New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2761830 | 39 (1.230) | 3 (0.100) | 3/242 | NT | 7.2% | coding (368/630 nt) | PP_2415 | GNAT family acetyltransferase |
? | NC_002947 | = 2761862 | 39 (1.260) | coding (400/630 nt) | PP_2415 | GNAT family acetyltransferase |
CCGATGCTCGCCAACGCACCCTTGCCGCGTGACCTGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTGGACTGCCTTTACTTGCATAC > NC_002947/2761682‑2761977 | ccGATGCTCGCCAACGCACCCTTGCCGCGTGACCTGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAg > 1:462618/1‑150 (MQ=255) tCGCCAACGCACCCTTGCCGCGTGACCTGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGAtt > 2:144639/1‑150 (MQ=255) ccAACGCACCCTTGCCGCGTGACCTGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTAcc < 1:434812/150‑1 (MQ=255) cTTGCCGCGTGACCTGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCg > 2:671969/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCGTGACCTGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCgg < 2:339579/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCGTGACCTGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCgg > 1:6881/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCGTGACCTGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGATTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCgg < 1:278472/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGTGACCTGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCggg < 2:462618/150‑1 (MQ=255) ccGCGTGACCTGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTa < 1:58159/150‑1 (MQ=255) gcgTGACCTGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGt > 1:318237/1‑150 (MQ=255) tGACCTGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGa < 2:318237/150‑1 (MQ=255) tGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGtgg < 2:541905‑M2/150‑4 (MQ=255) ggCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAcctcgactacccgctctgcgcggtaatcaagctggg < 1:499464‑M1/150‑37 (MQ=255) gCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTc < 1:121407/150‑1 (MQ=255) cTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAcctcgactacccgctctgcgcggtaatcaagctgg > 1:342683‑M1/1‑92 (MQ=255) cTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAcctcgactacccgctctgcgcggtaatcaagctgg < 2:342683‑M1/127‑36 (MQ=255) tGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGCTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAg < 2:583031/150‑1 (MQ=255) ctTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGc < 1:439662/95‑1 (MQ=255) ctTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGc > 2:439662/1‑95 (MQ=255) ctTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCt < 1:658950/150‑1 (MQ=255) gAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGgctgct > 2:216431/1‑150 (MQ=255) gAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGgctgct < 2:75483/150‑1 (MQ=255) aGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCtgctgc > 2:705301/1‑150 (MQ=255) tGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGtt > 2:807587/1‑150 (MQ=255) ggTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGAGTATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGt < 1:732550/150‑1 (MQ=255) gggCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAg > 1:78125/1‑84 (MQ=255) gggCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAg < 2:78125/84‑1 (MQ=255) gTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGGGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAg > 2:480064/1‑150 (MQ=255) tACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCg < 1:134386/150‑1 (MQ=255) tttcccTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCACGCAGAGCGGGATGTCGAGGAAGTACGGCTGGTCGTGTTGCCGGCGTACCGAAGGCCTGGCCTGACTGCTCCCTTGTTTGGTGCGTTGCGCGAACGGGCGGTGCAAGCGGGc > 2:25452/4‑150 (MQ=255) ttGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGc > 1:398603/1‑150 (MQ=255) ccTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTgg > 1:427163/1‑150 (MQ=255) cTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTGGa > 1:738612/1‑150 (MQ=255) gACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTGGACTGc > 1:202800/1‑150 (MQ=255) ccATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCCGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGt > 1:159859/1‑109 (MQ=255) ccATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGt < 2:159859/109‑1 (MQ=255) cATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCt > 1:502865/1‑73 (MQ=255) cATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCt < 2:502865/73‑1 (MQ=255) cATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTGGACTGCCtt > 2:562125/1‑150 (MQ=255) cGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTGGACTGCCTTTAc < 1:221869/150‑1 (MQ=255) cTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGt > 1:788427/1‑53 (MQ=255) cTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGt < 2:788427/53‑1 (MQ=255) cTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTGGACTGCCTTTACtt > 2:91962/1‑150 (MQ=255) ttGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTGGACTGCCTTTACTTGc < 2:6881/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTGGACt > 1:77620/1‑136 (MQ=255) gCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTGGACt < 2:77620/136‑1 (MQ=255) cccAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGtgggcaaagcgatggtcatagggcaagtaaccgatcaccgcaaccagccgcccaccctcacgggcttccagaaagcagcccgcaccgtccaggtaagtgtcggcgaaatgcgcc < 1:499464‑M2/150‑115 (MQ=255) cccAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTgcgc < 2:117053/107‑1 (MQ=255) cccAGCTTGATTACCGCGCAGAGAGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTgcgc > 1:117053/1‑107 (MQ=255) ccAcctcgactacccgctctgcgcggtaatcaagctgggcaaagcgatggtcatagggcaagtaaccgatcaccgcaaccagccgcccaccctcacgggcttccagaaagcagcccgcaccgtccaggtaagtgtcggcgaaatgcgcca < 2:541905‑M1/150‑148 (MQ=255) ccAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTTGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTGGACTGCCTTTACTTGCATAc > 2:801503/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGtgggcaaagcgatggtcatagggcaagtaaccgatcaccgcaaccagccgcccaccctcacgggcttccagaaagcagcccgcaccgtccag < 2:342683‑M2/127‑93 (MQ=255) ccAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGtgggcaaagcgatggtcatagggcaagtaaccgatcaccgcaaccagccgcccaccctcacgggcttccagaaagcagcccgcaccgtccag > 1:342683‑M2/1‑35 (MQ=255) cAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTGGACTGCCTTTACTTGc < 2:234877/145‑1 (MQ=255) cAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTGGACTGCCTTTACTTGc > 1:234877/1‑145 (MQ=255) | CCGATGCTCGCCAACGCACCCTTGCCGCGTGACCTGGCGCATTTCGCCGACACTTACCTGGACGGTGCGGGCTGCTTTCTGGAAGCCCGTGAGGGTGGGCGGCTGGTTGCGGTGATCGGTTACTTGCCCTATGACCATCGCTTTGCCCAGCTTGATTACCGCGCAGAGCGGGTAGTCGAGGTGGTGCGGCTGTTCGTGTTGCCGGCCTACCGCAGGCATGGCCTGGCTGCTGCCTTGTTTGGTGCCTTGCGCGAACGGGCGATGCAAGCGGGCTTGGACTGCCTTTACTTGCATAC > NC_002947/2761682‑2761977 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |