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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,995,569 | 0 | C | . | 6.4% | 350.7 / 17.7 | 109 | coding (1185/1272 nt) | bkdB | branched‑chain alpha‑keto acid dehydrogenase complex lipoamide acyltransferase |
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Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GCGCCCTGGGTGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTATGTA > NC_002947/4995421‑4995718 | gcgcCCTGGGTGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGaccacc < 1:1313939/150‑1 (MQ=255) gcCCTGGGTGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACcgc > 2:927293/1‑150 (MQ=255) ccTGGGTGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGC‑Gt < 2:1431619/150‑1 (MQ=255) 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atgatgAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGa < 2:1120103/129‑1 (MQ=255) tgatgaACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAAATGATCCAGACTACCCTGTTGat > 2:1947201/1‑150 (MQ=255) tgaACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGatcat > 1:1610152/1‑150 (MQ=255) aaCCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATcg < 1:1776222/150‑1 (MQ=255) aCCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATcgg > 2:370287/1‑150 (MQ=255) ccTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGt > 2:1617895/1‑53 (MQ=255) ccTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGt < 1:1617895/53‑1 (MQ=255) cTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATcggcg > 1:1609217/1‑150 (MQ=255) tGTCCAGCTCGTTCGACCACCGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATcggcgg < 2:1813437/150‑1 (MQ=255) tCGTTCGACCACCGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCGGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTg > 2:575627/1‑150 (MQ=255) catCGACCA‑CGCGGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGa > 1:1807207/3‑93 (MQ=255) catCGACCA‑CGCGGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGa < 2:1807207/91‑1 (MQ=255) ttCGACCACCGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTggcg > 1:1177731/1‑150 (MQ=255) atCGACCA‑CGCGGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTggcg > 1:2361536/2‑150 (MQ=255) atCGACCA‑CGCGGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTggcg > 1:2124061/2‑150 (MQ=255) ccaccGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACa > 2:1944591/1‑101 (MQ=255) ccaccGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACa < 1:1944591/101‑1 (MQ=255) ccaccGC‑CTGCTCGATAGCATGGATGCCGCCTTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCGCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGTATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTAt < 1:863530/150‑1 (MQ=255) ccGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTATGTa < 2:1672318/150‑1 (MQ=255) | GCGCCCTGGGTGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGC‑GTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTATGTA > NC_002947/4995421‑4995718 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |