| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,199,444 | Δ1 bp | 8.9% | coding (114/582 nt) | PP_2806 ← | TetR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,199,444 | 0 | T | . | 8.9% | 233.5 / 18.0 | 79 | coding (114/582 nt) | PP_2806 | TetR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/30); new base . (4/3); total (46/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.81e-01 | |||||||||||
TTTCCCCCACCGATTCCGCCGCCGTGGCGCCTGTCGGCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGCGTTCTCCCTTTTCGGTATTGCCGCCGGCC > NC_002947/3199299‑3199591 | tttCCCCCACCGATTCCGCCGCCGTGGCGCCTGTCGGCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATctgctg > 2:2396587/1‑150 (MQ=255) cACCGATTCCGCCGCAGTGGCGCCTGTCGGCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGc < 2:2207453/150‑1 (MQ=255) aCCGATTCCGCCGCCGTGGCGCCTGTCGGCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑g > 2:1830963/1‑150 (MQ=255) ccGATTCCGCCGCCGTGGCGCCTGTCGGCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑Ga < 1:1435408/150‑1 (MQ=255) gATTCCGCCGCCGTGGCGCCTGTCGGCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTCGGGGTGGAAGACATCGTGCCGCGTCGTCAACGGCGAATGTGCTGCCGCAGC‑AAtt > 2:443134/1‑150 (MQ=255) tCCGCCGCCGTGGCGCCTGTCGGCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGc < 2:53830/150‑1 (MQ=255) gccgccgTGGCGCCTGTCGGCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGTGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCgg < 1:676754/150‑1 (MQ=255) gTGGCGCCTGTCGGCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTtgtg < 2:948043/150‑1 (MQ=255) gcCTGTCGGCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGtt > 2:185269/1‑150 (MQ=255) gcCTGTCGGCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATC‑GCTGCGGCAGCAGATTc < 2:2048052/134‑1 (MQ=255) gcCTGTCGGCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATC‑GCTGCGGCAGCAGATTc > 1:2048052/1‑134 (MQ=255) ggCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGtt < 1:161089/135‑1 (MQ=255) ggCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGtt > 2:161089/1‑135 (MQ=255) gtgtTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATg > 1:1183887/1‑150 (MQ=255) gCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAAACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCcg > 2:2079424/1‑150 (MQ=255) aaCGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCTTAAACCGCATAGAACAGCTCGCACTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCcgcg > 2:811512/1‑150 (MQ=255) aCGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGa > 2:2113783/1‑150 (MQ=255) aTTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCa < 1:2113783/150‑1 (MQ=255) gttgCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCt < 2:1183887/150‑1 (MQ=255) ttgCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCtt > 2:211965/1‑150 (MQ=255) gCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCa > 2:842158/1‑150 (MQ=255) gTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGc < 1:1830963/150‑1 (MQ=255) tCAAGGACTCGTAGACCCCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCAccc < 2:1203774/117‑1 (MQ=255) tCAAGGACTCGTAGACCCCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCAccc > 1:1203774/1‑117 (MQ=255) caacggACTCGCAGACCTCATAGAACATCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGa > 2:890910/5‑150 (MQ=255) aaGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTCGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCCGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGCTa > 1:861260/1‑150 (MQ=255) aGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATaa > 2:1864010/1‑150 (MQ=255) ggACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATaaa > 1:904479/1‑150 (MQ=255) tCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGT‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTcc < 1:1449890/150‑1 (MQ=255) tCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGAGGCCCGCGGCCAATCTGGTGTCGCAGC‑GATGCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCGCCCCCGGTTCCGCGACCGCCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTcc > 2:2077066/1‑150 (MQ=255) gACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTcctgcct < 1:842158/150‑1 (MQ=255) aCCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTtgtg < 1:364235/90‑1 (MQ=255) aCCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTtgtg > 2:364235/1‑90 (MQ=255) cGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTcctgcctccc > 2:358227/1‑147 (MQ=255) cGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTcct < 1:1050075/143‑1 (MQ=255) cGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTcct > 2:1050075/1‑143 (MQ=255) aTAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCTCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGctc > 1:1076733/1‑150 (MQ=255) aTAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGctc < 1:211965/150‑1 (MQ=255) aGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCtt < 1:1692917/150‑1 (MQ=255) aatggCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCa > 2:1569276/5‑150 (MQ=255) aaCAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCa > 1:476865/1‑150 (MQ=255) aCAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCGGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAg < 2:889970/150‑1 (MQ=255) aCAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAg < 1:890910/150‑1 (MQ=255) aCAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGACGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAg > 1:326850/1‑150 (MQ=255) gtttCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCtt < 1:2238514/142‑1 (MQ=255) gtttCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCGCtt > 2:2238514/4‑145 (MQ=255) gCTCTTCCTTAGTGGGGAATACATAGTGCACCGATGCCAGCTGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCAc < 2:1076733/150‑1 (MQ=255) tCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCa > 2:376912/1‑150 (MQ=255) gTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTc < 1:1793757/62‑1 (MQ=255) gTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTc > 2:1793757/1‑62 (MQ=255) gTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAAt > 2:2285846/1‑150 (MQ=255) gTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAAt > 2:483706/1‑150 (MQ=255) tCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGa > 1:1110998/1‑97 (MQ=255) tCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGa < 2:1110998/97‑1 (MQ=255) ttGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGTGAATGG‑TATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGa < 2:64611/150‑1 (MQ=255) ttGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGa < 1:1864010/150‑1 (MQ=255) gttgAAGACAAAGCGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCAt < 2:476865/147‑1 (MQ=255) tgGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTgg > 2:1308224/1‑70 (MQ=255) tgGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTgg < 1:1308224/70‑1 (MQ=255) tgGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCAtt < 1:1569276/150‑1 (MQ=255) tgGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCAtt < 1:1917275/150‑1 (MQ=255) gAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGa > 1:2271360/1‑150 (MQ=255) gAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGa > 2:2251304/1‑150 (MQ=255) aGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCTCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGc > 2:1392032/1‑150 (MQ=255) aTAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGCGTtc > 2:2137372/1‑150 (MQ=255) gTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGGCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTCCATGCGCACTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGCGTTCTcc > 2:446289/1‑150 (MQ=255) gTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGCGTTCTcc > 1:834357/1‑150 (MQ=255) aaCGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGCGTTCTCCCttt > 1:317735/1‑150 (MQ=255) aaCGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGCGTTCTCCCttt > 1:884502/1‑150 (MQ=255) aCGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGCGTTCTCCCtttt > 1:659177/1‑150 (MQ=255) aTGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGCGTTCTCCCTTTTCg < 1:1898486/149‑1 (MQ=255) aTGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGCGTTCTCCCTTTTCg > 2:1898486/1‑149 (MQ=255) caacccggcgAATC‑GCTGCGGCAGCAGATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGctct < 2:125975/103‑1 (MQ=37) caacccggcgAATC‑GCTGCGGCAGCAGATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGctct > 1:125975/6‑108 (MQ=37) cAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCAGCTGGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGAGATCTTGAGCAGCAATCCGAGCCATTGAGCGTTCTCCCTTTTCGGTAtt > 1:2340762/1‑150 (MQ=255) ccggcgAATC‑GCTGCGGCAGCAGATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCtt > 1:688315/2‑105 (MQ=38) ccggcgAATC‑GCTGCGGCAGCAGATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCtt < 2:688315/104‑1 (MQ=38) cggagAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGCGTTCTCCCTTTTCGGTATTgcc < 1:446289/150‑1 (MQ=255) cgAATC‑GCTGCGGCAGCAGATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGCGTTCTCCCTTTTCGGTATTgccgcc > 2:376437/1‑150 (MQ=255) tCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGCGTTCTCCCTTTTCGGTATTGCCGCCGGcc > 1:821364/1‑150 (MQ=255) | TTTCCCCCACCGATTCCGCCGCCGTGGCGCCTGTCGGCACGTGTTGCAACGATTGTTGCGGCATGTTGATCAAGGACTCGTAGACCGCATAGAACAGCTCGTCCTTGGTGTGGAAGACATAGTGCAACGATGCCAGCGGCGAATCTGCTGCCGCAGC‑GATTCGCCGGGTTGTGGCGTTGGCCACCCCATGTTCCGCGATCACCTTCACGGTGGCCTCGATAAAGTCCTGCCTGCGCTCTTCAGCACCAATCCGAGCCATTGAGCGTTCTCCCTTTTCGGTATTGCCGCCGGCC > NC_002947/3199299‑3199591 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |