| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5864480 | 14 (1.070) | 5 (0.410) | 4/258 | 1.1 | 32.1% | coding (1727/2253 nt) | cadA‑III | cadmium translocating P‑type ATPase |
| ? | NC_002947 | = 5864515 | 8 (0.650) | coding (1692/2253 nt) | cadA‑III | cadmium translocating P‑type ATPase | |||||
GCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGACAGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCCGGAGCGGTCAAGCAGCAGGACCACGGTCTTGCCCTGGCGCTCCAGCGCATCCAGTTGGGCCTCCAGCGCTGGCGAACACAGCCCCAGCTCCTCGACCAGGCGGTGGTTGCCCA > NC_002947/5864333‑5864624 | gccggcAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGACAGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCgtg > 2:117888/1‑150 (MQ=255) gcAACAGGTTGCCCTCTGCGCGGTCGATTCCCACCACGTCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGTTCAGCATGACAGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGTGTCgg < 1:2567/150‑1 (MQ=255) gcAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGACAGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGTGTCgg > 1:44782/1‑150 (MQ=255) gCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGACAGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGTGTCGGCCACGGCGaa < 1:140095/150‑1 (MQ=255) cGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGACAGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTg < 1:156255/150‑1 (MQ=255) gATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGACAGCCTTGATATCCAGCTGATGCAATTCGACGATCGCCTGACGGCAGCTATCCTTGACCGTGTCGGCCACGGCGAACACTGCCAGTGAccc > 1:40533/1‑150 (MQ=255) tCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGACAGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCCGGa < 2:44782/150‑1 (MQ=255) acGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGACAGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCCGGAGcggtca > 2:248036‑M2/1‑144 (MQ=255) cagcaATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGACAGTCTTGATCCCCAGCTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGcgccgggccactggcactgttcgccgtggccgacacggtcaagga < 2:228648‑M1/150‑46 (MQ=255) cTGCGCAGTATGCTGATTTTCACCGGTCAGTAGGACCGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTTCTGTTCTTTACCGTGTCGGCCACGGCGAATAGTGCCAGTGGCCCGGAGCGGTCAAGCAGCAGGGccgt < 2:40533/150‑3 (MQ=255) gcAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGACAGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGtgtcggccactggcactgttcgccgtggccgacacggtcaa > 1:312586‑M1/1‑91 (MQ=255) gcAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGACAGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGtgtcggccactggcactgttcgccgtggccgacacggtcaa < 2:312586‑M1/132‑42 (MQ=255) tgTAAGCGGAGTGTCACCGGTCGGCAGAACAGTCTTGATACCCATCTGATGCAATTCGGCTATCCCTTGACGGCTGCGGCCTTTGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCCGGAGCGGTCAAGCAGCAGGACCACGGTCtt < 2:16937/149‑1 (MQ=255) aCCGGTCAGCATGACAGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTTGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGctccgggccactggcactgttcgccgtggccgacacggtcaa > 1:117925‑M1/1‑74 (MQ=255) aCCGGTCAGCATGACAGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTTGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGctccgggccactggcactgttcgccgtggccgacacggtcaa < 2:117925‑M1/116‑43 (MQ=255) cTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCCGGAGCGGTCAAGCAGCAGGACCACGGTCTTGCCCTGGCGCTCCAGCGCATCCAGTTGGGCCTCCAGCGCTGGCGa < 2:10774/150‑1 (MQ=255) ggCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCCGGAGCGGTCAAGCAGCAGGACCACGGTCTTGCCCTGGCGCTCCAGCGCATCCAGTTGGGCCTCCAGCGCTGGCGAACACAGCCCCAg < 1:117888/150‑1 (MQ=255) tCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCCGGAGCGGTCAAGCAGCAGGACCACGGTCTTGCCCTGGCGCTCCAGCGCATCCAGTTGGGCCTCCAGCGCTGGCGAACACAGCCCCAGctcct > 1:36700/1‑150 (MQ=255) ctgctgTCCTTGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCCGGAGCGGTCAAGCAGCAGGACCACGGTCTTGCCCTGGCGCTCCAGCGCATCCAGTTGGGCCTCCAGCGCTGGCGAACACAGCCCCAGCTCCTCGAc > 2:243682/1‑143 (MQ=255) ctgctgTCCTTGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCCGGAGCGGTCAAGCAGCAGGACCACGGTCTTGCCCTGGCGCTCCAGCGCATCCAGTTGGGCCTCCAGCGCTGGCGAACACAGCCCCAGCTCCTCGAc < 1:243682/143‑1 (MQ=255) tCCTTGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCCGGCGcggtcaaggacagcagccgtcaggcgatcgccgaattgcatcagctggggatcaagactgtcatgctgaccggtgacaatccgcatactgcgcaggccattgctg < 2:228648‑M2/150‑106 (MQ=255) ttGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCGACAggtcaaggacagcagccgtcaggcgatcgccgaattgcatcagctgggtatcaagactgtcatgctgaccggtgacaatccgcatactgc < 2:312586‑M2/132‑91 (MQ=255) ttGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCGACAggtcaaggacagcagccgtcaggcgatcgccgaattgcatcagctgggtatcaagactgtcatgctgaccggtgacaatccgcatactgc > 1:312586‑M2/1‑42 (MQ=255) ttGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCCGGAGcggtcaaggacagcagccgtcaggcgatcgccaaattgcatcagctgggtatcaagactgtcatgctgaccggt < 2:117925‑M2/116‑75 (MQ=255) ttGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCCGGAGcggtcaaggacagcagccgtcaggcgatcgccaaattgcatcagctgggtatcaagactgtcatgctgaccggt > 1:117925‑M2/1‑42 (MQ=255) tGACCGctccgggccactggcactgttcgccgtggccgacacggtcaaggacagcagccgtcaggcgatcgccgaattgcatcagctgggtatcaagactgtcatgctgaccggtgacaatccgcatactgcgcaggccattgctgccgt > 2:248036‑M1/1‑6 (MQ=255) | GCCGGCAACAGGTTGCCCTCGGCGCGGTCGATTCCCACCACGGCAGCAATGGCCTGCGCAGTATGCGGATTGTCACCGGTCAGCATGACAGTCTTGATACCCAGCTGATGCAATTCGGCGATCGCCTGACGGCTGCTGTCCTTGACCGTGTCGGCCACGGCGAACAGTGCCAGTGGCCCGGAGCGGTCAAGCAGCAGGACCACGGTCTTGCCCTGGCGCTCCAGCGCATCCAGTTGGGCCTCCAGCGCTGGCGAACACAGCCCCAGCTCCTCGACCAGGCGGTGGTTGCCCA > NC_002947/5864333‑5864624 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |