New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2679659 = | 9 (0.690) | 3 (0.240) | 3/264 | 1.4 | 22.5% | coding (357/1155 nt) | PP_2349 | CBS domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 2679701 = | 12 (0.950) | coding (399/1155 nt) | PP_2349 | CBS domain‑containing protein |
GGCCCCTTGGCCCAACCTTGGCCGGTGTTGGGCAGCTACGCCCTGGCGGGTGCAGTGGGGCTGGCCATGCGCGAAGGCTTCGGCCCCGAGCTGTGGGTGGCTGCTGCGGCGCTCGGCATCTCGATCCTGGTCATGTGCCTGTTGCGCTGCCTGCACCCGCCGGGTGGCGGTGTGGCAGTGAGCGCGGTGCTGGCCGACCCGGGGTTGACCGCTCTGGGCGATCACCTGCTGGAGCCGGTGCTGCTCAATGCGTTGATCCTGGTGACAGTGGCAATCGCCTACAACCGTTT > NC_002947/2679516‑2679805 | ggCCCCTTGGCCCAACCTTGGCCGGTGTTGGGCAGCTACGCCCTGGCGGGTGCAGTGGGGCTGGCCATGCGCGAAGGCTTCGGCCCCGAGCTGTGGGTGGCTGCTGCGGCGCTCGGCATCTCGATCCTGGTCATGTGCCTGTTGCGctgc < 1:191091/150‑1 (MQ=255) ttGGCCCAACCTTGGCCGGTGTTGGGCAGCTACGCCCTGGCGGGTGCAGTGGGGCTGGCCATGCGCGAAGGCTTCGGCCCCGAGCTGTGGGTGGCTGCTGCGGCGCTCGGCATCTCGATCCTGGTCATGTGCCTGTTGCGCTGCCTGCAc < 2:12859/150‑1 (MQ=255) aaacggttgtaggcgattgccactgtcaccaggatcaacgcattgagcagcaccggctccagcaggtgatcgcccagagcggtcaaccccgggtcggccagcaccGCGCTGCCTGCACCCGCCGGGTGGCGGTGTGGCAGTGAGCGCGGt > 1:224687‑M1/106‑150 (MQ=255) gCTGGCCATGCGCGAAGGCTTCGGCCCCGAGCTGTGGGTGGCTGCTGCGGCGCTCGGCATCTCGATCCTGGTCATGTGCCTGTTGCGCTGCCTGCACCCGCCGGGTGGCGGTGTGGCAGTGAGCGCGGTGCTGGCCGACCCGGGGTTGAc < 1:175321/150‑1 (MQ=255) gCCATGCGCGAAGGCTTCGGCCCCGAGCTGTGGGTGGCTGCTGCGGCGCTCGGCATCTCGATCCTGGTCATGTGCCTGTTGCGCTGCCTGCACCCGCCGGGTGGCGGTGTGGCAGTGAGCGCGGTGCTgg > 1:130662/1‑130 (MQ=255) gCCATGCGCGAAGGCTTCGGCCCCGAGCTGTGGGTGGCTGCTGCGGCGCTCGGCATCTCGATCCTGGTCATGTGCCTGTTGCGCTGCCTGCACCCGCCGGGTGGCGGTGTGGCAGTGAGCGCGGTGCTgg < 2:130662/130‑1 (MQ=255) ccATGCGCGAAGGCTTCGGCCCCGAGCTGTGGGTGGCTGCTGCGGCGCTCGGCATCTCGATCCTGGTCATGTGCCTGTTGCGCTGCCTGCACCCGCCGGGTGGCGGTGTGGCAGTGAGCGCGGTGCTGGCCGACCCgg < 1:250185/138‑1 (MQ=255) ccATGCGCGAAGGCTTCGGCCCCGAGCTGTGGGTGGCTGCTGCGGCGCTCGGCATCTCGATCCTGGTCATGTGCCTGTTGCGCTGCCTGCACCCGCCGGGTGGCGGTGTGGCAGTGAGCGCGGTGCTGGCCGACCCgg > 2:250185/1‑138 (MQ=255) agcaggtgatcgcccagagcggtcaaccccgggtcggccagcaccGCGCTGCCTGCACCCGCCGGGTGGCGGTGTGGCAGt < 1:290820‑M1/36‑1 (MQ=255) agcaggtgatcgcccagagcggtcaaccccgggtcggccagcaccGCGCTGCCTGCACCCGCCGGGTGGCGGTGTGGCAGt > 2:290820‑M1/46‑81 (MQ=255) ccTGTTGCGCTGCCTGCACCCGCCGGGTGGCGGTGTGGCAGTGAGCGCGGTGCTGGCCGACCCGGGGTTGACCGCTCTGGGCGATCACCTGCTGGAGCCGGTGCTGCTCAATGCGTTGATCCTGGTGACAGTGGCAATCGCCTACAACCg > 2:21387/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCTGCCTGCACCCGCCGGGTGGCGGTGTGGCAGTGAGCGCGGTGCTGGCCGACCCGGGGTTGACCGCTCTGGGCGATCACCTGCTGGAGCCGGTGCTGCTCAATGCGTTGATCCTGGTGACAGTGGCAATCGCCTACAACCGttt > 1:39934/1‑150 (MQ=255) | GGCCCCTTGGCCCAACCTTGGCCGGTGTTGGGCAGCTACGCCCTGGCGGGTGCAGTGGGGCTGGCCATGCGCGAAGGCTTCGGCCCCGAGCTGTGGGTGGCTGCTGCGGCGCTCGGCATCTCGATCCTGGTCATGTGCCTGTTGCGCTGCCTGCACCCGCCGGGTGGCGGTGTGGCAGTGAGCGCGGTGCTGGCCGACCCGGGGTTGACCGCTCTGGGCGATCACCTGCTGGAGCCGGTGCTGCTCAATGCGTTGATCCTGGTGACAGTGGCAATCGCCTACAACCGTTT > NC_002947/2679516‑2679805 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |