| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5816927 | 187 (0.510) | 49 (0.150) | 21/260 | 20.5 | 23.9% | intergenic (+57/+72) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein |
| ? | NC_002947 | = 5816954 | 147 (0.450) | intergenic (+84/+45) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
AAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGC > NC_002947/5816805‑5817103 | aaGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTcaca < 2:3798323/150‑1 (MQ=255) gCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATa > 2:6955338/1‑150 (MQ=255) cACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGTAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATAc < 1:3002286/150‑1 (MQ=255) aCTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATAcc > 2:3151333/1‑150 (MQ=255) cTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCt > 2:3880396/1‑150 (MQ=255) aCGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgt < 1:392792/150‑1 (MQ=255) aCGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgt < 1:7603349/150‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgtg < 2:6284070/150‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgtg < 1:474067/150‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgtg < 2:3321680/150‑1 (MQ=255) gtggtgGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTgg < 1:5238746/150‑1 (MQ=255) tggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTggg < 1:1707421/150‑1 (MQ=255) ggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGa < 2:7369169/150‑1 (MQ=255) tggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGGACGCCCCCGCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCGCTCGCGCGCAGCGCACATACCGGTGGGAGc > 1:1882569/1‑150 (MQ=255) gggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGc < 1:5592891/149‑1 (MQ=255) gCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCgg > 2:6877376/1‑150 (MQ=255) ccAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCggg < 1:2081533/150‑1 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCCGCTCACATACCTGTGGGAGCGGgcg > 2:6567436/1‑150 (MQ=255) gggTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGcc < 1:6441402/150‑1 (MQ=255) tgctgcCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCACGCGCGCGCACCACACATACCGGTGGGAGCGCGCGCGCCcgc > 2:4042804/1‑150 (MQ=39) tgcCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCCCGCCCCCAGGGA‑GCGCGGCGCGCGCGCGCGCCGCGCCCAGACCGGTGGGAGCGGGCGCGCCcgcgca > 2:4332540/1‑148 (MQ=255) tgcCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATGTGAGCTGCGCGCGAGAGCGACGCGC‑TACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaa < 2:534743/150‑1 (MQ=14) gcCGAAAGAGCAGCTGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCGGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaag < 1:1166517/150‑2 (MQ=255) gcCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGaaa < 2:7031001/150‑1 (MQ=255) gcCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCGCCCCCAGGGA‑GCGCGTCGCGCGCGCCCGCAGCGCACAAAACAGTGGGGGCGGGCGCccccccccaa > 1:1787892/1‑144 (MQ=255) gcCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCGGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGaaa < 1:1838652/150‑1 (MQ=255) cGAACGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCACGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAAgg < 2:2129577/150‑1 (MQ=255) atagagCAGCAGCTGCGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGc < 2:1905230/148‑1 (MQ=255) aaaGAGAAGAATCTGATTCTGGCAAAGCTTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCTCTCTCGCGCGCAGATAAAATACCTTTGGTAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGc < 1:5820559/150‑1 (MQ=37) aaGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGcc < 2:7771102/150‑1 (MQ=255) cagcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGc < 2:4621658/150‑1 (MQ=255) agcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCCCTCCCACAGGGA‑GCGCGTGGCGCGCGCGCGCCGCGCACATACCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGACACGGCCGTTGCa > 2:123580/1‑150 (MQ=255) agcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCa < 2:633122/150‑1 (MQ=255) gcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAg < 2:5590748/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgtg < 1:3224852/109‑1 (MQ=255) tCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCATTGCAGGTACTACaa < 2:1799044/150‑1 (MQ=255) cTGGCCACGCTTTATGCTGATGGGGGCTATCGGGTACCGGCCCCTTGGGGGGCACGCCCGCTCCCACTGGTT‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCACACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAg < 1:1538009/150‑1 (MQ=37) tGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTT‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATAACTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGc < 2:1574440/150‑1 (MQ=255) tGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGc < 1:1753888/150‑1 (MQ=255) tGGCCAAGCGTTAAGCGGATCGGCGCTAGCCGGTACCGCCCCCGACGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGc < 1:6385634/150‑1 (MQ=38) aaGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCGCGCGCGCGCAGCTCACCTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCGTTGCAGGTACTACAAGCCtgtg > 2:4423524/1‑150 (MQ=38) aGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGa < 1:4754314/150‑1 (MQ=255) tAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAAc < 1:6574598/150‑1 (MQ=255) tAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCGCTCGCGCGCAGCTCACATACCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCGTTGCAGGTACTACAAGCCAGTGATCAAc > 2:5770866/1‑150 (MQ=38) gCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCACACGTA‑GCGCGTCGCGCGCCCGCGCAGCTCACAAAACAGTGGGAGCGGGCGCGCCCCCCAAACGGCCGTTGCAGGGACAACAAGCCCTTGATCAAcccg > 1:5940138/1‑149 (MQ=255) gATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGc < 2:3485045/150‑1 (MQ=255) cGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTcc < 1:7897617/150‑1 (MQ=255) ggCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCAGGTA‑GCGCGGCCCTCTCGCGCGCCGCGCACAGACCGGTGGGTGCGGGCGCGCCCGCGCAAGGGCCGTTGCCGGTACTACAAGCCGTTGATACACCCACGCTccc > 2:662012/1‑150 (MQ=255) gcgcTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCt < 1:3599501/150‑1 (MQ=255) cGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTcc < 1:5397989/150‑1 (MQ=255) ccTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgt > 1:6913704/1‑64 (MQ=255) cgGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATc > 2:1751196/1‑150 (MQ=255) cgGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATc < 1:3145008/150‑1 (MQ=255) cACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCTGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCa < 1:5628451/150‑1 (MQ=255) 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tCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCGCCATCGTCAGCATccccg > 1:1952788/1‑149 (MQ=255) cccACAGGGA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTc < 2:7403578/150‑1 (MQ=255) ccACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACCTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGACAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCGTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCCTCGTCAGCATCCCCTcc > 2:6395678/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTcc > 1:6256395/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTcc > 2:750396/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCGcc > 1:4291114/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCAcc > 1:7425690/1‑150 (MQ=255) cacaGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGTCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccg > 2:2128913/1‑150 (MQ=255) cacaGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCCACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccg > 1:6722565/1‑150 (MQ=255) cacaGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCccgccg > 1:4430864/1‑150 (MQ=255) cacaGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccg > 2:1154071/1‑150 (MQ=255) cacaGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCAccc > 1:3702840/1‑149 (MQ=255) aGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCccgccgccg > 1:4894978/1‑150 (MQ=255) gcgcGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCACCGccgccccg > 1:7635731/1‑150 (MQ=255) cGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGc < 1:2190065/150‑1 (MQ=255) tcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGc > 1:1206047/1‑49 (MQ=17) cgcgcgCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGTGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTGAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACt < 1:6877376/150‑1 (MQ=255) gcgcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTg < 2:3817920/150‑1 (MQ=255) gcgcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCGCAGCCGCCGCAACGCCCCCGCCCGCGGCAGCATCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGGCCTCAccg > 1:3336113/1‑148 (MQ=255) gcgcAGCTCACATACGTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa < 1:2279389/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTCACATACCTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCGTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa < 1:4911813/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa < 2:2885628/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa > 2:1737804/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa > 2:278000/1‑150 (MQ=255) gcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGa > 2:2079248/1‑150 (MQ=255) gCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCACCCCCGCCCCGCCCTGCATCACAGAAGACaa > 1:7075883/1‑150 (MQ=255) tCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGccgccccgc < 1:3842322/129‑1 (MQ=255) tCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACt > 2:4161199/1‑150 (MQ=255) tCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCCCCCTGCATCACTGAAGACAACt > 1:5112975/1‑150 (MQ=255) tCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCCCCCTGCAGCACAGAAGACAACt > 2:3498641/1‑150 (MQ=255) tCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCGCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACt > 1:1290953/1‑150 (MQ=255) tCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCAACCCCGCCCCCCCCAGCAACACAGAAGACAAca > 1:7341536/1‑149 (MQ=255) acaTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCCCCCCCCCCGCCATCGGCAGCCGGCCCACCCCCCCCCCCCCCAGCCGCACGGGAGACAAcagg > 1:6773930/1‑147 (MQ=255) acaTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCGGCATCACTGAAGACAACTgc > 2:423250/1‑150 (MQ=255) acaTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCGCCATCGTCCGCATCCCCGCCCCCGCCCCGCCCGGCATCACGGCAGACAACAgc > 1:4582760/1‑150 (MQ=255) aTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCACCGCCGCCCCGCCCAGCAACACAGAAGACAACTgcgc > 1:4072565/1‑150 (MQ=255) | AAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA‑GCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGC > NC_002947/5816805‑5817103 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |