| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,913,680 | Δ1 bp | 7.2% | coding (893/1377 nt) | spuI → | glutamylpolyamine synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,913,680 | 0 | G | . | 7.2% | 201.0 / 10.0 | 69 | coding (893/1377 nt) | spuI | glutamylpolyamine synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/29); new base . (3/2); total (37/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 | |||||||||||
AAATGGACACCACCTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTACGCGTAC > NC_002947/5913533‑5913820 | aaaTGGACACCACCTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTcggcg > 1:1517794/1‑150 (MQ=255) aTGGACACCACCTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGgt < 2:576242/150‑1 (MQ=255) aTGGACACCACCTTCATGGCCAAGCCATATCCGCGCCCGGTAGGCCTTGGTCTGCACGTCGACAGTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCCTCACCCGCGCGCATCCCGAGCCGCAAGCAGCGTGACGTCACGCTGTCggtggt < 2:530652/150‑1 (MQ=19) caccTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGAGCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCCCGCTGTCGCCGGTGTGGTCga > 2:272658/1‑150 (MQ=255) ccTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCgaga > 2:858419/1‑150 (MQ=255) cTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTTCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGAc > 1:1807976/1‑150 (MQ=255) ttCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGAcc < 2:1721600/150‑1 (MQ=255) cATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCt < 1:858419/150‑1 (MQ=255) tGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGc > 2:857719/1‑150 (MQ=255) gCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGATCCTGccc > 2:1976270/1‑150 (MQ=255) cccTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTcc > 2:2247971/1‑150 (MQ=255) tCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGc < 1:857719/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGccttcc < 2:823904/150‑1 (MQ=255) gCCACGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCGGAACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGccttcc < 1:755849/150‑1 (MQ=255) acaggcagaCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGccttcct > 2:2333331/2‑150 (MQ=255) aggcaggcAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTC‑‑CGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGc < 2:2214799/150‑1 (MQ=255) gcaggcaACGGAATACACGTGCACATGTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGc > 2:1955577/1‑150 (MQ=255) ggcaACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATg > 1:1541541/1‑135 (MQ=255) ggcaACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATg < 2:1541541/135‑1 (MQ=255) gcaACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTATCCCGa > 2:137340/1‑150 (MQ=255) aaCGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAAc < 2:1694828/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCAAGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGGCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTc < 1:272658/150‑1 (MQ=255) tGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCCAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTTGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑t > 1:1071165/1‑150 (MQ=255) aCGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTg < 2:621965/133‑1 (MQ=255) aCGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTg > 1:621965/1‑133 (MQ=255) gCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTGAGGGTCGGTGTCGGCGGTGTGCTCCAGAACCAGCCCGAGGCCAGGGTCGTCCTTTGCCCGATCGTCAA‑C‑ACGTAccg > 1:540593/1‑150 (MQ=255) gCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTAccg > 1:487303/1‑150 (MQ=255) cacaTTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATgg < 1:270726/118‑1 (MQ=255) cacaTTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATgg > 2:270726/1‑118 (MQ=255) aTTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCaa > 1:583021/1‑137 (MQ=255) aTTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCaa < 2:583021/137‑1 (MQ=255) cGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCACGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTgg < 2:1418/150‑1 (MQ=255) tGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGgt < 1:911272/77‑1 (MQ=255) tGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGgt > 2:911272/1‑77 (MQ=255) tGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGgcgcgc > 2:1927346/1‑150 (MQ=255) ggACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGATCCTGCCCGCGTCCACGGCCTTCCTTTGCTCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCa < 1:1976270/150‑1 (MQ=255) gACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAg > 1:1514123/1‑150 (MQ=255) aaaGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGaa < 1:985567/116‑1 (MQ=255) aaaGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGaa > 2:985567/1‑116 (MQ=255) aTGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACg > 2:797452/1‑150 (MQ=255) tGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGt < 2:143036/150‑1 (MQ=255) caacaaCATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCa > 1:559785/1‑138 (MQ=255) caacaaCATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCa < 2:559785/138‑1 (MQ=255) aacaTCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTC‑‑CGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAAcgc > 1:1424366/1‑150 (MQ=255) tCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCttt < 2:685977/93‑1 (MQ=255) tCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCttt > 1:685977/1‑93 (MQ=255) tCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCaa < 1:1313769/150‑1 (MQ=255) cACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAg > 1:231203/1‑150 (MQ=255) cACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAg > 1:883616/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACCAGCAAAGCTg > 2:261681/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTC‑‑CGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTggg > 1:1656112/1‑150 (MQ=255) aGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTgg < 2:487303/150‑1 (MQ=255) gAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTC‑‑CGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCt > 1:1343092/1‑150 (MQ=255) gATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTg < 1:1090648/150‑1 (MQ=255) aTCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGTCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTgg > 1:1998314/1‑150 (MQ=255) tCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGa > 2:2161148/1‑150 (MQ=255) tCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGa < 2:1377183/150‑1 (MQ=255) gcccGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGGGCCGAACGCGCCACGCTGGGGCCTggg > 1:1787891/2‑149 (MQ=255) ccGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTggg < 2:2403726/141‑1 (MQ=255) ccGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTggg > 1:2403726/1‑141 (MQ=255) gAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAAc < 1:1927346/150‑1 (MQ=255) aGCAGAACGCCCCGCTACATCACGCTGCCGTCGCTGTGCTGCAGACCCTGCCCGCGGCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAAcc < 2:1230509/150‑1 (MQ=25) aGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCa < 1:2161148/150‑1 (MQ=255) aGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCa < 2:1807976/150‑1 (MQ=255) gcTCCGTCACGATGTC‑‑CAGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTAc < 2:1343092/150‑1 (MQ=25) tACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTAc > 2:988423/1‑150 (MQ=255) tACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTAc < 1:988423/150‑1 (MQ=255) tACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTAc > 1:1127198/1‑150 (MQ=255) tACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAA‑‑ACAATCAGCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTAc < 1:1955577/150‑1 (MQ=37) gTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTAcgcg > 1:2175903/1‑150 (MQ=255) aCGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTACGCGTac > 1:894114/1‑150 (MQ=255) | AAATGGACACCACCTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAA‑C‑TCGTACCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTACGCGTAC > NC_002947/5913533‑5913820 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |