| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 269,750 | G→C | 7.8% | T68T (ACC→ACG) | desA ← | delta‑9 fatty acid desaturase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 269,750 | 0 | G | C | 7.8% | 234.4 / 10.4 | 77 | T68T (ACC→ACG) | desA | delta‑9 fatty acid desaturase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/37); new base C (3/3); total (37/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.27e-01 | |||||||||||
GCGCAGGGTTTCGGGGTTGCGCGCCTCTTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGCTGACAATGGTCACGTGGGTCATCAACAG > NC_002947/269612‑269899 | gcgcAGGGTTTCGGGGTTGCGCGCCTCTTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTcgcg < 1:189703/150‑1 (MQ=255) cgcAGGGTTTCGGGGTTGCGCGCCTCTTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCgg < 1:921265/150‑1 (MQ=255) cgcAGGGTTTCGGGGTTGCGCGCCTCTTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCgg < 2:1387900/150‑1 (MQ=255) cgcAGGGTTTCGGGGTTGCGCGCCTCCTCACGGTACAGCTCGGCACCAAAGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTCCACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCgg < 1:797414/150‑1 (MQ=255) gcAGGGTTTCGGGGTTGCGCGCCTCTTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCggg > 2:983293/1‑150 (MQ=255) aGGGTTTCGGGGTTGCGCGCCTCTTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGgtg < 1:1125536/150‑1 (MQ=255) gTTTCGGGGTTGCGCGCCTCTTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGCACACCGGGCTGTGCGGGTAGCCGGGGATATAGCCACAGGCGTGGTGGTGGGTGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGttt > 1:1027687/1‑149 (MQ=255) tttCGGGGTTGCGCGCCTCTTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACCGCCGTCCAcc > 2:421474/1‑137 (MQ=255) tttCGGGGTTGCGCGCCTCTTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACCGCCGTCCAcc < 1:421474/138‑2 (MQ=255) gctccTCTTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTTGGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTca > 2:112028/4‑150 (MQ=255) gcgcCTCTTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTca > 1:16491/1‑150 (MQ=255) gcgcCTCTTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTca > 1:516527/1‑150 (MQ=255) tctTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTcagccac < 1:924964/150‑1 (MQ=255) aCGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTcagccacagcca < 2:1364390/150‑1 (MQ=255) 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ttGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTg > 2:663675/1‑150 (MQ=255) caCTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTca > 1:743675/1‑113 (MQ=255) caCTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTca < 2:743675/113‑1 (MQ=255) tgtgCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCTTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCAtt < 2:768337/150‑1 (MQ=255) tgtgCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCAtt < 2:133532/150‑1 (MQ=255) tgtgCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGGGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTTGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCAtt < 1:270803/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAg > 2:1415503/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGa > 2:352785/1‑147 (MQ=255) ccAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGa < 1:352785/147‑1 (MQ=255) cAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCt < 1:647339/92‑1 (MQ=255) cAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCt > 2:647339/1‑92 (MQ=255) cAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGa < 1:692025/134‑1 (MQ=255) cAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGa > 2:692025/1‑134 (MQ=255) cAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCAt > 1:347201/1‑143 (MQ=255) cAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCAt < 2:347201/143‑1 (MQ=255) aGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTgcg > 1:149092/1‑94 (MQ=255) aGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTgcg < 2:149092/94‑1 (MQ=255) gCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCGGCTTGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAg < 2:45364/150‑1 (MQ=255) ccTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGt > 2:270392/1‑70 (MQ=255) ccTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGt < 1:270392/70‑1 (MQ=255) ccTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCAc < 1:690097/74‑1 (MQ=255) ccTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCAc > 2:690097/1‑74 (MQ=255) ccTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTCGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAggg > 2:1031280/1‑150 (MQ=255) tACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCgg > 2:1299311/1‑150 (MQ=255) acCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTgc > 2:968160/1‑150 (MQ=255) tgCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAg < 1:112028/150‑1 (MQ=255) gggTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGa < 2:516527/150‑1 (MQ=255) ggtcgGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCa < 2:937883/149‑1 (MQ=255) gtcgGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAg < 1:663675/150‑1 (MQ=255) gtcgGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAg < 1:983293/150‑1 (MQ=255) tcgGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTgcgc < 1:66909/134‑1 (MQ=255) tcgGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTgcgc > 2:66909/1‑134 (MQ=255) gcgGGGGTTTCGCACGTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCAAGAAGAGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTCAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAgg < 1:1299311/149‑1 (MQ=255) ggggTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGGGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAg > 2:4076/1‑150 (MQ=255) tttCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCg > 1:173416/1‑150 (MQ=255) cGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGcgcg < 2:462243/125‑1 (MQ=255) cGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGcgcg > 1:462243/1‑125 (MQ=255) cGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGa > 2:894518/1‑150 (MQ=255) aCTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCCTTTAGCGCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGc > 2:1107962/1‑150 (MQ=255) aCTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGTAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGc < 1:1107962/150‑1 (MQ=255) ttGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTca < 2:558207/58‑1 (MQ=255) ttGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTca > 1:558207/1‑58 (MQ=255) gtggtgCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGCTGACAAt > 1:72204/1‑150 (MQ=255) ggtgCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGATCGGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAATGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGCTAGACCGTGACGCTGACAATgg > 2:245219/1‑150 (MQ=255) gtgCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGGGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGCTGACAATGGt > 2:122287/1‑150 (MQ=255) gcgagTGGACCGCCGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCg < 2:1390040/96‑1 (MQ=255) gcgagTGGACCGCCGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCg > 1:1390040/5‑100 (MQ=255) gCGGGGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTTCAAGAACCGGAGCGCGTAGTTGCGATGCAGGTAGACCGTGACGCTGACAATGGTCACGTg < 1:388851/150‑1 (MQ=255) ggTGGACGGCGGTCCACTCGCAAGTATTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGCTGACAATGGTCACGTggg > 2:192850/1‑150 (MQ=255) agTGGACCGCCGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGa < 2:339284/105‑1 (MQ=255) agTGGACCGCCGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGa > 1:339284/2‑106 (MQ=255) gTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGCt > 1:264199/1‑132 (MQ=255) gTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGCt < 2:264199/132‑1 (MQ=255) ggcggTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCTGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGCTGACAATGGTCACGTGGGTCATCaa < 2:1027687/150‑1 (MQ=255) cggTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGCTGACAATGGTCACGTGGGTCATCAACa < 1:1415503/150‑1 (MQ=255) ggTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGCTGACAAt < 1:378289/129‑1 (MQ=255) ggTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGCTGACAAt > 2:378289/1‑129 (MQ=255) ggTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGCTGACAATGGTCACGTGGGTCATCAACag > 2:10043/1‑150 (MQ=255) | GCGCAGGGTTTCGGGGTTGCGCGCCTCTTCACGGTACAGCTCGGCACCCTTGCGCAGCACTGTGCCCAGGCCCTTGTACACCGGGCTGTGCGGGTCGTCGGGGGTTTCGCACTTGGCGTGGTGCTTGCGGTGGACGGCGGTCCACTCGCGGGTGTTCTGCGCCGTGGTCAGCCACAGCCAGAAGCGGAAGAAGTGCTTGAGCGCGCCATTGAGCTCCAGGGCCCGGTGCGCGGAGTAGCGATGCAGGTAGACCGTGACGCTGACAATGGTCACGTGGGTCATCAACAG > NC_002947/269612‑269899 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |