New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 176362 | NA (NA) | 37 (0.640) | 22/266 | 2.2 | NA | intergenic (+6/‑457) | PP_5SA/PP_16SB | 5S ribosomal RNA/16S ribosomal RNA |
? | NC_002947 | = 176400 | NA (NA) | intergenic (+44/‑419) | PP_5SA/PP_16SB | 5S ribosomal RNA/16S ribosomal RNA |
TTGGAACCACCTGATCCCATCCCGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGA > NC_002947/176257‑176511 | ttGGAACCACCTGATCCCATCCCGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTTATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTaa < 1:320216/150‑1 (MQ=14) ttGGAACCACCTGATCCCATCCCGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTaa < 2:1163066/150‑1 (MQ=31) tGGAACCACCTGAGCCCATCCCGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCAGTTCTCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAg < 2:549506/150‑1 (MQ=12) gAACCACCTGATACCATCGCGAACTCAGTAGTGAAACGGTGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGATTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGCTTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTa > 2:858372/1‑150 (MQ=11) ccaccTGATCCCATCCCGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGaa > 1:575495/1‑150 (MQ=34) tGATCCCATCCCGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTAACAGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCa < 1:1215778/150‑1 (MQ=255) atcccatcccGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATg > 1:575313/1‑150 (MQ=40) aaCGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGt < 2:111955/150‑1 (MQ=255) aTCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGt < 2:575313/150‑1 (MQ=255) tGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTaa > 1:479588/1‑150 (MQ=255) tgtgGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAggt > 1:594776/1‑150 (MQ=255) tgGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAggtgg > 2:140371/1‑150 (MQ=255) ccATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAgtgt > 1:1095548/1‑150 (MQ=255) ccATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCT‑CCTGCCGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCAGGGTAAGCCGCAAGGTCAGGCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAgtgt > 1:1150537/1‑150 (MQ=25) gtgAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGttttt > 1:723598/1‑150 (MQ=255) agagTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGaa < 1:90356/150‑1 (MQ=255) gTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTc > 1:584664/1‑86 (MQ=255) gTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTc < 2:584664/86‑1 (MQ=255) tAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCt > 2:1162932/1‑150 (MQ=255) aGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTg < 2:479588/150‑1 (MQ=255) ggTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGt > 2:59031/1‑150 (MQ=255) gTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGta > 1:1304742/1‑150 (MQ=255) aTCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGt > 2:726164/1‑64 (MQ=37) aTCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGt < 1:726164/64‑1 (MQ=37) tCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGtattat > 1:581955/1‑150 (MQ=255) cAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCAc < 1:59031/150‑1 (MQ=255) aaGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTattatt > 2:1164951/1‑146 (MQ=255) aaGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTattatt < 1:1164951/146‑1 (MQ=255) aTTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAggtg > 2:1094863/1‑113 (MQ=255) aTTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAggtg < 1:1094863/113‑1 (MQ=255) aTTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTNAGTAGAAACTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTGTTTAAATGCTGTATTATTCACCTCCcgcg > 1:34497/1‑150 (MQ=255) ttCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTCGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGcgac < 2:575495/150‑1 (MQ=255) atCGCAAAACTCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGcgac > 2:1208235/2‑150 (MQ=255) cGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGcgacga < 1:1162932/150‑1 (MQ=255) cGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGcgacga < 1:256093/150‑1 (MQ=255) | TTGGAACCACCTGATCCCATCCCGAACTCAGTAGTGAAACGATGCATCGCCGATGGTAGTGTGGGGTTTCCCCATGTGAGAGTAGGTCATCGTCAAGATTCATTTCGCAAAACCCCTATCTG‑CGCATGCAGGTAGGGGTTTTGTCTTTAAGTAGAAGCTCATGCTTCGTCCTGGTAAGCCGCAAGGTCAGCCAGTTGCAGTAAAAAGGTGGTTGACAGTGTTTTTGAATGCTGTATTATTCACCTCCCGCGACGA > NC_002947/176257‑176511 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |