Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,685,639 | T→A | 7.1% | Q709L (CAG→CTG) | PP_2354 ← | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,685,639 | 0 | T | A | 7.1% | 207.0 / 3.4 | 67 | Q709L (CAG→CTG) | PP_2354 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/35); new base A (3/2); total (30/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.50e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGTAAGAAACACCACCGGCAGGCGGGGATACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCACTGCTGGCACGGGTTCGTTCACC > NC_002947/2685491‑2685782 | ggTAAGAAACACCACCGGCAGGCGGGGATACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTg > 1:224138/1‑150 (MQ=255) aaaCACCACCGGCAGGCGGGGATACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCAc < 1:110321/150‑1 (MQ=255) aaCACCACCGGCAGGCGGGGATACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCAGCCGCAca < 2:1309294/150‑2 (MQ=255) acacCACCGGCAGGCGGGGATACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCt < 1:475593/150‑1 (MQ=255) ccaccGGCAGGCGGGGATACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGt < 2:224138/150‑1 (MQ=255) ggCAGGCGGGGATACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCg > 1:561929/1‑150 (MQ=255) gCGGGGATACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTg < 1:606512/150‑1 (MQ=255) ggggATACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGc < 1:349661/150‑1 (MQ=255) aTACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCa > 2:27941/1‑128 (MQ=255) aTACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCa < 1:27941/128‑1 (MQ=255) aTACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTaa < 1:153486/150‑1 (MQ=255) aTACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTaa < 2:561929/150‑1 (MQ=255) aTACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTaa < 1:873627/150‑1 (MQ=255) cGTTCACGTGCAGCCGGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCGTGACAAAATCCGTCTGCAGCAGATAAATTTAGTCAGCCACCAAGGCCAAGTCCCACTCGTAACTCTGTACCAGCCACACCTGGTAACCGTATTGGAGTAacaga > 2:6746/1‑148 (MQ=255) gTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACAt > 1:559635/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCCCCATTGCAATCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATc < 2:944724/150‑1 (MQ=255) ccagcGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACGTCGGAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGt > 2:1404374/1‑150 (MQ=255) ttGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAg < 2:801708/150‑1 (MQ=255) tgCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAggtg < 2:559635/150‑1 (MQ=255) cACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGc < 1:559794/114‑1 (MQ=255) cACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGc > 2:559794/1‑114 (MQ=255) aCCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGgtc < 2:675426/150‑1 (MQ=255) cATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGgtcgt > 2:425165/1‑150 (MQ=255) gggCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACcag < 2:785964/150‑1 (MQ=255) gggCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACcag > 2:492725/1‑150 (MQ=255) gCATGGCGATATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACcagca > 1:903989/1‑150 (MQ=255) cGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCg > 1:1264882/1‑150 (MQ=255) aTCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTTGCGTAACACATCTCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCTTCCACCAGCAGTACCGtccc > 2:654839/1‑147 (MQ=255) aTCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACTAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCg < 1:1404374/150‑1 (MQ=255) aTCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCg < 2:1264882/150‑1 (MQ=255) cagtcagCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGt < 2:214259/150‑1 (MQ=255) tcagCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTAATGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTAt > 1:854075/1‑150 (MQ=255) agcagcagGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTAATGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATgg < 2:854075/150‑1 (MQ=255) gcagcagGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGgtcgtc < 2:597415/121‑1 (MQ=255) gcagcagGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGgtcgtc > 1:597415/1‑121 (MQ=255) gcagGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGc > 2:403099/1‑150 (MQ=255) gTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTc < 1:403099/150‑1 (MQ=255) aaTGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCt < 1:1375167/150‑1 (MQ=255) aTGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTg > 2:601526/1‑150 (MQ=255) cgtcATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTaa < 1:836310/70‑1 (MQ=255) cgtcATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTaa > 2:836310/1‑70 (MQ=255) gtcATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCga < 1:130462/150‑1 (MQ=255) tcATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATg < 1:915860/84‑1 (MQ=255) tcATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATg > 2:915860/1‑84 (MQ=255) aTCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAggtg < 2:689448/96‑1 (MQ=255) aTCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAggtg > 1:689448/1‑96 (MQ=255) tCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCGGCTTTCGCTGATCgactga > 2:936743/1‑150 (MQ=255) gCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACcag < 1:1093463/106‑1 (MQ=255) gCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACcag > 2:1093463/1‑106 (MQ=255) aGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCa > 1:136029/1‑150 (MQ=255) aaTGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCCGAATTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCActgct < 1:36789/150‑1 (MQ=255) aaTGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCActgct < 1:601526/150‑1 (MQ=255) aTGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCActgctg < 1:741049/150‑1 (MQ=255) tGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCActgct > 2:926082/1‑144 (MQ=255) tGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCActgct < 1:926082/144‑1 (MQ=255) gCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTCGCCGTCGTCCACCAGCAGTACCATCCAAGTAAGCCGACTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCACTGCTGGCACgg < 1:248265/150‑1 (MQ=255) cTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCACTGCTGGCACggg > 2:248265/1‑150 (MQ=255) gccgcTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCgactgact > 2:1007388/1‑129 (MQ=255) gccgcTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCgactgact < 1:1007388/129‑1 (MQ=255) gccgcTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCACTGCTGGCACGGgttc > 2:443377/1‑150 (MQ=255) gccgcTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCACTGCTGGCACGGgttc < 2:136029/150‑1 (MQ=255) ccaggtgCGCCAGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGcc < 1:1083669/102‑1 (MQ=255) ccaggtgCGCCAGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGcc > 2:1083669/5‑106 (MQ=255) cTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCACTGCTGGCACGGgttcgttc < 1:443377/150‑1 (MQ=255) aggtgCGCCAGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCACTGCTGGCACGGgttcgttc > 1:936377/3‑150 (MQ=255) tgtgCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCACTGCTGGCACGGGTTCGTTCa > 2:1331614/1‑150 (MQ=255) tgCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGGACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCACTGCTGGCACGGGTTCGTTCAcc > 1:400603/1‑150 (MQ=255) | GGTAAGAAACACCACCGGCAGGCGGGGATACCGTTCGCGGGCAGCCAGCGCCAGTTGTGCACCATTGAACTCGGGCATGGCGAAATCAGTCAGCAGCAGGTCAATGTCGTCATCCAGCAAGGCCAATGCCTGCTCGCCGCTGTGCGCCTGGCGCACCTGGTAGCCGTATTGGCGTAACACATCGCCTAGCATGTCGCGCACCAGGTGGTCGTCGTCCACCAGCAGTACCGTGCGGTTATGGCCGCTTTCGCTGATCGACTGACTGAGCACTGCTGGCACGGGTTCGTTCACC > NC_002947/2685491‑2685782 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |