| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,760,361 | T→C | 6.9% | N209D (AAC→GAC) | PP_2413 ← | GGDEF domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,760,361 | 0 | T | C | 6.9% | 210.6 / 4.0 | 72 | N209D (AAC→GAC) | PP_2413 | GGDEF domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/37); new base C (3/2); total (33/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 | |||||||||||
CCATCTGGTCGATCAGCGCATTGCCCTCCACCACCGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCAGTGGACGGCGTTCGTGCAGGGCTTCC > NC_002947/2760214‑2760509 | ccATCTGGTCGATCAGCGCATTGCCCTCCACCACCGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGc > 1:854546/1‑150 (MQ=255) tCTGGTCGATCAGCGCATTGCCCTCCACCACCGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGtt > 1:1193105/1‑150 (MQ=255) tCTGGTCGATCAGCGCATTGCCCTCCACCACCGAGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGtt > 2:641549/1‑150 (MQ=255) gTCGATCAGCGCATTGCCCTCCACCACCGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACg > 1:1409208/1‑150 (MQ=255) gATCAGCGCATTGCCCTCCACCACCGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAg < 2:1193105/150‑1 (MQ=255) aTCAGCGCATTGCCCTCCACCACCGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAgg < 2:677099/150‑1 (MQ=255) gcgcATTGCCCTCCACCACCGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACa > 1:906772/1‑150 (MQ=255) cATTGCCCTCCACCACCGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGc < 1:120025/150‑1 (MQ=255) ccTCCACCACCGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACTGTGGTAGGGCTTATCTTTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGccac < 2:37062/150‑1 (MQ=255) ccTCCACCACCGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGccac > 1:224262/1‑150 (MQ=255) ccTCCACCACCGTGCCTACCCGCCCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGccac > 1:110229/1‑150 (MQ=255) caccacCGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACa < 1:1422304/137‑1 (MQ=255) caccacCGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACa > 2:1422304/1‑137 (MQ=255) caccGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATa > 2:562680/1‑150 (MQ=255) caccGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACCCAGGTACAGGCTGCCACCCACATa > 2:318218/1‑150 (MQ=255) ccGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGc > 1:238188/1‑128 (MQ=255) ccGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGc < 2:238188/128‑1 (MQ=255) ccGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCg > 2:90859/1‑150 (MQ=255) ccGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCg > 2:1056980/1‑150 (MQ=255) ccGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTCGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCg > 2:631597/1‑150 (MQ=255) tATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTcgc > 2:784202/1‑150 (MQ=255) aTGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTcgcg < 2:1409208/150‑1 (MQ=255) gAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGAt > 2:338908/1‑150 (MQ=255) aCAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAACATgg < 2:595710/150‑1 (MQ=255) gcagGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGtt > 2:317044/1‑150 (MQ=255) gcagGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATAAAGGACCGAACCGTCTGGGGATAAATGCTCGCCCAGCAGGCCGTTGCGGACCTCATAGATATGCACCTGCAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGtt > 1:1033538/1‑150 (MQ=255) gTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACa < 1:78070/150‑1 (MQ=255) ggTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAg < 1:1365168/106‑1 (MQ=255) ggTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAg > 2:1365168/1‑106 (MQ=255) cGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGAccacca < 1:306078/150‑1 (MQ=255) gACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTCGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGac < 1:244764/144‑1 (MQ=255) gACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTCGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGac > 2:244764/1‑144 (MQ=255) aCCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAgg < 1:90859/150‑1 (MQ=255) aCCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAgg < 2:1033538/150‑1 (MQ=255) ccACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGt > 2:849661/1‑150 (MQ=255) aTACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTCGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTc < 1:631597/150‑1 (MQ=255) tACAGGTACGAACCGTCCTTGAAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCg < 1:784202/150‑1 (MQ=255) aGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTCCAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGgcc < 2:826006/150‑1 (MQ=255) cGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGa < 2:110229/150‑1 (MQ=255) gAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGGTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGAc > 2:910406/1‑150 (MQ=255) aaCCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACa < 1:427861/150‑1 (MQ=255) aCCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAg > 1:466159/1‑150 (MQ=255) cGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACGGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGt > 1:617028/1‑150 (MQ=255) cGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGt < 2:854546/150‑1 (MQ=255) gTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGAACACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTa < 1:338908/150‑1 (MQ=255) tCCTTGTAGAAATTCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAg < 2:670687/150‑1 (MQ=255) tCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAg > 2:210811/1‑150 (MQ=255) cTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGc < 2:1034300/62‑1 (MQ=255) cTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGCTACAGGCTGc > 1:1034300/1‑62 (MQ=255) ttGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGgccgc < 2:481157/137‑1 (MQ=255) ttGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGgccgc > 1:481157/1‑137 (MQ=255) gTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGt < 1:641549/150‑1 (MQ=255) tAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTg > 1:446959/1‑150 (MQ=255) tAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATAAACCAAATAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTg < 1:318218/150‑1 (MQ=255) aTGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAAc < 1:1056980/150‑1 (MQ=255) aTGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAAc < 2:466159/150‑1 (MQ=255) gCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCa < 1:1198387/150‑1 (MQ=255) gCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCa < 1:849661/150‑1 (MQ=255) cTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATgg < 2:1272753/92‑1 (MQ=255) cTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATgg > 1:1272753/1‑92 (MQ=255) tCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCAGt < 2:446959/150‑1 (MQ=255) tCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCAGt < 1:910406/150‑1 (MQ=255) cccAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCAGTGGa < 2:357427/150‑1 (MQ=255) gCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCAGTGGACGGCGTTc > 2:681198/1‑150 (MQ=255) gCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCAGTGGACGGCGTTc < 2:906772/150‑1 (MQ=255) gAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTg < 2:60414/124‑1 (MQ=255) gAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTg > 1:60414/1‑124 (MQ=255) gAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCAGTGGACGGCGTTCGTGCAg > 1:746780/1‑150 (MQ=255) gAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCAGTGGACGGCGTTCGTGCAg < 1:210811/150‑1 (MQ=255) aGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCAGTGGACGGCGTTCGTGCAgg < 1:317044/150‑1 (MQ=255) gATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCAGTGGACGGCGTTCGTGCa > 1:1369333/1‑146 (MQ=255) gATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCAGTGGACGGCGTTCGTGCa < 2:1369333/146‑1 (MQ=255) ttGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCAGTGGACGGCGTTCGTGCAGGGCTTcc > 1:762763/1‑150 (MQ=255) | CCATCTGGTCGATCAGCGCATTGCCCTCCACCACCGTGCCTACCCGCTCGCTATGAGGGTGGTACAGCAGGCGTCGGTTGCGGTCGACCACATACAGGTACGAACCGTCCTTGTAGAAATGCTCGCCCAGCAGGCTGTTGAGGATGTTGCGTTCACGCAGGTACAGGCTGCCACCCACATACCCCAGGTAGCGGCCGTCGCGATCGAAAATGGGTTGCGACAGCGCGACCACCAGGTTGTCGGCCGCCGACAGGTAGGGCGTGGAAACCAGTGGACGGCGTTCGTGCAGGGCTTCC > NC_002947/2760214‑2760509 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |