| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,560,509 | T→A | 7.9% | L143Q (CTG→CAG) | PP_2243 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,560,509 | 0 | T | A | 7.9% | 190.8 / 7.0 | 63 | L143Q (CTG→CAG) | PP_2243 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/26); new base A (2/3); total (34/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.85e-01 | |||||||||||
CGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTT > NC_002947/2560363‑2560654 | cGACCTTCTGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCtggctggc < 1:61645/150‑1 (MQ=255) gACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTggcg > 1:914894/1‑150 (MQ=255) gACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTggcg > 1:549354/1‑150 (MQ=255) cTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGcc > 1:933641/1‑150 (MQ=255) gCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGa < 1:715676/150‑1 (MQ=255) cGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGAc < 2:914894/150‑1 (MQ=255) cGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCAAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCtggcgc < 1:440693/150‑6 (MQ=255) gTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGGATGGATGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCAGGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCGTTCTACa > 2:813128/1‑150 (MQ=255) gCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACCGGcc > 2:421655/1‑150 (MQ=255) gCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGcc > 2:463888/1‑150 (MQ=255) tgtgtCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGa < 2:810667/150‑1 (MQ=255) cGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAc‑tggc < 1:463888/150‑1 (MQ=255) gCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGCGTCGTTGGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAc‑tggctggggtt > 1:41613/1‑146 (MQ=255) aCTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGac < 2:516057/150‑1 (MQ=255) cAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGacccac < 2:1281985/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCg > 2:992288/1‑150 (MQ=255) gAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTggcg > 1:237292/1‑105 (MQ=255) gAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTggcg < 2:237292/105‑1 (MQ=255) gAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGa < 1:499443/148‑1 (MQ=255) gAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGa > 2:499443/1‑148 (MQ=255) aGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATgcgcg > 1:826396/1‑150 (MQ=255) cGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCa > 2:63036/1‑150 (MQ=255) tGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGc < 2:933641/150‑1 (MQ=255) gCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTg > 1:1399523/1‑150 (MQ=255) ccGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCt < 2:434507/90‑1 (MQ=255) ccGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCt > 1:434507/1‑90 (MQ=255) cGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTg > 2:911955/1‑148 (MQ=255) cGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTg < 1:911955/148‑1 (MQ=255) cGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGt > 2:316647/1‑150 (MQ=255) gAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTa < 1:366189/150‑1 (MQ=255) tGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTc < 2:472117/129‑1 (MQ=255) tGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTc > 1:472117/1‑129 (MQ=255) tGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAg < 2:826396/150‑1 (MQ=255) gCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCAt > 1:353851/1‑126 (MQ=255) gCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCAt < 2:353851/126‑1 (MQ=255) aGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTg < 2:909338/150‑1 (MQ=255) ggATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTgg < 2:549354/150‑1 (MQ=255) ggATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTgg < 1:63036/150‑1 (MQ=255) tCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCCTGCTGGAGCAGGTGcccggcgg > 2:659448/1‑143 (MQ=255) cGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTc > 2:702373/1‑150 (MQ=255) gCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCg > 2:1297417/1‑150 (MQ=255) cAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTgg < 1:116024/128‑1 (MQ=255) cAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTgg > 2:116024/1‑128 (MQ=255) cAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGAt < 2:1027912/150‑1 (MQ=255) tGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAg > 2:239006/1‑150 (MQ=255) gCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCgg < 1:1297417/150‑1 (MQ=255) gCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGATATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGCCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCgg < 2:41613/150‑1 (MQ=255) gCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGtgctg < 2:1389733/150‑1 (MQ=255) tgagatATGCCAGTGCCAGGCCGCTTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGcc > 2:1380258/6‑150 (MQ=255) tGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAg > 1:947249/1‑103 (MQ=255) tGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAg < 2:947249/103‑1 (MQ=255) tGCGCTATGCCAGCGCCAGACCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGcc > 2:814943/1‑150 (MQ=255) gcTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGcc > 1:1419142/1‑147 (MQ=255) gcTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGcc < 2:1419142/147‑1 (MQ=255) cTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCG‑CCGGCCCGGCCACTTCTTTGGCGGTGACCCACCCGAGGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTg > 1:603037/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTCCGACAGGCCGGGTGAC‑TGTCTGGCTGTGACGCACCCGCTCGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGAGGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCTACGTGCTGCCGCTGTCAc < 1:813128/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACg > 2:23935/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTg > 2:589359/1‑87 (MQ=255) cAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTg < 1:589359/87‑1 (MQ=255) gcCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGc > 2:1052554/1‑150 (MQ=255) cgaaGGCCGCCAGCCAGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAg < 2:718554/106‑1 (MQ=255) cgaaGGCCGCCAGCCAGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAg > 1:718554/4‑109 (MQ=255) ccAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCGTGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCa > 1:502692/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAAt > 1:126200/1‑150 (MQ=255) tggctggcGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAg > 2:1243129/1‑78 (MQ=255) tggctggcGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAg < 1:1243129/78‑1 (MQ=255) tggctggcGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCttt > 2:752242/1‑150 (MQ=255) | CGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGAC‑TGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTT > NC_002947/2560363‑2560654 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |