Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,736,589 | Δ1 bp | 6.2% | coding (913/1674 nt) | hutU ← | urocanate hydratase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,736,589 | 0 | C | . | 6.2% | 310.4 / 14.4 | 97 | coding (913/1674 nt) | hutU | urocanate hydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/45); new base . (3/3); total (49/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.19e-01 |
ACAGTGGGCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCATGTCCGGGCGGAC > NC_002947/5736442‑5736736 | aCAGTGGGCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACgg < 1:1991829/150‑1 (MQ=255) tGGGCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCAt > 2:1099405/1‑150 (MQ=255) gCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGa < 1:1902910/150‑1 (MQ=255) ggATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACt < 2:888679/150‑1 (MQ=255) ggATGGAGGCCGGGACCAAGCCCGGGAAGTCGAAGGCAGTGGCCACGCCCTCCTCCTGGGCCATCTGCCGGATGTTTGTGCCGTAAGCGAAGCTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCCGGGCACGTGCA‑GGCCAtgctgg < 2:327720/150‑6 (MQ=255) aTGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGc > 2:2376620/1‑150 (MQ=255) tGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCt < 1:1984144/150‑1 (MQ=255) ccGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCAtgctg > 2:1258496/1‑136 (MQ=255) ccGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCAtgctg < 1:1258496/140‑5 (MQ=255) gggACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGcc > 1:2094975/1‑150 (MQ=255) gAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGAc > 1:2312911/1‑150 (MQ=255) cTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTg > 1:1040580/1‑150 (MQ=255) aaGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGcc < 2:1624614/150‑1 (MQ=255) tCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGAc > 1:302011/1‑137 (MQ=255) tCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGAc < 2:302011/137‑1 (MQ=255) aaGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGcc < 1:672754/129‑1 (MQ=255) aaGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGcc > 2:672754/1‑129 (MQ=255) aGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCa > 2:848143/1‑140 (MQ=255) aGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCa < 1:848143/140‑1 (MQ=255) ggCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGt < 1:1628896/150‑1 (MQ=255) aTTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAg > 2:2237628/1‑137 (MQ=255) aTTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAg < 1:2237628/137‑1 (MQ=255) aTTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGGCCGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGAAAGGCAAACCACTGCTTGGCGGCGTAGGGCACTCCAGTCGGTTCGGTCTg > 2:22057/1‑150 (MQ=255) ttGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTgc > 2:2247520/1‑150 (MQ=255) ttGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTgc < 1:2376620/150‑1 (MQ=255) cACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACg > 1:1560773/1‑150 (MQ=255) ctcctcctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGAc < 2:778499/117‑1 (MQ=255) ctcctcctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGAc > 1:778499/1‑117 (MQ=255) tcctcctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAACATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCgg < 1:761820/150‑1 (MQ=255) ctcctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTa > 1:667859/1‑150 (MQ=255) tcctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTAc < 1:2247520/150‑1 (MQ=255) cctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACt > 1:1015642/1‑150 (MQ=255) ctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCAtg < 1:775324/91‑2 (MQ=39) ctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCAtg > 2:775324/1‑90 (MQ=39) ctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGGGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTg > 2:1613103/1‑150 (MQ=255) ctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCgg > 2:342793/1‑145 (MQ=255) ctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCgg < 1:342793/145‑1 (MQ=255) ctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATAGAAGGTCGGGATGCACTGCTTATGGAAGTCCAACATGACC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTACATGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTACGGTCTGCGCACGATAGCGGTACTg > 2:992224/1‑150 (MQ=255) gCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATTGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTcc < 1:629348/150‑1 (MQ=255) aTCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAg < 2:2312911/150‑1 (MQ=255) aTCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAg < 2:667859/150‑1 (MQ=255) aTCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATCTCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAg < 1:22057/150‑1 (MQ=255) tGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATCCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTc < 2:1291756/150‑1 (MQ=255) gCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCa < 2:932582/144‑1 (MQ=255) gCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCa > 1:932582/1‑144 (MQ=255) ggATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGc < 1:1285403/150‑1 (MQ=255) ttgCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGc < 1:1230196/150‑1 (MQ=255) tgCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCa < 2:1015642/150‑1 (MQ=255) cGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGt > 1:1585154/1‑150 (MQ=255) aTCGAAGGTCGGGATGTCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGcc < 2:613386/150‑1 (MQ=255) tCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTggcg > 1:1579024/1‑72 (MQ=255) tCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTggcg < 2:1579024/72‑1 (MQ=255) tCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCg > 1:485058/1‑150 (MQ=255) cGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAg > 2:2171116/1‑125 (MQ=255) cGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAg < 1:2171116/125‑1 (MQ=255) gAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGtt < 2:1585154/150‑1 (MQ=255) gAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGtt > 1:771062/1‑150 (MQ=255) gggATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTggg < 2:2199295/150‑1 (MQ=255) gggATACCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTggg > 2:2058077/1‑150 (MQ=255) ggATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCATGTGCACGGCCATc < 1:2394011/50‑1 (MQ=255) ggATGCCCTGATTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCATGTGCACGGCCATc > 2:2394011/1‑50 (MQ=38) tGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTcc < 2:2158730/110‑1 (MQ=255) tGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTcc > 1:2158730/1‑110 (MQ=255) tGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGt < 2:2094975/150‑1 (MQ=255) cccTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGtt < 2:1711403/106‑1 (MQ=255) cccTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGtt > 1:1711403/1‑106 (MQ=255) ccTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCt < 1:665431/122‑1 (MQ=255) ccTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCt > 2:665431/1‑122 (MQ=255) ccTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGt > 2:80326/1‑144 (MQ=255) ccTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTggg > 2:1777248/1‑150 (MQ=255) ccTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTggg > 2:623934/1‑150 (MQ=255) ccTGCTTCTGGAAGCCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGt < 1:80326/144‑1 (MQ=255) cTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGgc > 2:1913121/1‑150 (MQ=255) cTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGgc > 2:376755/1‑150 (MQ=255) tGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGgcg > 2:1685913/1‑150 (MQ=255) cTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGct > 2:1139286/1‑150 (MQ=255) tGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGcc < 2:192713/125‑1 (MQ=255) tGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGcc > 1:192713/1‑125 (MQ=255) tGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCa > 1:1085717/1‑130 (MQ=255) tGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCa < 2:1085717/130‑1 (MQ=255) gAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGAc > 2:326176/1‑54 (MQ=255) gAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGAc < 1:326176/54‑1 (MQ=255) gTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCtggtctggtc < 1:1139286/150‑1 (MQ=255) tCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTg < 1:1681669/134‑1 (MQ=255) tCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTg > 2:1681669/1‑134 (MQ=255) cAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATc > 1:1000589/1‑78 (MQ=255) cAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATc < 2:1000589/78‑1 (MQ=255) cAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTggg > 2:1406490/1‑127 (MQ=255) cAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTggg < 1:1406490/127‑1 (MQ=255) cAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTCCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCtggtctggtcacc > 1:1897244/1‑147 (MQ=255) tcgaTGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGTTACTGTTCCCAGGTCAAGCCGGATGGACTGAAGCCCGTCATTTGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTg > 1:2340172/4‑150 (MQ=255) cATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTgg > 2:1577855/1‑123 (MQ=255) cATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTgg < 1:1577855/123‑1 (MQ=255) cATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTg > 1:1980360/1‑129 (MQ=255) cATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTg < 2:1980360/129‑1 (MQ=255) ggCC‑TGCACGTGCACGCTCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCAt < 2:751529/150‑1 (MQ=255) c‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCATGTc > 1:829199/1‑150 (MQ=255) cacgtgcacgGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGCCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCATGTCCgg > 1:1221253/1‑150 (MQ=255) cacgGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCATGTCCGGGCGGAc < 1:623934/150‑1 (MQ=255) | ACAGTGGGCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCATGTCCGGGCGGAC > NC_002947/5736442‑5736736 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |