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.35e-01 | |||||||||||
CCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTGCCGAGTGCTGCGCCTGTTCGGCGGTCTGGTCGGCCAGTTCGG > NC_002947/2406861‑2407154 | ccGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCagag > 2:625746/1‑150 (MQ=255) tATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACTGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCa > 1:1032030/1‑150 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCTACATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTNGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCTCTGCCGGTgttcgcgg < 1:564975/150‑8 (MQ=38) aaCCCGCTCCTCCATGGACCGGGGTGGAGGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCGGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGaa < 1:695526/150‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGaa < 2:799958/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCa < 1:1363076/141‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCa > 2:1363076/1‑141 (MQ=255) ccGCTCCTACATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGtc > 2:1140163/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGtctc < 2:751468/150‑1 (MQ=255) tCCTACATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACTCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGa < 2:1174029/150‑1 (MQ=255) cTACATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGc > 1:819304/1‑150 (MQ=255) aCATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCa < 1:552637/127‑1 (MQ=255) aCATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCa > 2:552637/1‑127 (MQ=255) tgggCTGGTCGCGCATCAGTTGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGtt < 2:304506/149‑1 (MQ=255) cGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGtt > 1:217596/1‑150 (MQ=255) gCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGaa < 2:466316/150‑1 (MQ=255) cTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAg < 1:1208742/150‑1 (MQ=255) cTGGACGCCAAGCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCCTCAGCGGTTGAAg < 1:1130502/150‑1 (MQ=255) cgcgCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTc < 1:1233005/150‑1 (MQ=255) cgcgCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGCTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTc < 2:118678/150‑1 (MQ=255) gcgcATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTcc < 2:385095/150‑1 (MQ=255) gcATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCg < 2:488456/116‑1 (MQ=255) gcATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCg > 1:488456/1‑116 (MQ=255) aTCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCCGCGGTTGAAGCGCTccacca > 1:918834/1‑150 (MQ=255) tCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGATCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAg > 1:1265432/1‑150 (MQ=255) tCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAg > 2:819992/1‑150 (MQ=255) cAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGc < 2:34863/150‑1 (MQ=255) cAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTATCTACCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGc < 1:260882/150‑1 (MQ=255) aGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTg > 2:1051688/1‑99 (MQ=255) aGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTg < 1:1051688/99‑1 (MQ=255) gTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATa < 1:1240202/150‑1 (MQ=255) ttCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATAc < 2:217596/150‑1 (MQ=255) tCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACt < 1:1285108/150‑1 (MQ=255) cGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGACGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTg < 2:1032030/150‑1 (MQ=255) cGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCAGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCTGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTg < 2:916084/150‑1 (MQ=255) gACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGaa < 2:1219250/106‑1 (MQ=255) gACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGaa > 1:1219250/1‑106 (MQ=255) acacAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGc < 1:1234144/150‑1 (MQ=255) acaGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTg > 1:674174/1‑146 (MQ=255) acaGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTg < 2:674174/146‑1 (MQ=255) aGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGa > 1:73620/1‑108 (MQ=255) aGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGa < 2:73620/108‑1 (MQ=255) aGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAg < 2:358357/124‑1 (MQ=255) aGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAg > 1:358357/1‑124 (MQ=255) aGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTAcc > 2:65155/1‑150 (MQ=255) aTCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACccgcc > 2:1190422/1‑150 (MQ=255) aTCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACccgcc < 1:515185/150‑1 (MQ=255) gACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTg > 1:977448/1‑150 (MQ=255) cGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCt < 1:1115297/150‑1 (MQ=255) cccGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGt > 1:1218665/1‑150 (MQ=255) cGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCa < 2:1393254/150‑1 (MQ=255) cGGCACAGCATCGGTGGGTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCGGTGGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCa < 1:450275/150‑1 (MQ=255) ggCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAg > 1:808125/1‑150 (MQ=255) ggtggtTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTcc < 2:977448/150‑2 (MQ=255) ttCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGtt < 1:126775/89‑1 (MQ=255) ttCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGtt > 2:126775/1‑89 (MQ=255) ttCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGt < 2:819304/150‑1 (MQ=255) ttCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGt > 2:817469/1‑150 (MQ=255) tCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTg > 2:67748/1‑150 (MQ=255) cGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGCATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTGc > 1:1373096/1‑150 (MQ=255) gCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAg < 2:363256/61‑1 (MQ=255) gCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAg > 1:363256/1‑61 (MQ=255) caGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTGCCGAGt > 1:1333152/1‑150 (MQ=255) ggAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTGCCGAGTGCTGCGCCTGt > 1:16579/1‑150 (MQ=255) gggcgGGTTCACCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTGCCATgttccgcgttgcctgcttcgcgggtgaacccgctcctacaaggtcagcggatagctgacgatcaggcgcgtctggtcgaga > 1:529558‑M1/3‑40 (MQ=255) gggcgGGTTCACCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTGCCATgttccgcgttgcctgcttcgcgggtgaacccgctcctacaaggtcagcggatagctgacgatcaggcgcgtctggtcgaga < 2:529558‑M1/119‑82 (MQ=255) gggTTCACCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTGCCATgttccgcgttgcctgcttcgcgggtgaacccgcccctacaaggtcagcggatagctgacgatcag > 2:1064280‑M1/1‑36 (MQ=255) gggTTCACCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTGCCATgttccgcgttgcctgcttcgcgggtgaacccgcccctacaaggtcagcggatagctgacgatcag < 1:1064280‑M1/101‑66 (MQ=255) aCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTGCCGAGTGCTGCGCCTGTTCGGCGGTCTg < 1:1140163/150‑1 (MQ=255) cccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTGCCGAGTGCTGCGCCTGTTCGGCGGTCTgg < 2:1333152/150‑1 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTGCCGAGtgctgc < 1:833493/131‑1 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTGCCGAGtgctgc > 2:833493/1‑131 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTGCCGAGTGCTGCGCCTGTTCGGCGGTCTGGt > 1:359793/1‑150 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTGCCGAGTGCTGCGCCTGTTCGGCGGTCTGGt > 1:1301950/1‑150 (MQ=255) gcgAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTGCCGAGTGCTGCGCCTGTTCGGCGGTCTGGTCg < 2:16579/150‑1 (MQ=255) acCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTGCCGAGTGCTGCGCCTGTTCGGCGGTCTGGTCGGCCAGt > 1:451013/1‑150 (MQ=255) gCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGAGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCGCAGCAGTGCCGAGTGCTGCGCCTGTTCGGCGGTCTGGTCGGCCAGTTCgg < 2:197721/150‑1 (MQ=255) | CCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGGACCGGGCTGGACGCGCATCAGTGGTTCGACACAGGCATCGACGGCCCGGCACAGCATCGGTGGTTCGGCACAGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCAGCGGAAGTCTCGAGCTTCAGCGGTTGAAGCGCTCCACCAGCGAATACTGGCTACCCGCCGTGCTGGTCAGTTCTTCGCTCAGCAGTGCCGAGTGCTGCGCCTGTTCGGCGGTCTGGTCGGCCAGTTCGG > NC_002947/2406861‑2407154 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |