Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,625,587 | Δ1 bp | 5.4% | intergenic (‑57/+20) | PP_3195 ← / ← PP_3196 | hypothetical protein/nodulation protein d1 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,625,587 | 0 | T | . | 5.4% | 226.4 / 6.9 | 74 | intergenic (‑57/+20) | PP_3195/PP_3196 | hypothetical protein/nodulation protein d1 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/31); new base . (2/2); total (41/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.06e-01 |
CGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGAATTCACGCATA > NC_002947/3625442‑3625736 | cGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTgg < 1:1486080/150‑1 (MQ=255) ggTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGAATGCGAGGTATAGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTggg < 1:2233638/150‑1 (MQ=255) gTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGTCGACAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCAAG‑CACCGCTGCGGTGTCTgggg > 1:760923/1‑150 (MQ=255) tCGTGGAGTCCGACGCCCACTTGAGCGACAGGACGACCAGGCGAGGTCCCAAGGCAAGGTACACAGGCAGGAGAGGGTCGATTTAAGCTTGGTCGGTGAGGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGc > 2:882269/1‑150 (MQ=255) gAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTggg > 1:997348/1‑143 (MQ=255) gAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTggg < 2:997348/143‑1 (MQ=255) cGGCGCCCACTTCAGCAACAGGCAGGAAGGGTGCCGTTTCACCGGATGGTACGCGGGCAGGGCAGGGTTGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGgccgcc < 2:1130150/150‑1 (MQ=255) cccACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATAGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCa > 2:720666/1‑150 (MQ=255) cACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAgg > 2:2126044/1‑150 (MQ=255) cACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAgg > 1:1751227/1‑150 (MQ=255) aCTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGc > 2:1575259/1‑150 (MQ=255) ttGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCgg > 2:1017866/1‑150 (MQ=255) aGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTgg > 2:1486028/1‑150 (MQ=255) aGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTgg > 2:1486579/1‑150 (MQ=255) gCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGgc > 1:2334324/1‑150 (MQ=255) cGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATg > 1:269857/1‑129 (MQ=255) cGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATg < 2:269857/129‑1 (MQ=255) caggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGt < 2:1147981/143‑1 (MQ=255) caggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGt > 1:1147981/1‑143 (MQ=255) aggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCa < 1:1701971/150‑1 (MQ=255) aggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCa < 2:582431/150‑1 (MQ=255) aggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCa < 2:1994240/150‑1 (MQ=255) ggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTgg < 1:1101148/117‑1 (MQ=255) ggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTgg > 2:1101148/1‑117 (MQ=255) gcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGc > 1:178796/1‑137 (MQ=255) gcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGc < 2:178796/137‑1 (MQ=255) gcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCaga < 1:1958270/150‑1 (MQ=255) gcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCaga < 1:836615/150‑1 (MQ=255) ggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCa > 1:1914397/1‑150 (MQ=255) gTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGt < 2:438303/150‑1 (MQ=255) aGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGgc > 1:399665/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAGACACCGCAGCGGTG‑CTGGGGcatc < 2:1543559/101‑4 (MQ=37) ggCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAGACACCGCAGCGGTG‑CTGGGGcatc > 1:1543559/1‑98 (MQ=37) gCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCa < 1:1096397/126‑1 (MQ=255) gCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCa > 2:1096397/1‑126 (MQ=255) aaGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCAc > 2:1177749/1‑150 (MQ=255) aGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACt > 2:123518/1‑150 (MQ=255) aGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACt < 1:1017866/150‑1 (MQ=255) gTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGa > 1:1743280/1‑150 (MQ=255) tACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGaa < 1:2126044/150‑1 (MQ=255) ggcagggcagGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCACGCAGAGCATCTGGCTGCGt > 2:430004/1‑130 (MQ=255) ggcagggcagGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCACGCAGAGCATCTGGCTGCGt < 1:430004/130‑1 (MQ=255) agggcagggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGc > 2:2271970/1‑150 (MQ=255) cagggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGAt < 2:1743280/150‑1 (MQ=255) gggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGCTGCGCCAT‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATgc < 2:1271616/150‑1 (MQ=255) ggggCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTc < 1:1575259/150‑1 (MQ=255) ggggCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTc > 1:77346/1‑150 (MQ=255) ggCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGc > 2:708388/1‑138 (MQ=255) ggCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGc < 1:708388/138‑1 (MQ=255) ggCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTcgc > 1:411509/1‑150 (MQ=255) ccAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGGGCATCTGTCTGCGTGCTGGCGCGCTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGa > 1:757660/1‑150 (MQ=255) cAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGaa < 2:760923/150‑1 (MQ=255) tCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCCG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGcc > 1:1023878/1‑150 (MQ=255) tCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATTGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTg > 2:1499699/1‑113 (MQ=255) tCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGcc > 2:98006/1‑150 (MQ=255) tCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCGGGGGCGATTGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTg < 1:1499699/113‑1 (MQ=255) tCAGGGATGCGAGGTATCGCGAACCGCGATGCCCCAG‑CACCGCTTCTGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCtga < 1:1892638/150‑2 (MQ=255) gggATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCa > 2:2232689/1‑150 (MQ=255) ggATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAACCATCTGTGCAt > 2:108050/1‑150 (MQ=255) tGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATggg < 2:234505/150‑1 (MQ=255) tGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACAGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATggg < 2:1751227/150‑1 (MQ=255) gAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTc < 1:2232689/150‑1 (MQ=255) aTCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGt > 1:2255228/1‑150 (MQ=255) cccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGcgagc < 2:2196595/134‑5 (MQ=255) cccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGcgagc > 1:2196595/1‑130 (MQ=255) cccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCcac > 1:143783/1‑150 (MQ=255) ccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCTGATCAGGGGGCGGCCAGATCGGGATCTACCTGCACGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCcaca > 1:1252536/1‑150 (MQ=255) ccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGAGATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCcaca > 1:1601185/1‑150 (MQ=255) cAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGCGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATCCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGCGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCCCAg > 2:1187969/1‑150 (MQ=255) cAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAg < 1:2271970/150‑1 (MQ=255) aCCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCAtgctg < 2:2299002/135‑1 (MQ=255) aCCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCAtgctg > 1:2299002/1‑135 (MQ=255) gcagCGGTG‑CTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCAt > 2:231371/4‑145 (MQ=255) gcagCGGTG‑CTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCAt < 1:231371/142‑1 (MQ=255) tCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGAATTCACGCATa > 2:1143580/1‑150 (MQ=255) | CGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGAATTCACGCATA > NC_002947/3625442‑3625736 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |