| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4340085 = | 14 (0.250) | 14 (0.340) | 11/188 | 3.0 | 54.6% | intergenic (+26/‑305) | ribAB‑II/PP_3814 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 4340169 = | 13 (0.320) | intergenic (+110/‑221) | ribAB‑II/PP_3814 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein | |||||
CCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAGAACACTTTGTTTTAG > NC_002947/4340108‑4340316 | ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCGGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc > 2:659526‑M2/62‑150 (MQ=255)ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg > 2:220952‑M2/62‑122 (MQ=255)ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg < 1:220952‑M2/61‑1 (MQ=255)ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATAcc > 1:381952‑M2/62‑129 (MQ=255)ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATAcc < 2:381952‑M2/68‑1 (MQ=255)ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc > 1:1281098‑M2/62‑150 (MQ=255)CCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc < 1:30733‑M1/150‑1 (MQ=255) cgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt < 1:604960‑M2/60‑1 (MQ=255) cgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt > 2:604960‑M2/61‑120 (MQ=255) gaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCtttt > 2:936207‑M2/58‑68 (MQ=255) gaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCtttt < 1:936207‑M2/11‑1 (MQ=255) aatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGa > 2:273218‑M2/57‑150 (MQ=255) TGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGt < 1:404024‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTc > 2:644755‑M2/54‑150 (MQ=255) gtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCGGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTg < 1:659526‑M2/99‑1 (MQ=255) gggTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGc < 1:1376574/79‑1 (MQ=255) gggTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGc > 2:1376574/1‑79 (MQ=255) gggTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCa > 2:1168721/1‑150 (MQ=255) gggTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCa > 2:1133361/1‑150 (MQ=255) tGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCa > 2:59173/1‑147 (MQ=255) tGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCa < 1:59173/147‑1 (MQ=255) tcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCa < 1:644755‑M2/109‑1 (MQ=255) caccGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATc < 1:1422312/98‑1 (MQ=255) caccGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATc > 2:1422312/1‑98 (MQ=255) accGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTa < 1:1095221/125‑1 (MQ=255) accGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTa > 2:1095221/1‑125 (MQ=255) cGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATa > 1:926741/1‑80 (MQ=255) cGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATa < 2:926741/80‑1 (MQ=255) gACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTAc > 2:675515/1‑150 (MQ=255) gcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAAt < 1:273218‑M2/117‑1 (MQ=255) cccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACaa < 1:1016079‑M2/116‑1 (MQ=255) cccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACaa > 2:1016079‑M2/19‑134 (MQ=255) cccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGccacca > 1:891416‑M2/19‑150 (MQ=255) ccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATa < 2:340120‑M2/66‑1 (MQ=255) ccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGa < 2:199574‑M2/88‑1 (MQ=255) ccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGa > 1:199574‑M2/18‑105 (MQ=255) ccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAg > 1:1194960‑M2/18‑150 (MQ=255) ccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCACGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAg > 1:323375‑M2/18‑150 (MQ=255) ccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCCGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATa > 1:340120‑M2/18‑83 (MQ=255) tacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATTGTATCCCGGAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGGACCTAGGATTAAAAGAAGCGACGAGAACACtt > 1:672532‑M2/11‑150 (MQ=255) acagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAGAACACttt > 1:1130495‑M2/10‑150 (MQ=255) acagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAGAACACttt < 2:1281098‑M2/141‑1 (MQ=255) cccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg < 2:35649‑M2/61‑1 (MQ=255) cccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg > 1:35649‑M2/4‑64 (MQ=255) ccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAACCGGCCACCAGAACACTTTGTTTTAg < 1:1168721‑M2/148‑1 (MQ=255) | CCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAGAACACTTTGTTTTAG > NC_002947/4340108‑4340316 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |