| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,790,109 | T→A | 6.7% | Q61L (CAG→CTG) | PP_2442 ← | DUF480 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,790,109 | 0 | T | A | 6.7% | 240.5 / 6.4 | 74 | Q61L (CAG→CTG) | PP_2442 | DUF480 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/36); new base A (2/3); total (35/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
CCGCAGGAACATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCGAGAACGCGGATCTCGATGCTGTTGAAG > NC_002947/2789961‑2790258 | ccGCAGGAACATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTg > 1:844238/1‑150 (MQ=255) cGCAGGAACATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTgg > 2:1284238/1‑150 (MQ=255) gCAGGAACATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGc > 2:645235/1‑150 (MQ=255) cAGGAACATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGcc < 1:1284238/150‑1 (MQ=255) ggAACATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCtt < 1:736182/150‑1 (MQ=255) aaCATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTTGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCGGCCCTTCGAGGGCGCGCGAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTgg < 2:559164/150‑1 (MQ=255) aaCATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGTACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCAGGTCGGCCAGGCCTTgc < 2:240402/150‑2 (MQ=255) aaCATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTgg < 2:850673/150‑1 (MQ=255) cATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCCCAAGGCCAGGTCGGCCAGGCCTTgcgc < 2:482487/150‑4 (MQ=255) tCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGa < 1:251843/150‑1 (MQ=255) aGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAgg < 1:869818/150‑1 (MQ=255) aGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAgg > 2:319673/1‑150 (MQ=255) cATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTtcat > 2:1127316/1‑150 (MQ=255) cAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTc > 1:1247181/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGc < 2:844238/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGc > 2:795177/1‑150 (MQ=255) aCCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTtca > 1:803564/1‑127 (MQ=255) aCCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTtca < 2:803564/127‑1 (MQ=255) cAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCgg > 1:1408854/1‑139 (MQ=255) cAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCgg < 2:1408854/139‑1 (MQ=255) cAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTg < 1:645235/150‑1 (MQ=255) cAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTg < 1:273771/150‑1 (MQ=255) cTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGtt < 1:988676/150‑1 (MQ=255) ccAGTGCCTTGTCTACCCGAGGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGc < 1:555484/150‑1 (MQ=255) cAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTtca < 2:734880/119‑1 (MQ=255) cAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTtca > 1:734880/1‑119 (MQ=255) aGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAg < 1:1127316/150‑1 (MQ=255) tGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGa < 1:227751/150‑1 (MQ=255) tCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGAcc > 2:1394392/1‑150 (MQ=255) tACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAg > 2:212421/1‑150 (MQ=255) aCCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAgg < 1:1008864/150‑1 (MQ=255) cccGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCAc < 1:320341/109‑1 (MQ=255) cccGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCAc > 2:320341/1‑109 (MQ=255) cccGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTg > 2:1394756/1‑122 (MQ=255) cccGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTg < 1:1394756/122‑1 (MQ=255) ccGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGtcttct < 1:1275458/128‑1 (MQ=255) ccGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGtcttct > 2:1275458/1‑128 (MQ=255) cGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCtt > 2:1297440/1‑91 (MQ=255) cGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCtt < 1:1297440/91‑1 (MQ=255) tCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTTAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAgg < 2:1052411/150‑1 (MQ=255) tCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAgg < 1:763051/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCAGGTCGGCCAGGCCTTgc > 2:1187893/1‑84 (MQ=37) ccAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCAGGTCGGCCAGGCCTTgc < 1:1187893/85‑2 (MQ=37) ggCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTa > 1:625735/1‑150 (MQ=255) gCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAg > 1:421943/1‑150 (MQ=255) cccATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCggg > 1:961611/1‑150 (MQ=255) ccATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGc > 2:304092/1‑150 (MQ=255) ccATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGc > 2:1279447/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCtggtg < 2:421943/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGc > 1:816161/1‑150 (MQ=255) aGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCAc < 1:975820/71‑1 (MQ=255) aGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCAc > 2:975820/1‑71 (MQ=255) ggCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCt < 1:1279447/150‑1 (MQ=255) ggCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCt > 2:69781/1‑150 (MQ=255) ggTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTc < 2:4711/132‑1 (MQ=255) ggTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTc > 1:4711/1‑132 (MQ=255) tCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCtttt < 2:1427454/150‑1 (MQ=255) tCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCtttt < 2:816161/150‑1 (MQ=255) cccTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGc > 1:1283590/1‑114 (MQ=255) cccTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGc < 2:1283590/114‑1 (MQ=255) ccTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCa < 2:1104713/150‑1 (MQ=255) tGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGc < 1:1394392/150‑1 (MQ=255) cTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTc > 2:930291/1‑58 (MQ=255) cTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTc < 1:930291/58‑1 (MQ=255) cTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGc > 2:1256638/1‑150 (MQ=255) cTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGGCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGc > 1:1327195/1‑150 (MQ=255) ttCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCa < 2:906722/78‑1 (MQ=255) ttCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCa > 1:906722/1‑78 (MQ=255) ttCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGTCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGcc > 1:567210/1‑150 (MQ=255) aGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAgg < 2:567555/96‑1 (MQ=255) aGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAgg > 1:567555/1‑96 (MQ=255) tcacccAAGGCCAGGTCGGCCAGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCCTCCCGTGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCGAGAAcg > 2:187223/6‑150 (MQ=255) ccTGGCCGAACTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCGAGAACGCGGATCTCGa < 2:1327195/150‑1 (MQ=255) ggCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCGAGAACGCGGATCTCGATGc > 1:675141/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCGAGAACGCGGATCTCGATGCTGTTGAAg > 2:714812/1‑150 (MQ=255) | CCGCAGGAACATCAGGCCCATCAGCACCAACTGCGCTGGCACCAGCTCCAGTGCCTTGTCTACCCGATGTTCCCAGCGGTCGGCACGGCTGCCCATCTGCAGGCGGGTCATGCCCTGACCTTCGAGGGCGCGCAAGGCCTGGCCGACCTGGCCTTGGGTGAGGTTCATCACCGGCTCGCGGCTGGTCTTCTGGTTGCAGGCCAGGACCAGGGCATTGAGGGTCAGCGGGTAGCTTTCCGGGCTGGTGGCCTGCTTTTCGATCAGCGAGCCGAGAACGCGGATCTCGATGCTGTTGAAG > NC_002947/2789961‑2790258 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |