Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,240,243 | G→A | 7.0% | intergenic (+20/‑105) | PP_2837 → / → PP_2838 | uronate transporter/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,240,243 | 0 | G | A | 7.0% | 159.3 / 2.9 | 58 | intergenic (+20/‑105) | PP_2837/PP_2838 | uronate transporter/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/29); new base A (2/2); total (26/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.11e-01 |
CAGCGTTCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTCTACTACCTGC > NC_002947/3240096‑3240387 | caGCGTTCATGATCAGCGAGGTGGTGGCGCGGTGCGCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCtgcagtgca < 2:1374570/150‑1 (MQ=255) gCGTTCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGc < 1:1279724/150‑1 (MQ=255) gTTCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGccc > 1:1215747/1‑150 (MQ=255) aTCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGcccccgtagc < 2:73226/150‑7 (MQ=255) cgcgGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCGTTGGTTGTGCCAATGTCGCAGCGGTCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGt < 1:1028760/150‑1 (MQ=255) cgGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTg > 2:1206306/1‑150 (MQ=255) tggtggCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATc > 2:1190537/1‑150 (MQ=255) gtggCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGt < 1:1206306/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTACAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCcg > 1:544130/1‑150 (MQ=255) cTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTACAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCcg > 1:543989/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCcgc > 1:653245/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCcgc > 1:268755/1‑150 (MQ=255) ggcggTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCgcgg < 2:268755/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGTACTTCCTGCTGCTACACGCTCCCATTTGCAGTGCCACGTTCGCGGCGGGCTTGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGATCGCTACGTTGGCTGCAGTGCTGCCCCTGAACCCTGGTTCATCGTGAGGCGACCCGCGgcgc < 2:52972/150‑1 (MQ=255) cGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTc > 2:1060606/1‑150 (MQ=255) gTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCa > 1:145284/1‑150 (MQ=255) tACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCAt > 2:558310/1‑150 (MQ=255) aCTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACAGGGGCTGCACTGCAGcccccgta < 1:1131482/111‑5 (MQ=255) aCTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACAGGGGCTGCACTGCAGcccccgta > 2:1131482/1‑107 (MQ=255) ttCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCTAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCGTGGa > 1:990696/1‑150 (MQ=255) tCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAg < 1:888919/150‑1 (MQ=255) tgctgcTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTACAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAgggg < 2:543989/150‑1 (MQ=255) tgctgcTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTACAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAgggg < 2:544130/150‑1 (MQ=255) gctgctACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGt < 2:1215747/150‑1 (MQ=255) ctACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCt < 1:544438/150‑1 (MQ=255) aCAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATg > 2:1006727/1‑137 (MQ=255) aCAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATg < 1:1006727/137‑1 (MQ=255) aGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCtgtat < 2:653245/150‑1 (MQ=255) aCCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGt > 2:827178/1‑138 (MQ=255) aCCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGt < 1:827178/138‑1 (MQ=255) cccATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTAAGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACACTGGTTGATCGTGAGGCGAGCCGCGGAGCATGTCATGGAGGGGGATCTGTATGtata > 2:567795/1‑150 (MQ=255) cATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATTGAGGGGTATCTGTATGTATaaa > 2:685223/1‑150 (MQ=255) cATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATaaa > 1:67038/1‑150 (MQ=255) ttGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACa < 1:1060606/150‑1 (MQ=255) tGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTCCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAg < 1:648429/150‑1 (MQ=255) cAGTGCCAAGGTCGAGGGGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGc < 1:558310/150‑1 (MQ=255) tGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTg > 2:452564/1‑150 (MQ=255) tGCCAAGGCCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGCGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGCTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTg < 1:567795/150‑1 (MQ=255) gCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACa < 1:263798/142‑1 (MQ=255) gCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACa > 2:263798/1‑142 (MQ=255) gCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGt < 1:577712/150‑1 (MQ=255) tggcGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATgg > 1:739670/1‑93 (MQ=255) tggcGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATgg < 2:739670/93‑1 (MQ=255) gcAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGc < 1:452564/150‑1 (MQ=255) gcAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGc > 1:141319/1‑150 (MQ=255) aaCTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGccc < 1:556042/150‑1 (MQ=255) aCTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAg < 2:861068/88‑1 (MQ=255) aCTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAg > 1:861068/1‑88 (MQ=255) gAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTTATGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAGCCTGACCTCCGCCCGTGATCGGCCATTc < 2:145284/150‑1 (MQ=255) aaCAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATaaa < 2:812462/103‑1 (MQ=255) aaCAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATaaa > 1:812462/1‑103 (MQ=255) aCAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCg < 1:280332/150‑1 (MQ=255) aCAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCg < 2:141319/150‑1 (MQ=255) gCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGTGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTcga < 1:1190537/150‑1 (MQ=255) tGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTcgacga > 2:78610/1‑150 (MQ=255) gAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCgacgac < 1:357396/150‑1 (MQ=255) cGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATaaa > 1:1213774/1‑91 (MQ=255) cGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATaaa < 2:1213774/91‑1 (MQ=255) cTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTCTACTACCt > 1:1083147/1‑150 (MQ=255) tgcagtgcagCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCGTGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTCCTACTACCTg < 2:990696/150‑1 (MQ=255) gcagtgcagCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTCTACTACCTGc > 1:1405303/1‑150 (MQ=255) cagtgcagCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCgacgac > 2:540396/1‑133 (MQ=255) cagtgcagCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCgacgac < 1:540396/133‑1 (MQ=255) | CAGCGTTCATGATCAGCGCGGTGGTGGCGCTGTGCTCGGCGGTGGCGTACTTCCTGCTGCTACAGGCACCCATTGGCAGTGCCAAGGTCGAGGCGGGCGGGATGGCTGGCGCAACTGAACAGGCGTGAACGCTACGGGGGCTGCAGTGCAGCCCCTGAACCCTGGTTGATCGTGAGGCGACCCGCGGCGCTTGTCATGGAGGGGTATCTGTATGTATAAACAGTGCCTGTTGCCGCAACCTGACCTCCGCCCGTGATCGCCCATTCCGTCGACGACCCGTTCTACTACCTGC > NC_002947/3240096‑3240387 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |