New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5421959 | 35 (1.110) | 3 (0.100) | 3/240 | NT | 8.1% | coding (809/870 nt) | tesB | acyl‑CoA thioesterase II |
? | NC_002947 | = 5421983 | 34 (1.110) | coding (785/870 nt) | tesB | acyl‑CoA thioesterase II |
CACGGCCACGGTCAGGGTGCCGTCCATGTCGAACACCCAGTTGCGCACCTCGCCCAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACCACAGCGAATGGTCGAGGCTGGCGATCTGCATGTCGCGCTGCCACACCGATTTGCCATGGGGCA > NC_002947/5421839‑5422130 | cACGGCCACGGTCAGGGTGCCGTCCATGTCGAACACCCAGTTGCGCACCTCGCCCAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAg > 1:730638/1‑150 (MQ=255) cGGCCCCGGTCAGGGTGCCGTCCATGTCGAACACCCAGTTGCGCACCTCGCCCAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGaa < 1:185657/150‑1 (MQ=255) aCGGTCAGGGTGCCGTCCATGTCGAACACCCAGTTGCGCACCTCGCCCAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCAc < 1:333644/150‑1 (MQ=255) ggTCAGGGTGCCGTCCATGTCGAACACCCAGTTGCGCACCTCGCCCAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACgg < 2:231790/150‑1 (MQ=255) ggTCAGGGTGCCGTCCATGTCGAACACCCAGTTGCGCACCTCGCCCAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACgg < 1:681375/150‑1 (MQ=255) ccGTCCATGTCGAACACCCAGTTGCGCACCTCGCCCAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCgg < 1:219829/150‑1 (MQ=255) gaccgtGTCGAACACCCAGTTGCGCACCTCGCCCAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGcc < 1:167276/145‑1 (MQ=255) gTCGAACACCCAGTTGCGCACCTCGCCCAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGCTGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAgggg > 2:538208/1‑150 (MQ=255) cccAGTTGCGCACCTCGCCCAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGt < 2:730638/150‑1 (MQ=255) cgcACCTCGCCCAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACa > 1:85817/1‑150 (MQ=255) cACCTCGCCCAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGt < 2:546448/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTg > 1:175248/1‑150 (MQ=255) aGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTggg > 1:413187/1‑149 (MQ=255) cccAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCa > 2:334055/1‑150 (MQ=255) cAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAgg > 1:421393/1‑150 (MQ=255) cAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAgg > 1:264810/1‑150 (MQ=255) tCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTATGCCGTCCTGGGTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCACGCAgtcga > 1:662446/1‑146 (MQ=255) ccTTGCGACGGCGAACCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCACGCAgtcgat < 2:662446/150‑6 (MQ=255) gCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTg < 1:334055/150‑1 (MQ=255) ggCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACCACAGCGAAt > 1:26205/1‑150 (MQ=255) cTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACCACAGCGAATGGTCGAg > 2:521554/1‑150 (MQ=255) tCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCgg > 1:393263/1‑69 (MQ=255) tCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCgg < 2:393263/69‑1 (MQ=255) gaTGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACCACAGCGAATGGTCGAGGCTGGCGATc > 1:698104/1‑150 (MQ=255) gCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACCACAGCGAATCGTCGAGGCTGGCGATCTGc < 1:285941/150‑1 (MQ=255) ccaccaGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACCACAGCGAATGGTCGAGGCTGGCGATCTGCa > 2:384878/1‑150 (MQ=255) caccaGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTg < 1:726078/93‑1 (MQ=255) caccaGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTg > 2:726078/1‑93 (MQ=255) accaGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACCACAGCGAATGGTCGAGGCTGGCGATCTGCATg > 2:694817/1‑150 (MQ=255) ccaGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACCACAGCGAATGGTCGAGGCTGGCGATCTGCATGt > 1:821170/1‑150 (MQ=255) caGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCggcaactggtggcatcgtcgagccaggaaggcctgattcgccatcgcaaggactgggcatgagcctgggcgaggtgcgcaactgggtgttcgacatggacggcaccctgaccgtggcc < 1:129969‑M2/150‑119 (MQ=255) aGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCggcaactggtggcatcgtcgagccaggaaggcctgattcgccatcgcaaggactgggcatgagcctgggcgaggtgcgcaactgggtgttc < 2:454204‑M2/122‑92 (MQ=255) aGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCggcaactggtggcatcgtcgagccaggaaggcctgattcgccatcgcaaggactgggcatgagcctgggcgaggtgcgcaactgggtgttc > 1:454204‑M2/1‑31 (MQ=255) cccGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACcaca > 2:100132/1‑113 (MQ=255) cccGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACcaca < 1:100132/113‑1 (MQ=255) gTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACCACAGCGAATGGTCGAGGCTGGCGATCTGCATGTCGCGCTGCCACACCGa > 1:636532/1‑150 (MQ=255) gAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGGGAAACCACAGCGAATGGTCGAGGCTGGCGATCTGCATGTCGCGCTGCCACACCGAttt < 2:264810/150‑1 (MQ=255) aaaTGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACCACAGCGAATGGTCGAGGCTGGCGATCTGCATGTCGCGCTGCCACACCGATTTGc < 1:63047/150‑1 (MQ=255) tgctgcCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACCACAGCGAATGGTCGAGGCTGGCGATCTGCATGTCGCGCTGCCACACCGATTTGCCAt < 1:538208/150‑1 (MQ=255) cgcgGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACCACAGCGAATGGTCGAGGCTGGCGATCTGCATGTCGCGCTGCCACACCGATTTGCCATGGGgca < 2:431539/150‑1 (MQ=255) | CACGGCCACGGTCAGGGTGCCGTCCATGTCGAACACCCAGTTGCGCACCTCGCCCAGGCTCATGCCCAGTCCTTGCGATGGCGAATCAGGCCTTCCTGGCTCGACGATGCCACCAGTTGCCCGGCCTGGTTGAAAATGCTGCCGCGGCAGAAGCCACGGGAATTGCCGGCCCAGGGGCTATCGGTGGCGTACAGTAGCCACTGGTCGGCGCGCAGGTTGCCGTGAAACCACAGCGAATGGTCGAGGCTGGCGATCTGCATGTCGCGCTGCCACACCGATTTGCCATGGGGCA > NC_002947/5421839‑5422130 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |