New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4808934 = | 48 (1.520) | 4 (0.130) | 4/236 | NT | 8.9% | coding (444/1716 nt) | dsbD‑II | thiol/disulfide interchange protein 2 |
? | NC_002947 | 4808965 = | 36 (1.190) | coding (475/1716 nt) | dsbD‑II | thiol/disulfide interchange protein 2 |
CCTGGGCTGGCAGGGCTGCGCCGACGCCGGCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTGGGCAATGGCGCCAGTGCCCGGCGCGGCTGGCTGCTGGCCGGGGTCTATGTGCT > NC_002947/4808820‑4809110 | ccTGGGCTGGCAGGGCTGCGCCGACGCCGGCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAg > 1:749466/1‑150 (MQ=255) cTGGGCTGGCAGGGCTGCGGCGAGGCCGGCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGc > 2:270769/1‑150 (MQ=255) cTGGGCTGGCAGGGCTGCGCCGACGCCGGCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGc > 1:497466/1‑150 (MQ=255) gggCTGGCAGGGCTGCGCCGACGCCGGCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCt < 1:169048/150‑1 (MQ=255) gCAGGGCTGCGCCGACGCCGGCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGc > 1:852009/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCTGCGCCGACGCCGGCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCAACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGc < 2:129410/150‑1 (MQ=255) gCTGCGCCGACGCCGGCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGttct > 1:778249/1‑150 (MQ=255) cgcCGACGCCGGCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCgg < 1:754676/150‑1 (MQ=255) gcCGACGCCGGCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGc < 1:285739/150‑1 (MQ=255) cccagcaccagcccggcaaggatcggcagcatcggcaacgagcagggggtgaaggccagcagcaggccaaggccgaagaacgccaacaggctccaGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGa > 2:492665‑M1/96‑130 (MQ=255) cccagcaccagcccggcaaggatcggcagcatcggcaacgagcagggggtgaaggccagcagcaggccaaggccgaagaacgccaacaggctccaGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGa < 1:492665‑M1/35‑1 (MQ=255) gACGCCGGCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCtt < 2:650961/150‑1 (MQ=255) gCCGGCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGc < 1:235521/150‑1 (MQ=255) gCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGt < 2:132807/126‑1 (MQ=255) gCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCGCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGt > 1:132807/1‑126 (MQ=255) cgccgcAAACCACCTCGATCGACTTGGGCTGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCa < 1:133520/150‑1 (MQ=255) gccgcAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTg < 2:87727/131‑1 (MQ=255) gccgcAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTg > 1:87727/1‑131 (MQ=255) gcAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCAcccc < 2:109462/150‑1 (MQ=255) gcAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCAcccc < 1:398839/150‑1 (MQ=255) accTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCg < 2:773309/150‑1 (MQ=255) cgcgattgaCTTGGGCGGCACCGTACCGCCGGCCGCCGTGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACGTCGCCTGGGGCTTTTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGTCCTTCACCCCCTGCTCggt < 2:18909/148‑3 (MQ=255) gcaacgagcagggggtgaaggccagcagcaggccaaggccgaagaacgccaacaggctccaggccagcggccttcagcaaggccacctggccTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTg > 1:712583‑M2/93‑120 (MQ=255) gcaacgagcagggggtgaaggccagcagcaggccaaggccgaagaacgccaacaggctccaggccagcggccttcagcaaggccacctggccTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTg < 2:712583‑M2/28‑1 (MQ=255) cgatcgaCTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGc < 2:852009/150‑1 (MQ=255) gatcgaCTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGcc > 2:656544/1‑150 (MQ=255) aCTTGGGCGGCACCGTAACGCCGTCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCGGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGAtgc < 2:411161/150‑1 (MQ=255) gggCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGcc > 1:503497/1‑150 (MQ=255) gcggcACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGa < 1:721941/150‑1 (MQ=255) aCCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCtt < 1:577462/150‑1 (MQ=255) caaggccgaagaacgccaacaggctccaGGCCAGGTGGCCTTGCTG‑AAGGCCGC‑TGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGc > 1:712583‑M1/29‑120 (MQ=255) caaggccgaagaacgccaacaggctccaGGCCAGGTGGCCTTGCTG‑AAGGCCGC‑TGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGc < 2:712583‑M1/92‑1 (MQ=255) ccgAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTgg < 1:187596/150‑1 (MQ=255) ccgAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTgg < 2:548190/150‑1 (MQ=255) cgAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTggg < 2:640865/150‑1 (MQ=255) acgaGCGACCAGGCGCTGGCTAGC‑GGCGGA‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGGGCTTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCGGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCGGATGCTGCCGATCCTTTCCGGGCTGGTGCTGGGCAATgtc < 2:24553/147‑3 (MQ=255) cAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTGGGCAATGgcgc < 2:71363/150‑1 (MQ=255) gACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTGGGCAATGGCGCCAGt < 1:94993/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCGGGGCt > 1:687025/1‑125 (MQ=255) cAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCt < 2:687025/125‑1 (MQ=255) aGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTGGGCAATGGCGCCAGTGccc > 2:221400/1‑150 (MQ=255) tccaggccaggtggccttgctgaaggccgctggccTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTggg > 2:492665‑M2/36‑130 (MQ=255) tccaggccaggtggccttgctgaaggccgctggccTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTggg < 1:492665‑M2/95‑1 (MQ=255) AGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGACTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTGGGCAATGGCGCCAGTGCCCGGCGCggctgg > 1:270769‑M1/1‑150 (MQ=255) gCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTGGGCAATGGCGCCAGTGCCCGGCGCGGCTGGCTGCTGGCCgg > 2:318057/1‑150 (MQ=255) aaGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTGGGCAATGGCGCCAGTGCCCGGCGCGGCTGGCTGCTGGCCgggg > 1:49280/1‑150 (MQ=255) ggccTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTGGGCAATGGCGCCAGTGCCCGGCGCGGCTGGCTGCTGGCCGGGGTCTATGTGCt < 1:6837‑M2/146‑1 (MQ=255) | CCTGGGCTGGCAGGGCTGCGCCGACGCCGGCCTGTGCTACCCGCCGCAAACCACCTCGATCGACTTGGGCGGCACCGTAACGCCGGCCGCCGAGCAAGCCAGCGACCAGGCGCTGGCCAGC‑GGCCTT‑CAGCAAGGCCACCTGGCCTGGAGCCTGTTGGCGTTCTTCGGCCTTGGCCTGCTGCTGGCCTTCACCCCCTGCTCGTTGCCGATGCTGCCGATCCTTGCCGGGCTGGTGCTGGGCAATGGCGCCAGTGCCCGGCGCGGCTGGCTGCTGGCCGGGGTCTATGTGCT > NC_002947/4808820‑4809110 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |