Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,777,050 | C→G | 8.0% | W166C (TGG→TGC) | PP_2429 ← | membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,777,050 | 0 | C | G | 8.0% | 198.5 / 4.6 | 68 | W166C (TGG→TGC) | PP_2429 | membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/30); new base G (4/2); total (35/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGAGGCGTTGACACGTTGAGCCGAGGCCGCTCAGGCCCCTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCATCAACCAGACCTTGGGGT > NC_002947/2776905‑2777198 | cgAGGCGTTGACACGTTGAGCCGAGGCCGCTCAGGCCCCTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCAcc > 2:138658/1‑150 (MQ=255) gAGGCGTTGACACGTTGAGCCCAGGCCGCTCAGGCCCCTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGGCACC‑g > 1:376524/1‑150 (MQ=255) gTTGACACGTTGAGCCGAGGCCGCTCAGGCCCCTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑gg > 2:714524/1‑146 (MQ=255) gTTGACACGTTGAGCCGAGGCCGCTCAGGCCCCTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑gg < 1:714524/146‑1 (MQ=255) tGACCCGTTGTGCCTGGCCCGCGAAGGCCCCTTGTCGGTAAAGTAGGGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTc < 2:376524/150‑1 (MQ=255) gTTGAGCCGAGGCCGCTCAGGCCCCTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCAcc > 2:218921/1‑150 (MQ=255) gCCGAGGCCGCTCAGGCCCCTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCaa > 1:526122/1‑150 (MQ=255) gCCGAGGCCGCTCAGGCCCCTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCaa > 1:4267/1‑150 (MQ=255) gCCGAGGCCCCTCAGGCCCCGTGTCGTTAAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATACCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCaa < 2:90049/150‑1 (MQ=255) gCCGCTCAGGCCCCTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGc > 2:221284/1‑150 (MQ=255) cGCTCAGGCCCCTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGccc > 2:620973/1‑150 (MQ=255) gCCCCTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGCCGCTCCCCCCCCCCAACACCGCCCAggcggc < 2:526122/150‑1 (MQ=255) ccccTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGcc < 1:568421/150‑1 (MQ=255) cccTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCa < 1:138658/150‑1 (MQ=255) ttGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGc > 2:154560/1‑150 (MQ=255) ttGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGc > 1:655551/1‑150 (MQ=255) gTCGGTCAAGTAGAGGCTGAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATA‑CAAGAAATAGTCGCTGCAACCACAGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTc < 2:839790/150‑1 (MQ=255) gTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCGCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCa > 1:93159/1‑150 (MQ=255) tCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCag > 2:531286/1‑150 (MQ=255) gTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCg > 1:354984/1‑150 (MQ=255) agGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCATCACCGCCCAGGCGGCCATGCTCTGCCGAGcatggc < 2:680195/150‑6 (MQ=255) gCTTAGGCAAATACTGCAGCCCATGCCCCTATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACACGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCACAACCCCAACATCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGc < 2:51109/150‑1 (MQ=255) gCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGc > 1:260748/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGc < 1:388007/141‑1 (MQ=255) tCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGc > 2:388007/1‑141 (MQ=255) ggCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCTTTTCCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGaa < 2:422848/150‑1 (MQ=255) aaTACTGCAGGCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCCTGCCCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACAcc > 2:491404/1‑150 (MQ=255) aaTACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCAACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACAcc > 2:667002/1‑150 (MQ=255) cATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGc > 1:268120/1‑150 (MQ=255) aTGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGcc > 1:638893/1‑150 (MQ=255) gCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATc > 2:297640/1‑123 (MQ=255) gCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATc < 1:297640/123‑1 (MQ=255) cGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCa < 1:635642/113‑1 (MQ=255) cGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCa > 2:635642/1‑113 (MQ=255) cGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCCCACCCGCCCCAGTGCCTGCCGTCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACTCCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCacac < 2:736019/150‑1 (MQ=255) atatCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGAt > 1:805981/1‑118 (MQ=255) atatCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGAt < 2:805981/118‑1 (MQ=255) atCAACAAT‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACTCTGGc < 2:384041/150‑1 (MQ=255) atCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCAATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGc < 1:227288/150‑1 (MQ=255) caacaaA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCaa > 2:126973/1‑150 (MQ=255) aacaaA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCa < 2:438537/115‑1 (MQ=255) aacaaA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCCGCCATGCTCGGCAGAGCGATCa > 1:438537/1‑115 (MQ=255) acaaA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAacg > 1:439582/1‑150 (MQ=255) aaa‑aCCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCCGCCACACTGGCAacgac < 2:439582/150‑1 (MQ=255) gCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCa > 2:665530/1‑115 (MQ=255) gCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCa < 1:665530/115‑1 (MQ=255) cTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATAccc < 2:268120/150‑1 (MQ=255) cTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATAccc < 1:154560/150‑1 (MQ=255) tGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGacca > 2:348578/1‑150 (MQ=255) aaCACGCGCAACCGCCCGGGTGCCTGCAGGCACC‑GGGCGCTCCCCGCCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGGAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAATGTTGGCGCGGCTGATACCGCGaccacc < 2:506588/150‑1 (MQ=255) cGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCAAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACg > 1:625976/1‑150 (MQ=255) cGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCATc < 2:638893/150‑1 (MQ=255) cccGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCATCAAc < 1:126973/150‑1 (MQ=255) cccGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCATCAAc < 2:260748/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGCTGCAGGCACCGGGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCATCAAc > 1:664572/1‑150 (MQ=255) ccGGTGGCTGCAGGCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTg < 1:771969/102‑1 (MQ=255) ccGGTGGCTGCAGGCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTg > 2:771969/1‑102 (MQ=255) ccGGTGGCTGCAGCCACCGGGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCAGCAAc > 2:477128/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAgc > 2:367331/1‑86 (MQ=255) ccGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAgc < 1:367331/86‑1 (MQ=255) cGGTGGCTGCAGGCACCGGGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCATCAAcc > 1:180782/1‑150 (MQ=255) cTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCa > 2:41788/1‑98 (MQ=255) cTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCa < 1:41788/98‑1 (MQ=255) cTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCATCAACCAGACCtt > 1:720587/1‑150 (MQ=255) tGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCATCAACCAGACCTTg < 1:218921/150‑1 (MQ=255) tGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCATCAACCAGACCTTg < 1:348578/150‑1 (MQ=255) tGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCATCAACCAGACCTTg < 1:620973/150‑1 (MQ=255) gCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCAAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCATCAACCAGACCTTgg < 2:625976/150‑1 (MQ=255) gccgcc‑GCGCGCGTCCCACCCACACCCCCGCCACGCCGGCCACGTTCGGCAGAGTGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCATCAACCAGACCTTGGGGt < 2:354984/150‑1 (MQ=255) | CGAGGCGTTGACACGTTGAGCCGAGGCCGCTCAGGCCCCTTGTCGGTCAAGTAGAGGCTCAGGCCAATACTGCAGCCCATGCCGATATCAACAAA‑ACCCCCGCCAACACTTGGTTGAACACCCGCAACCGCCCCGGTGCCTGCAGCCACC‑GGGCGCTCCCCACCCCCAACACCGCCCAGGCGGCCATGCTCGGCAGAGCGATCAGCAAGAACACCAGCGCCAGCTGCCACACTGGCAACGACGGCGCGGCAAATACCCCGACCACCGCCACGGCCATCAACCAGACCTTGGGGT > NC_002947/2776905‑2777198 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |