| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,896,849 | A→T | 5.3% | Q42L (CAG→CTG) | PP_2551 → | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,896,849 | 0 | A | T | 5.3% | 239.0 / 3.8 | 75 | Q42L (CAG→CTG) | PP_2551 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/36); new base T (2/2); total (37/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.48e-01 | |||||||||||
CCGCAGGGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTGCACGCGCTGCGCCAGCCCGCCAT > NC_002947/2896710‑2896993 | ccGCAGGGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCAc > 1:1093500/1‑150 (MQ=255)ccGCAGGGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCAGCTGCCGGCTCag < 2:803537/150‑2 (MQ=255) cTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGc < 1:581363/150‑1 (MQ=255) cTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGc < 1:384399/150‑1 (MQ=255) tGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCg > 1:881535/1‑150 (MQ=255) cccACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCgatgat > 1:574911/1‑150 (MQ=255) cccACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCgatgat > 2:702173/1‑150 (MQ=255) cACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATcc > 1:785444/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGtt < 2:344942/150‑1 (MQ=255) tccctcAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTg > 1:1024935/1‑150 (MQ=255) cctcAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGAGTCGGGTTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTgcg > 2:629752/1‑150 (MQ=255) ctcAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGaa < 1:849638/123‑1 (MQ=255) ctcAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGaa > 2:849638/1‑123 (MQ=255) ctcAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATc > 2:202597/1‑136 (MQ=255) ctcAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATc < 1:202597/136‑1 (MQ=255) tcAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATcc > 2:887603/1‑136 (MQ=255) tcAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATcc < 1:887603/136‑1 (MQ=255) tcAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTGCGATGATCCGTTGCTGGTGCGcc > 2:74719/1‑150 (MQ=255) aGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTTCCCGAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCCCCTGCGTAAAGCGTCTTATGATTGGTTGCTGGTGCGCCaa > 1:602471/1‑150 (MQ=255) aGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCga > 1:5162/1‑128 (MQ=255) aGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCga < 2:5162/128‑1 (MQ=255) cTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAggg > 1:709295/1‑150 (MQ=255) tCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGc > 1:1349736/1‑150 (MQ=255) cGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCg < 1:54160/150‑1 (MQ=255) ccACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTg > 1:1010405/1‑149 (MQ=255) ccACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTg < 2:1010405/149‑1 (MQ=255) aCCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTg > 2:847274/1‑147 (MQ=255) aCCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTg < 1:847274/147‑1 (MQ=255) aCCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGtt > 2:165889/1‑150 (MQ=255) cTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTAt < 1:789057/150‑1 (MQ=255) cTGCGCACCCTCCACCGCCTGTTTCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTAt < 2:1150071/150‑1 (MQ=255) gcgcACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGGGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTAtgt < 1:145940/150‑1 (MQ=255) cgcACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTAtgtg < 1:614005/150‑1 (MQ=255) ccTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAg > 1:1266984/1‑150 (MQ=255) ccTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAg > 2:1009100/1‑150 (MQ=255) ccTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCAGCTGCCGGCTCag > 2:965178/1‑90 (MQ=255) ccTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCAGCTGCCGGCTCag < 1:965178/91‑2 (MQ=255) caccTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACAt < 1:833091/150‑1 (MQ=255) cccTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCAGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATg < 2:1022821/149‑1 (MQ=255) gtGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGcc > 2:977031/2‑150 (MQ=255) cTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATc < 1:480824/103‑1 (MQ=255) cTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATc > 2:480824/1‑103 (MQ=255) cAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCtt < 2:1056881/132‑1 (MQ=255) cAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCtt > 1:1056881/1‑132 (MQ=255) gCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCt < 2:709295/150‑1 (MQ=255) gCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCt > 1:353970/1‑150 (MQ=255) cTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCTATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTg < 1:1382618/150‑1 (MQ=255) ttAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTgg > 2:1384000/1‑150 (MQ=255) tAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGt < 2:1266984/150‑1 (MQ=255) aaaaaCCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTc < 2:1349736/150‑1 (MQ=255) aaaCCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGa < 2:1024935/150‑1 (MQ=255) aGCCACGCGGCCGAGCGGCTGGGTGTCAGCCAATCGTCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGATGGTGCGCCAAGGGCGGGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTg < 1:317058/150‑1 (MQ=255) aGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTg < 2:785444/150‑1 (MQ=255) aGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTg > 2:713091/1‑150 (MQ=255) gCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTgc < 2:1093500/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTg < 2:964469/86‑1 (MQ=255) aCGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTg > 1:964469/1‑86 (MQ=255) gcgGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTg > 1:753303/1‑132 (MQ=255) gcgGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTg < 2:753303/132‑1 (MQ=255) cgcCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCgaa < 2:841512/150‑1 (MQ=255) ccTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCgaaga > 2:1117067/1‑150 (MQ=255) tGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGaa > 2:492269/1‑104 (MQ=255) tGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGaa < 1:492269/104‑1 (MQ=255) tGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAAc < 2:602471/150‑1 (MQ=255) gtgtCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCg < 1:1090585/141‑1 (MQ=255) gtgtCAGCCAATCGGCCCGGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCg > 2:1090585/1‑141 (MQ=255) tCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCgatga > 2:8904/1‑55 (MQ=255) tCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCgatga < 1:8904/55‑1 (MQ=255) aGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGAGGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTGCAcgcg > 1:1258179/1‑150 (MQ=255) gCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCATGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTg < 1:337204/143‑1 (MQ=255) gCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCATGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTg > 2:337204/1‑143 (MQ=255) aaTCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTGCACGCGCTgc < 1:165889/150‑1 (MQ=255) tCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTGCACGCGCTgcgc < 1:713091/150‑1 (MQ=255) gtGAGCCAGCTGCCGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTGCACGCGCTGCGCCAGccc > 2:1213062/2‑150 (MQ=255) ccGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTGCACGCGCTGCGCCAGCCCGCCAt > 1:759493/1‑150 (MQ=255) | CCGCAGGGAGCCTGCATGAACCCCACCTTCGCCTCCCTCAGCCTCGCCCACCTGCGCACCCTCGACCACCTGTTGCAGCTTAAAAACCTCAGCCACGCGGCCGAGCGCCTGGGTGTCAGCCAATCGGCCCTGAGCCGGCAGCTGGCTCACCTGCGTGAAGCCTTCGATGATCCGTTGCTGGTGCGCCAAGGGCGTGGTTATGTGCTTAGCGAACATGCCGAAGCCCTGGTCGAGCCTTTGCGCCAGGTGCTCGAAGAACTGCACGCGCTGCGCCAGCCCGCCAT > NC_002947/2896710‑2896993 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |