New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 100443 = | 24 (0.760) | 5 (0.180) | 4/214 | NT | 18.6% | intergenic (‑35/+87) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 100525 = | 23 (0.840) | intergenic (‑117/+5) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
GTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAG‑CAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTAGC > NC_002947/100376‑100669 | gTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTAGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGACATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAAt > 2:318633/1‑150 (MQ=255) tCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATg > 1:365234/1‑150 (MQ=255) gAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCg < 2:430768/150‑1 (MQ=255) aGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCCCTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCgg < 1:333764/150‑1 (MQ=255) gAAGAGGATGTTTTTCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCAtt > 1:686304/1‑150 (MQ=255) agGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAgg < 2:739051/150‑1 (MQ=255) tGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGcc > 2:641958/1‑150 (MQ=255) gTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCtt > 2:592560/1‑150 (MQ=255) gCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCg < 2:175490/150‑1 (MQ=255) aCAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAgg > 1:801930/1‑150 (MQ=255) gggTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGc < 2:365234/150‑1 (MQ=255) ggTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCt > 2:697534/1‑150 (MQ=255) cttcttCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGc > 2:58152/1‑150 (MQ=255) cgcggacatgcccgcccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGgcgc > 1:823597‑M2/81‑150 (MQ=255) GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGATGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGTTCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCt < 1:814899‑M1/150‑1 (MQ=255) GCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAg > 1:58152‑M1/1‑150 (MQ=255) ctgcccgcccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTAGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGga < 2:379761‑M2/77‑1 (MQ=255) ATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGga < 1:72262‑M1/150‑1 (MQ=255) gcccgcccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGgaga > 2:467992‑M2/72‑150 (MQ=255) agggcccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAggagag > 1:379761‑M2/71‑149 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCg > 1:569619‑M1/1‑99 (MQ=255) CCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCg < 2:569619‑M1/99‑1 (MQ=255) CTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAAt > 2:686304‑M1/1‑150 (MQ=255) cccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATgc < 2:823597‑M2/86‑1 (MQ=255) gTAAGGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTcc > 1:519570/1‑150 (MQ=255) gTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTcc > 1:843150/1‑150 (MQ=255) tAAAGCGCATGCCTTGAAGTGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGaa > 2:653311/1‑136 (MQ=255) tAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGaa < 1:653311/136‑1 (MQ=255) aaGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTg < 1:315622/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTc > 2:395707/1‑150 (MQ=255) ggCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTca < 2:519570/150‑1 (MQ=255) aGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAG‑CAGCCgg < 2:843150/150‑1 (MQ=255) gggCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAG‑CAGCCGGGc < 1:641958/150‑1 (MQ=255) gCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCtt < 2:233983/82‑1 (MQ=255) gCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCtt > 1:233983/1‑82 (MQ=255) aCTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCtt > 2:316369/1‑79 (MQ=255) aCTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCtt < 1:316369/79‑1 (MQ=255) aCCTGCGGGGGCGGGACTGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGCTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAG‑CAGCCGGGCCTGTTTCAcc < 1:338481/150‑1 (MQ=255) ggcatgcccgcgaaTGCGGTCATTGAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTCCGCTTCACGTAGTTGCCCGAGCTGTAGGAGAAAAATGCTCTCTCCTTGTCGTGCAG‑CCGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGt > 2:97159‑M2/15‑150 (MQ=255) tgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAG‑CAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAg < 1:395707‑M2/140‑1 (MQ=255) ccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGGGGAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAG‑CAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTa > 1:390001‑M2/8‑150 (MQ=255) cgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCAGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCCCTACTTGTCG‑TCAGACCGCAGGGCCGGTTTGACGGGACTGCCCATGTACAGGTAg > 2:269596‑M2/7‑150 (MQ=255) gcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAG‑CAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTAGc < 1:592560‑M2/145‑1 (MQ=255) | GTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAG‑CAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTAGC > NC_002947/100376‑100669 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |