Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,514,494 | A→G | 13.1% | V181A (GTC→GCC) | ftsK ← | DNA translocase FtsK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,514,494 | 0 | A | G | 13.1% | 91.7 / 4.1 | 37 | V181A (GTC→GCC) | ftsK | DNA translocase FtsK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (17/15); new base G (2/3); total (19/18) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.60e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.96e-01 |
CGTCCTCGCGCAGCTGTGCCTCAAGGCGCTTGCGCTCGTTGCGCGCTTCCCACCAGCGGGTGGCAGCCCCTTGCACCAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTCAGCAGGTTGCGCGCCAGGTCGCCCAGGCTTTCGCCCAGTGCTCCACCGGCGGAGAACGGCAGGCTGGCGGGCGGGTGGAAGTGGATATGC > NC_002947/4514348‑4514640 | cGTCCTCGCGCAGCGGTGCCTCAAGGCGCTTGCGCTCGTTGCGCGCTTCCCACCAGCGGGTGGCAGCCCCTTGCACCAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACgg < 1:377483/150‑1 (MQ=255) tCGCGCAGCTGTGCCTCAAGGCGCTTGCGCTCGTTGCGCGCTTCCCACCAGCGGGTGGCAGCCCCTTGCACCAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAGCCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAgg < 1:429361/150‑1 (MQ=255) gcAGCTGTGCCTCAAGGCGCTTGCGCTCGTTGCGCGCTTCCCACCAGCGGGTGGCAGCCCCTTGCACCAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCga > 2:448469/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGCGCTTGCGCTCGTTGCGCGCTTCCCACCAGCGGGTGGCAGCCCCTTGCACCAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGCTGAAGACGGTCAGGCCcaacaggaacag > 2:374966/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCGCTTGCGCTCGTTGCGCGCTTCCCACCAGCGGGTGGCAGCCCCTTGCACCAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCgaaca < 1:731641/142‑1 (MQ=255) tCAAGGCGCTTGCGCTCGTTGCGCGCTTCCCACCAGCGGGTGGCAGCCCCTTGCACCAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCgaaca > 2:731641/1‑142 (MQ=255) cTTCCCACCAGCGGGTGGCAGCCCCTTGCACCAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGGCGGGGGTCATGGCTATCGTGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCt < 1:575271/150‑1 (MQ=255) cAGCCCCTTGCACCAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTCAGCAGGTTgc > 1:416031/1‑150 (MQ=255) aGCCCCTTGCACCAGTTCGAGCAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCa > 2:573237/1‑119 (MQ=255) aGCCCCTTGCACCAGTTCGAGCAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCa < 1:573237/119‑1 (MQ=255) cAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGGCGGTCAGGc > 1:650694/1‑80 (MQ=255) cAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGGCGGTCAGGc < 2:650694/80‑1 (MQ=255) cAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGGCGGTCAGGc < 2:650655/80‑1 (MQ=255) cAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGGCGGTCAGGc > 1:650655/1‑80 (MQ=255) gAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTc > 2:313868/1‑70 (MQ=255) gAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTc < 1:313868/70‑1 (MQ=255) gAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTcagcag < 1:239277/126‑1 (MQ=255) gAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTcagcag > 2:239277/1‑126 (MQ=255) aaCAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTcag > 1:44428/1‑122 (MQ=255) aaCAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTcag < 2:44428/122‑1 (MQ=255) aGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTCAGCAGGTTGCGCGCCAGGTCGCCCAGGCTTTCg < 2:416031/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCa < 2:749332/65‑1 (MQ=255) gTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCa > 1:749332/1‑65 (MQ=255) gAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTCAGCAGGTTGCGCGCCAGGTCGCCCAGGCTTTCGCCCAg > 2:176002/1‑150 (MQ=255) gggTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTCAGCAGGTTGCGCGCCAGGTCGCCCAGGCTTTCGCCCAGTg < 1:448469/150‑1 (MQ=255) tCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTca > 2:350976/1‑96 (MQ=255) tCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTca < 1:350976/96‑1 (MQ=255) aGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTCAGCAGGTTGCGCGCCAGGTCGCCCAGGCTTTCGCCCAGTGCTCCACCGGCGGAGAAc > 2:705086/1‑150 (MQ=255) ggTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTCAGCAGGTTGCGCGCCAGGTCGCCCAGGCTTTCGCCCAGTGCTcc > 2:518763/1‑136 (MQ=255) ggTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTCAGCAGGTTGCGCGCCAGGTCGCCCAGGCTTTCGCCCAGTGCTcc < 1:518763/136‑1 (MQ=255) gTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAggg < 2:245993/59‑1 (MQ=255) gTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAggg > 1:245993/1‑59 (MQ=255) gTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTCAGCAGGTTGCGCGCCa < 2:744357/107‑1 (MQ=255) gTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAAACGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTCAGCAGGTTGCGCGCCa > 1:744357/1‑107 (MQ=255) tCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTCAGCAGGTTGCGCGCCAGGTCGCCCAGGCTTTCGCCCAGTGCTc > 1:593955/1‑129 (MQ=255) tCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTCAGCAGGTTGCGCGCCAGGTCGCCCAGGCTTTCGCCCAGTGCTc < 2:593955/129‑1 (MQ=255) aaGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGTACGTCAGCGTGCTGCCCGTCGCGTTCAGCAGGTTGCGCGCCAGGTCGCCCAGGCTTTCGCCCAGTGCTCCACCGGCGGAGAACGGCAGGCTGGCGGGCGGGTGGAAGTGGATATgc > 1:447552/1‑150 (MQ=255) | CGTCCTCGCGCAGCTGTGCCTCAAGGCGCTTGCGCTCGTTGCGCGCTTCCCACCAGCGGGTGGCAGCCCCTTGCACCAGTTCGAACAGGTCGAGGGTGATCTTGCCGGTCAGGTCCATCACCTTGAACCACGACAGGTCGGTGAAGACGGTCAGGCCGAACAGGAACAGGGCAATGAACATCAGCGTGCTGCCCTGCACGTTCAGCAGGTTGCGCGCCAGGTCGCCCAGGCTTTCGCCCAGTGCTCCACCGGCGGAGAACGGCAGGCTGGCGGGCGGGTGGAAGTGGATATGC > NC_002947/4514348‑4514640 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |