| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,868,196 | Δ1 bp | 5.6% | coding (418/1353 nt) | gntT → | D‑gluconate transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,868,196 | 0 | T | . | 5.6% | 215.6 / 7.0 | 71 | coding (418/1353 nt) | gntT | D‑gluconate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/32); new base . (2/2); total (37/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.10e-01 | |||||||||||
CAGATCGCGCAAACCCTCATCCGCGCCTTCGGCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCAAGACCATCTTCTACGGCCTGATC > NC_002947/3868049‑3868342 | cAGATCGCGCAAACCCTCATCCGCGCCTTCGGCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCg < 1:1945031/150‑1 (MQ=255) aTCGCGCAAACCCTCATCCGCGCCTTCGGCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGc > 1:9454/1‑150 (MQ=255) tCGCGCAAACCCTCATCCGCGCCTTCGGCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCg > 2:2253302/1‑150 (MQ=255) gcgcAAACCCTCATCCGCGCCTTCGGCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGTCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGtc < 2:2392003/150‑1 (MQ=255) gcAAACCCTCATCCGCGCCTTCGGCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGtctc > 1:878967/1‑150 (MQ=255) cccTCATCCGCGCCTTCGGCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTgg < 2:1247598/150‑1 (MQ=255) gcgcCTTCGGCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCg < 2:685397/150‑1 (MQ=255) ttCGGCAAGCAGAACGTGCTTTAGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGTGCATCCCTCTGTTCTTTTTTATCGAGTTTGTGCTACTGATACTACTGGTGTTTATCATCGGACG‑TCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGCAAATTGGCAtt > 2:99604/1‑150 (MQ=255) ttCGGCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTGGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCg > 1:869300/1‑145 (MQ=255) ttCGGCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCg < 2:869300/145‑1 (MQ=255) ttCGGCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCAtt < 2:1526266/150‑1 (MQ=255) ttCGGCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCAtt > 1:1358532/1‑150 (MQ=255) gCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCGAGCGC‑CGGGCgacga < 2:1847751/127‑5 (MQ=255) gCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCGAGCGC‑CGGGCgacga > 1:1847751/1‑123 (MQ=255) cAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGACTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCgct > 1:185863/1‑150 (MQ=255) aagaagAACGTGCATTGGGCGATGATGTACGCCGAATTCCTGGTGGGCATCCCGCAGTTCTTGGAAATCGGCTTTGGGCTGCTGAGTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCgctg > 2:276391/1‑150 (MQ=255) gaaCGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGtt > 2:1030975/1‑123 (MQ=255) gaaCGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGtt < 1:1030975/123‑1 (MQ=255) aCGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTggccg < 1:822928/150‑1 (MQ=255) gTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCTGCTGCTggccggc < 2:878967/150‑1 (MQ=255) gTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTggccggc > 2:248925/1‑150 (MQ=255) gCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGt > 1:2026147/1‑145 (MQ=255) gCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGt < 2:2026147/145‑1 (MQ=255) gatgatGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCggtggt < 2:2147141/150‑1 (MQ=255) gatgTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCa > 1:841224/1‑150 (MQ=255) gatgTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCa < 2:841224/150‑1 (MQ=255) atgTTCGCCGTCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCAc < 1:479101/150‑1 (MQ=255) tgTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACg < 1:585727/150‑1 (MQ=255) gTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCACTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACgg > 1:2044769/1‑150 (MQ=255) ccgccTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTgg > 2:977548/1‑150 (MQ=255) cgccTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCg > 1:363474/1‑107 (MQ=255) cgccTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCg < 2:363474/107‑1 (MQ=255) cgccTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑t > 1:799525/1‑150 (MQ=255) cgccTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑t < 2:185863/150‑1 (MQ=255) ttCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCACCGTCGCCCGAGCGC‑CGGGCga < 1:257305/86‑2 (MQ=255) ttCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCACCGTCGCCCGAGCGC‑CGGGCga > 2:257305/1‑85 (MQ=255) ttCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATAGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGcca > 1:2267584/1‑150 (MQ=255) tCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCCCTGGTATTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGTAAATCGGCATTCCGCTGCGGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGccac < 2:559470/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTGCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGccacca < 1:637337/150‑1 (MQ=255) tggGCATCCCGTTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTCCACCTTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACAcc < 1:1835220/150‑1 (MQ=255) ccGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGcccc > 1:958920/1‑150 (MQ=255) cGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTgg > 1:380192/1‑129 (MQ=255) cGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTgg < 2:380192/129‑1 (MQ=255) ttcttcGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTg < 1:977548/150‑1 (MQ=255) ttcGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCA‑GCCAAAGGCGGTCTCGTTGGTGAAAAGCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCg > 1:902907/1‑150 (MQ=255) aaaTCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCg < 2:1358532/150‑1 (MQ=255) tttGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTc > 2:1569535/1‑150 (MQ=255) gtgCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCAc < 1:1716433/150‑1 (MQ=255) tgctgATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTg > 1:1480568/1‑150 (MQ=255) aTTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACAtt < 2:9454/150‑1 (MQ=255) aTTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGAACAATGGGTGGTGCACGGTATGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACAtt > 1:1142770/1‑150 (MQ=255) cACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCATCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATAGGCATTTTCCACGCTGACATTAGCa > 2:423497/1‑150 (MQ=255) cACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCa > 1:1646051/1‑150 (MQ=255) cACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCAGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCa > 2:474610/1‑150 (MQ=255) aCTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCgg > 2:2370354/1‑51 (MQ=255) aCTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCgg < 1:2370354/51‑1 (MQ=255) tGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCAAGa < 1:248925/150‑1 (MQ=255) tGGGGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCAAGa < 1:604555/150‑1 (MQ=255) gtgtTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACAACCGGTCCCCTTGCTGGCGATAGGCGTTTGCCACGCTGACATTGGCAAGAcc > 1:2152923/1‑150 (MQ=255) ttCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCAAGACCAtc > 1:1415265/1‑150 (MQ=255) ttCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCCCCGCGTCAAAAATGGGCAGTCCTCTGCTGGCTGCGCTGTCGGTGGTG‑TGACTATGGCATCGACCACGTGGTGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGATGTTGTTGACAAGACCAtc > 1:2351391/1‑150 (MQ=255) aTCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCAAGACCAtc < 1:2027771/147‑1 (MQ=255) aTCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCAAGACCAtc > 2:2027771/1‑147 (MQ=255) aTCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCACCGTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCAAGACCAtcttc > 1:758102/1‑150 (MQ=255) tcgtcgCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGccac > 1:1926276/1‑87 (MQ=255) tcgtcgCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGccac < 2:1926276/87‑1 (MQ=255) cgtcgCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCAAGACCATCTTCTa < 2:897283/150‑1 (MQ=255) tcgCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCAAGACCATCTTCTACg > 2:1854014/1‑150 (MQ=255) cG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCaa < 2:103631/131‑1 (MQ=255) cG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCaa > 1:103631/1‑131 (MQ=255) cgcTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGTCATTTTCCACGCTGACATTGGCAAGACCATCTTCTACGGCCTGAtc < 1:423497/150‑1 (MQ=255) tCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCa > 2:440207/1‑110 (MQ=255) tCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCa < 1:440207/110‑1 (MQ=255) | CAGATCGCGCAAACCCTCATCCGCGCCTTCGGCAAGAAGAACGTGCATTGGGCGATGATGTTCGCCGCCTTCCTGGTGGGCATCCCGCTGTTCTTCGAAATCGGCTTTGTGCTGCTGATTCCACTGGTGTTCATCGTCGCCCG‑GCGCTCGGGCGTCTCGTTGGTGAAAATCGGCATTCCGCTGCTGGCCGGCCTGTCGGTGGTGCACGGTCTGG‑TGCCACCACACCCGGGCCCCTTGCTGGCGATCGGCATTTTCCACGCTGACATTGGCAAGACCATCTTCTACGGCCTGATC > NC_002947/3868049‑3868342 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |