| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,057,006 | Δ1 bp | 8.0% | coding (385/990 nt) | PP_2669 ← | outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,057,006 | 0 | T | . | 8.0% | 379.8 / 27.9 | 125 | coding (385/990 nt) | PP_2669 | outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (61/54); new base . (3/7); total (64/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.74e-01 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GGTCTGGGTGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCACGTCCATCACCTGCACCCGGTCCGAATCG > NC_002947/3056860‑3057154 | ggTCTGGGTGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCAc < 2:1206228/150‑1 (MQ=255) tCTGGGTGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCg > 1:1122908/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTGATCGA‑CACCGt < 2:1986705/150‑1 (MQ=255) tGGGTGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTc > 1:1020219/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGTCTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTGATCGA‑CACCGTCAc < 2:1191324/150‑1 (MQ=255) tGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACCTGCATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCa < 1:2360492/150‑1 (MQ=255) gATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTGATCGA‑CACCGTCAcc > 2:697194/1‑139 (MQ=255) gATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGGTCACCGTCa > 1:879523/1‑137 (MQ=255) gATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCa < 2:879523/137‑1 (MQ=255) gATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTc < 1:732762/150‑1 (MQ=255) tCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATc > 1:1194612/1‑145 (MQ=255) tCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCt > 1:251971/1‑150 (MQ=255) tCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGCCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATc < 2:1194612/145‑1 (MQ=255) aGTGCAGCATGTTGGTGGGTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGt > 2:1700301/1‑150 (MQ=255) gTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑TGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGtt < 2:1186089/150‑1 (MQ=255) gTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGtt < 2:1510371/150‑1 (MQ=255) tGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGttt < 2:1865353/150‑1 (MQ=255) tGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGttt < 2:969526/150‑1 (MQ=255) gcaTGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGata > 1:984601/1‑150 (MQ=255) tGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATc < 2:874580/133‑1 (MQ=255) tGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATc > 1:874580/1‑133 (MQ=255) tGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑AGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGatacat < 1:1858882/150‑1 (MQ=255) ggtggtTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCCTTTGATACATAcag > 2:1751032/1‑150 (MQ=255) gtTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATAcagccag < 1:840188/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTc > 2:302339/1‑150 (MQ=255) cTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCg > 1:2030835/1‑150 (MQ=255) tGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTc < 1:1710898/148‑1 (MQ=255) gtTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTggg < 2:2034340/150‑1 (MQ=255) cGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATCCATACTTCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAg > 2:2361053/1‑150 (MQ=255) gCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAgg < 2:2030835/150‑1 (MQ=255) cACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTTGGGTGCAggggg > 1:1013829/1‑148 (MQ=255) cACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCg > 1:396775/1‑150 (MQ=255) aCTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCAcc < 1:753028/89‑1 (MQ=255) aCTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCAcc > 2:753028/1‑89 (MQ=255) aCTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGa > 1:1035693/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGGCGTATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGaa > 1:22596/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGTCGGGGATGACAGCAATGCCTTCGGGACAGTTGCCTACTTCTATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGaa < 2:22596/150‑1 (MQ=255) ttGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAAc < 2:326416/150‑1 (MQ=255) ttGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAAc < 1:1473868/150‑1 (MQ=255) ggggCTGACCGCCGTGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCCGGACGATCCGCGATAACAGGCA‑GCG‑TCGGCCGCGCCAGCGCATCGTCCCCGCTTGATACCCATTGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCggg < 1:551265/150‑1 (MQ=255) ggggCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCggg > 2:303299/1‑150 (MQ=255) gggCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCgggg > 1:2302820/1‑150 (MQ=255) gggCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCg > 1:2155475/1‑147 (MQ=255) gggCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCg < 2:2155475/147‑1 (MQ=255) gCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTc > 1:224174/1‑150 (MQ=255) cTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTcc < 1:1751032/150‑1 (MQ=255) tGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGttt > 1:962899/1‑98 (MQ=255) tGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGttt < 2:962899/98‑1 (MQ=255) ccGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGat > 2:320241/1‑98 (MQ=255) ccGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGat < 1:320241/98‑1 (MQ=255) ccGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGc > 1:1772199/1‑150 (MQ=255) ccATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCgg > 2:651465/1‑150 (MQ=255) ccATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCgg > 1:1436204/1‑150 (MQ=255) ccATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAACATCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGCTCACCGTCACCAGCGCATAGTCTTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGCGCTCCTTTCCgg > 2:320809/1‑150 (MQ=255) cATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTgggg > 1:431946/1‑118 (MQ=255) cATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTgggg < 2:431946/118‑1 (MQ=255) aTGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCTCCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCAGCGTCACCAGCGCGTCGTCCTCGTGTGATACATACATCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGaa < 1:772625/150‑1 (MQ=255) tGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCTGAGCCCCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAg < 1:998675/150‑1 (MQ=255) ccTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACGGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGc < 2:1722448/150‑1 (MQ=255) ccTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGc < 1:2361053/150‑1 (MQ=255) cTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCa > 1:383071/1‑150 (MQ=255) cTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCa > 2:171527/1‑150 (MQ=255) gTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCt > 2:227529/1‑150 (MQ=255) gTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCt < 1:651465/150‑1 (MQ=255) ttCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCg < 2:555350/136‑1 (MQ=255) ttCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCg > 1:555350/1‑136 (MQ=255) ttCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCtt < 2:286296/150‑1 (MQ=255) aTGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTtgatg > 2:255883/1‑150 (MQ=255) cGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTc > 1:1002304/1‑121 (MQ=255) gACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTcc > 2:121686/1‑139 (MQ=255) gACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTcc < 1:121686/139‑1 (MQ=255) cTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGc < 1:255883/150‑1 (MQ=255) ttCTGCGGGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCTTCCCCCGCGCATCGTCCCCGCTTTGTAGATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGACGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTg < 2:455415/149‑1 (MQ=255) tCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTgg > 1:1647020/1‑150 (MQ=255) tCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTg < 2:858046/149‑1 (MQ=255) tGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAAc < 2:667115/99‑1 (MQ=255) tGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAAc > 1:667115/1‑99 (MQ=255) cccGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCAc > 1:895544/1‑150 (MQ=255) gAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTg > 2:2089498/1‑79 (MQ=255) gAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTg < 1:2089498/79‑1 (MQ=255) gAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGc > 2:862636/1‑118 (MQ=255) gAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGc < 1:862636/118‑1 (MQ=255) gAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCACGTc < 1:1700301/150‑1 (MQ=255) ccTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGatacata > 2:1600696/1‑58 (MQ=255) ccTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCACGTCCATCa > 2:1339197/1‑150 (MQ=255) cTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCACGTCCATCAc > 2:916609/1‑150 (MQ=255) cTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGGCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCACGTCCATCAc > 1:1681515/1‑150 (MQ=255) ttGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCACGTCCATCAcc < 2:1020219/150‑1 (MQ=255) ggTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCACGTCCATCACCTGCAc > 1:1359577/1‑150 (MQ=255) ggTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCAACCAAACAGCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCACGTCCATCACCTGCAc > 1:1872444/1‑150 (MQ=255) gTGAC‑GGTGATCGA‑CACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCt < 1:1159917/112‑1 (MQ=255) gTGAC‑GGTGATCGA‑CACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCt > 2:1159917/1‑112 (MQ=255) gAC‑GGTGATCGA‑CACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCACGTCCATCACCTGCACCCg < 1:211344/150‑1 (MQ=255) gtg‑tCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCACGTCCATCACCTGCACCCGGTcc < 1:1339197/150‑1 (MQ=255) tCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCACGTCCATCACCTGCACCCGGTCCGaa < 2:383071/150‑1 (MQ=255) gATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACGCCTTGTTTATCTGGCGGTTTGCCTCGTCCAGCACCGGCACCCGGTCCgcaaa > 2:507876/1‑146 (MQ=255) aTCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCgg > 1:934145/1‑48 (MQ=255) aTCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCgg < 2:934145/48‑1 (MQ=255) aTCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGGTGATCTTGCGGGTGGCCACGTCCATCACCTGCACCCGGTCCGAATCg > 1:2068979/1‑150 (MQ=255) aTCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCACGTCCATCACCTGCACCCGGTCCGAATCg > 2:1017151/1‑150 (MQ=255) | GGTCTGGGTGCTGGTGTCGATCCAGTGCAGCATGTTGGTGGTTTCGCTGGTGTTGACCGCCCACTTGCCGTCGGGGCTGACCGCCATGCCTTCGGGTTCGATGCCGACTTCGATCTGCCCGAGCACCTTGTCGGTGAC‑GGTG‑TCGATCACCGTCACCAGCGCATCGTCCTCGTTTGATACATACAGCCAGCGGTCGTTGGGGTGCAGGGCGAACTGCTCGGGGTCCTTGCCGGAAGGCAACTCCTTGATGATCTTGCGGGTGGCCACGTCCATCACCTGCACCCGGTCCGAATCG > NC_002947/3056860‑3057154 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |