New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 958597 = | 36 (1.140) | 3 (0.100) | 3/240 | NT | 7.8% | coding (49/564 nt) | PP_0820 | acetyltransferase |
? | NC_002947 | 958648 = | 36 (1.170) | coding (100/564 nt) | PP_0820 | acetyltransferase |
TTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGCCTATGCCAATGGCGACCAGCTCAAGCTTGGCATGTACCGCCGCGACAACGGCGA > NC_002947/958503‑958796 | ttGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCGACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGGCATGCCGATGCCGCTCAGTGGCTGGCGATCAt > 2:471622/1‑150 (MQ=255) ttGACGTTAAACTGTCATCTCCACAGAAATGGACAGGAGGTCCGGCGTGACCCCACCCAGCAGTTTCCGCGGTTTGCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCAt < 1:362919/150‑1 (MQ=255) tGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATg < 1:817924/150‑1 (MQ=255) tGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATg < 1:238131/150‑1 (MQ=255) tcgcggtcggcggccagggcgctttcggcctcggccaggtcttgccagggtgcatggtgccaatagcgcatgacctcggggtcggccatgatCGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATgg > 1:215039‑M1/93‑150 (MQ=255) gTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGcc > 2:343340/1‑149 (MQ=255) gTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGcc < 1:343340/149‑1 (MQ=255) tGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGAt > 2:504058/1‑135 (MQ=255) tGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGAt < 1:504058/135‑1 (MQ=255) tGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGAcccc < 1:434559/148‑1 (MQ=255) tGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGAcccc > 2:434559/1‑148 (MQ=255) tctcCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCACAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTcg > 1:817234/1‑149 (MQ=255) cccAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATgcg > 1:34486/1‑150 (MQ=255) tGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGc < 1:756039/150‑1 (MQ=255) gACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCAc > 1:244774/1‑150 (MQ=255) gagaTCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGc > 1:54669/1‑150 (MQ=255) agaTCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCa < 1:729984/150‑1 (MQ=255) cagggtgcatggtgccaatagcgcatgacctcggggtcggccatgatCGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGcc < 2:804935‑M1/60‑1 (MQ=255) cagggtgcatggtgccaatagcgcatgacctcggggtcggccatgatCGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGcc > 1:804935‑M1/48‑107 (MQ=255) cccaccccGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCt > 2:678426/1‑150 (MQ=255) ccaccccGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTg > 1:575370/1‑150 (MQ=255) cGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTggccgag > 1:400568/1‑150 (MQ=255) gCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGC‑AGACCTggccgaggc > 2:681663/1‑150 (MQ=255) cccAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAgc < 2:54669/150‑1 (MQ=255) aGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGACCGACCCCGAGGTCATGCGCGATTGGGACCATTCACCCGAGCAAGGCCTGGCCGAGGCCGAAAGCGcc > 1:346752/1‑150 (MQ=255) aCCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGaaa > 1:731339/1‑141 (MQ=255) aCCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGaaa < 2:731339/141‑1 (MQ=255) ctctGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCCAGCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGgcc < 1:362680/150‑1 (MQ=255) ggccatgatcgccagccactgcgcggcatcggcatggcgcatggggcgcagttgcaggcgATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTg < 2:804935‑M2/47‑1 (MQ=255) ggccatgatcgccagccactgcgcggcatcggcatggcgcatggggcgcagttgcaggcgATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTg > 1:804935‑M2/61‑107 (MQ=255) ctgCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGa < 1:187984/148‑1 (MQ=255) ccatgatcgccagccactgcgcggcatcggcatggcgcatggggcgcagttgcaggcgATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGa > 1:215039‑M2/59‑150 (MQ=255) gCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAg < 2:400568/150‑1 (MQ=255) cccACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGc < 1:672379/150‑1 (MQ=255) cccACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGc > 1:637911/1‑150 (MQ=255) cccACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCCAGGTCATGCGCTATTGGGACACTGCGCCAGACCAAGACCATGCCTATGCCGAAAGCGCCCTTGCCGCCGACCGCGaaag > 2:187984/1‑148 (MQ=255) cACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGCCt > 1:649100/1‑150 (MQ=255) aCGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGCCTa < 2:575370/150‑1 (MQ=255) tGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTTCGAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGTCTATGCCa > 1:9009/1‑150 (MQ=255) gCAACTGCGCCCCCTGCGCCCTGCCGCTGCCGCGCATTGGCTTGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGCCTATGCCaa < 2:649100/150‑1 (MQ=255) aaCTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGCCTATGCCAATg > 1:111704/1‑150 (MQ=255) aaCTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGCCTATGCCAATg > 1:389496/1‑150 (MQ=255) gcCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGCCTATGCCAATGGCGAcc > 1:248046/1‑150 (MQ=255) ccATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGCCTATGCCAAt < 2:647591/140‑1 (MQ=255) ccATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGCCTATGCCAAt > 1:647591/1‑140 (MQ=255) gatgccgCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGCCTATGCCAATGGCGACCAGCTCAAGCTTGGCATg > 1:98014/1‑150 (MQ=255) gATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGCCTATGCCAATGGCGACCAGCTCAAGCTTGGCATGTACCGCCGCGACAACGGCGa > 2:179953‑M2/2‑150 (MQ=255) | TTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAATGGACAGGAGATCCGGCGTGACCCCACCCCGCAGTTTCCCCAGTGACCTCTGCCTCGACAGCCCACGCCTGCAACTGCGCCCCATGCGCCATGCCGATGCCGCGCAGTGGCTGGCGATCATGGCCGACCCCGAGGTCATGCGCTATTGGCACCATGCACCCTGGCAAGACCTGGCCGAGGCCGAAAGCGCCCTGGCCGCCGACCGCGAAGCCTATGCCAATGGCGACCAGCTCAAGCTTGGCATGTACCGCCGCGACAACGGCGA > NC_002947/958503‑958796 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |