| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,018,014 | A→T | 9.9% | S632C (AGC→TGC) | bcsB → | cellulose synthase and translocator subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,018,014 | 0 | A | T | 9.9% | 201.7 / 12.8 | 71 | S632C (AGC→TGC) | bcsB | cellulose synthase and translocator subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/31); new base T (3/4); total (36/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.69e-01 | |||||||||||
ACTTGCTGCTGATCGGCAGCCTGCCCGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGC > NC_002947/3017865‑3018163 | aCTTGCTGCTGATCGGCAGCCTGCCCGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCaa < 1:268462/150‑1 (MQ=255) tgctgcTGATCGGCAGCCTGCCCGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGTCCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCCGGGCCGCAGCTCATCCTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAagca < 2:108931/150‑1 (MQ=255) ctgctgATCGGCAGCCTGCCCGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCTTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGTAagcagc < 2:707589/150‑1 (MQ=255) tgctgATCGGCAGCCTGCCCGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGcc > 1:1200773/1‑150 (MQ=255) tgctgATCGGCAGCCTGCCCGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGcc > 2:496589/1‑150 (MQ=255) tgctgATCGGCAGCCTGCCCGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGcc > 1:231760/1‑150 (MQ=255) gctgATCGGCAGCCTGCCCGAGGCCCTGCGTGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCATCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGACGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGGGTTTCGATACTGAGCCAGTGGCTGTAAGCAGCcg > 2:627963/1‑150 (MQ=255) ctgATCGGCAGCCTGCCCGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCcgc > 2:257741/1‑150 (MQ=255) gATCGGCAGCCTGCCCGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCTTGCAGccaccg < 2:1184106/150‑5 (MQ=255) aTCGGCAGCCTGCCCGAGGCCCTGAACGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTg > 1:1261403/1‑150 (MQ=255) ggCAGCCTGCCCGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCg > 1:154996/1‑150 (MQ=255) ccTGCCCGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAg < 1:951522/150‑1 (MQ=255) ccGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCTTGCAGccac > 2:706961/1‑132 (MQ=255) ccGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCTTGCAGccac < 1:706961/134‑3 (MQ=255) ccGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCTTGCAGccac < 1:706568/134‑3 (MQ=255) ccGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCTTGCAGccac > 2:706568/1‑132 (MQ=255) ccGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGccc > 1:327504/1‑150 (MQ=255) cgaacccgcgACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGgcg > 2:23328/7‑150 (MQ=255) tGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGa < 2:614148/150‑1 (MQ=255) gACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGCCTGGTTGCTGAAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGACAGCGTTTCGATACTGTGCAGGGTGCTTGTAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCg < 1:739463/150‑1 (MQ=255) gACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCg > 1:243888/1‑150 (MQ=255) gACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCg < 1:1215998/150‑1 (MQ=255) aCGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCgg < 1:1235133/150‑1 (MQ=255) gcCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCAt < 2:1122283/150‑1 (MQ=255) gcCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCAt < 1:329794/150‑1 (MQ=255) cccGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATc > 2:1331287/1‑150 (MQ=255) cGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGAGGCCATCAc > 2:189242/1‑150 (MQ=255) aCCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCg < 2:1300449/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCgg < 1:1340468/150‑1 (MQ=255) ccTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGaa < 2:327504/150‑1 (MQ=255) gCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGcc < 2:1200773/150‑1 (MQ=255) gCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGcc > 2:905353/1‑150 (MQ=255) cTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCg < 2:231760/150‑1 (MQ=255) cTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGAGTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCg > 1:1026648/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCCCAGCGTGACTGTTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGt > 2:59789/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGt > 1:294234/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGAGGAACGGCGGAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGCCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGt > 1:798552/1‑150 (MQ=255) aGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTc > 2:1195355/1‑150 (MQ=255) aGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTc < 2:264916/150‑1 (MQ=255) gcgcCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTcc < 1:1209365/150‑1 (MQ=255) ccAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGa < 1:289019/150‑1 (MQ=255) ccAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGa > 2:793537/1‑150 (MQ=255) gTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGNGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGagcagc < 1:627963/150‑1 (MQ=255) gTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGagcagc < 1:496589/150‑1 (MQ=255) tGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCa < 2:355822/115‑1 (MQ=255) tGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCa > 1:355822/1‑115 (MQ=255) tGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAgt < 2:392720/150‑1 (MQ=255) tGGTTGCGGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTACCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAgt < 2:174676/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCgg < 1:781898/107‑1 (MQ=255) gTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCgg > 2:781898/1‑107 (MQ=255) tgcAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCTTGCAGccac < 1:803448/71‑3 (MQ=255) tgcAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCTTGCAGccac > 2:803448/1‑69 (MQ=255) tgcAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTgg > 2:1132277/1‑150 (MQ=255) aGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGa < 2:1262669/130‑1 (MQ=255) aGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGa > 1:1262669/1‑130 (MQ=255) gggCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCtt < 1:793537/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCt < 1:1298268/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAACCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGACGAACAACGCGCCGCGCCAGGATGTGGGCTTGCt < 2:798417/150‑1 (MQ=255) cGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCttagtg > 2:366723/1‑146 (MQ=255) gcgcATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATCCTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCCCCCAGGCGCATGATGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCa > 1:1033180/1‑150 (MQ=255) gcATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAac < 1:59789/150‑1 (MQ=255) gcATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTCAGCCGGCGTCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATCGCGGCCATCACCAGGCCGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCCCAGTGTTCTGGCCTTGCTGGCCacc > 2:1007390/1‑148 (MQ=255) cATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAaca < 1:189242/150‑1 (MQ=255) aTCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGGAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAacag < 2:1026648/150‑1 (MQ=255) tCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAacagc > 1:1264275/1‑150 (MQ=255) cGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCAcc < 2:86160/85‑1 (MQ=255) cGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCAcc > 1:86160/1‑85 (MQ=255) cAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCa > 2:958790/1‑150 (MQ=255) cAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCa > 1:1031959/1‑150 (MQ=255) atcgtGATCCGGTAGCTGAAAGCAGTCGCGTGGCGGTCAGCGCGCGGGGGCCGATTGCGCCCGTCACCGCTCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAATGTGATAGCCTTGCTGCCCCACAGCGACCGCGGTTACGCATTGTTgcgct > 2:296275/5‑149 (MQ=255) ccGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTCTCTTTTTTTTGTTCAACAGTGACGGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCtt < 1:958790/150‑1 (MQ=255) gCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGa > 2:191984/1‑137 (MQ=255) gCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGa < 1:191984/137‑1 (MQ=255) tGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGt > 1:19095/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAgg > 2:361782/1‑150 (MQ=255) agcagcCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGc < 2:1031959/150‑1 (MQ=255) | ACTTGCTGCTGATCGGCAGCCTGCCCGAGGCCCTGCGCGACGCGCCCGACCTTGGCCTGTTGCTCAGCGCCCAGCGTGACTGGTTGCTGCAGGGCCGCAGCGCATCGTTGCCCGGTGGCCAGCGTTTCGATACTGAGCCGGTGGCTGCAAGCAGCCGCGTGGCGGTCAGCGCCCAGGCGCCGATTGCGGCCATCACCGGGCTGAAGTCGCCGTTCCACGAGCAGCGCAGTGTTGTGGCCTTGCTGGCCAACAGCGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGC > NC_002947/3017865‑3018163 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |