New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 911382 | 26 (0.820) | 4 (0.130) | 4/238 | NT | 12.3% | coding (1887/2853 nt) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
? | NC_002947 | = 911420 | 32 (1.050) | coding (1925/2853 nt) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
ATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGATGGGCATGCCGTCGAGGTGTTTGCCAACATCGGCGATAGCAACGGCATCGCCAAGGTGGTGGAGCAGGGCGCCGAAG > NC_002947/911233‑911530 | aTCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCC > 2:331244‑M1/1‑150 (MQ=255) tcgtcgCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCg > 2:716967/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCcaggcggc > 1:320543‑M1/1‑142 (MQ=255) cagcagTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGcc > 2:707846/1‑150 (MQ=255) cagcagTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGACCGAGCGTGACCTGCGCGAGTAACGcc > 2:125873/1‑150 (MQ=255) gTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGgcc < 1:29507/150‑1 (MQ=255) gcgcGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCt < 1:707846/150‑1 (MQ=255) gggTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGggc > 2:506894‑M2/1‑147 (MQ=255) gggTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGg > 1:564919‑M2/1‑147 (MQ=255) gggTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGg < 2:564919‑M2/148‑2 (MQ=255) gTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCcaggcggcctgcaggcgttgctcgcgcaggtcacgctcggcca < 2:320543‑M1/150‑44 (MQ=255) gATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCtt < 2:630972/150‑1 (MQ=255) aTACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTc < 2:440166/150‑1 (MQ=255) tgTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGATCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCgg > 2:17930/1‑150 (MQ=255) tgTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGCGCCgt < 2:637938/150‑2 (MQ=255) gagaGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTTGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATc > 2:623274/1‑150 (MQ=255) gTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGgcc < 1:24692/116‑1 (MQ=255) gTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGgcc > 2:24692/1‑116 (MQ=255) gTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGAGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTg > 1:811083/1‑150 (MQ=255) gaCGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGa < 2:105918/149‑1 (MQ=255) aCGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGAt < 2:233047/150‑1 (MQ=255) gccgcTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGATgg < 2:234962/150‑1 (MQ=255) ccgcTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGATggg > 2:317763/1‑150 (MQ=255) cgcTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGCCCATCACGGGTGATggcc < 1:331244/150‑3 (MQ=255) tCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGATGGGCATGCCGTCg > 2:87888/1‑150 (MQ=255) cAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGGCCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCACGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCAAGCCGCCCATCACCCGTGATGGGCATCCCGTCGAGGTGttt > 2:5349/1‑150 (MQ=255) cAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGATGGGCATGCCGTCGAGGTGttt < 1:87888/150‑1 (MQ=255) gtCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGACCGAGCGTGACCTGCGCGAGTAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGATGGGCATGCCGTCGAGGTGTTTGCCAACATCGGc < 1:125873/150‑1 (MQ=255) tCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCcaggcggcctgcaggcgttgc < 1:743415‑M1/65‑22 (MQ=255) tCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCcaggcggcctgcaggcgttgc > 2:743415‑M1/1‑44 (MQ=255) aGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCCGCCATCACCCGTGATGGGCATGTCGTCGAGGAGTTTGCCAACATCGGCGAt > 1:102167/1‑150 (MQ=255) gTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCAAACCGGTGAGTTCAACGCGTCACCCAAGATGGGCATGCCGTCGAGGTGTTTGCCAACATCGGCGATAGc > 1:101162/1‑150 (MQ=255) gCAGCGGGCGCTGGCCGAGTGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGATGGGCATGCCGTCGAGGTGTTTGCCAACATCGGCGATAGCAACGGCATCGCCAAGGTGGTGGa < 2:561428/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGATGGGCATGCCGTCGAGGTGTTTGCCAACATCGGCGATAGCAACGGCATCGCCAAGGTGGTGGAGCAgg < 2:455385/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGATGGGCATGCCGTCGAGGTGTTTGCCAACATCGGCGATAGCAACGGCATCGCCAAGGTGGTGGAGCAgg < 1:372314/150‑1 (MQ=255) tGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGggccagcgcccgctgcagctcatccgctggcggtgcgacgctgaccacaccacgctggccatcgagcagcagcggcgtaccactctccaacagcagtatcgatgcac < 2:320543‑M2/150‑108 (MQ=255) gCCcaggcggcctgcaggcgttgctcgcgcaggtcacgctcggccagcgcccgctgcagctcatccgctggcggtgcgacgctgaccacaccacgctggccatcgagcagcagcggcgtaccactctccaacagcagtatcgatgcaccc > 2:506894‑M1/1‑3 (MQ=255) gCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGATGGGCATGCCGTCGAGGTGTTTGCCAACATCGGCGATAGCAACGGCATCGCCAAGGTGGTGGAGCAGGGCGCCGaa < 1:17910/150‑1 (MQ=255) ccGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGATGGGCATGCCGTCGAGGTGTTTGCCAACATCGGCGATAGCAACGGCATCGCCAAGGTGGTGGAGCAGGGCGCCGAAg > 2:620508/1‑150 (MQ=255) ccaggcggcctgcaggcgttgctcgcgcaggtcacgctcggccagcgcccgctgcagctcatccgctggcggtgcgacgctgaccacaccacgctggccatcgagcagcagcggcgtaccactctccaacagcagtatcgatgcaccc < 2:564919‑M1/148‑148 (MQ=255) ccaggcggcctgcaggcgttgctcgcgcaggtcacgctcggccagcgcccgctgcagctcatccgctggcggtgcgacgctgaccacaccacgctggccatcgagcagcagcggcgtaccactctccaacagcagtatcgatgcaccc > 1:564919‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATCGTCGCCCGGGCGTTGGGCATACCAGCAGTGGTCGGCGCGGGTGCATCGATACTGCTGTTGGAGAGTGGTACGCCGCTGCTGCTCGATGGCCAGCGTGGTGTGGTCAGCGTCGCACCGCCAGCGGATGAGCTGCAGCGGGCGCTGGCCGAGCGTGACCTGCGCGAGCAACGCCTGCAGGCCGCCTGGGCCAACCGCTTCGAGCCGGCCATCACCCGTGATGGGCATGCCGTCGAGGTGTTTGCCAACATCGGCGATAGCAACGGCATCGCCAAGGTGGTGGAGCAGGGCGCCGAAG > NC_002947/911233‑911530 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |